در هنگام جستجو کلمه در قسمت عنوان میتوانید کلمات مورد جستجو را با کاراکتر (-) جدا کنید.
کاربرد نوع شرط:
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: Iranian Journal of Veterinary Research
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: Backyard chickens,resistance genes,Salmonella Infantis
- چکیده: هدف از این مطالعه شناسایی مولکولی سالمونلا اینفنتیس جدا شده از طیور بومی و تعیین ژنهای مقاومت آنتی بیوتیکی آنها به روش واکنش زنجیرهای پلیمراز میباشد. در این مطالعه 46 نمونه سالمونلا که از طیور بومی استان مازندران جدا گردیده بود، مورد مطالعه قرار گرفت. ابتدا آزمایش سروتایپینگ نمونهها با استفاده از آنتی سرمهای O و H صورت گرفت. سپس سرووار سالمونلاهای سروتایپ شده با روش واکنش زنجیرهای پلیمراز تایید شد. روش استاندارد دیسک دیفوزیون برای تعیین حساسیت جدایهها نسبت به 13 عامل ضد میکروبی انجام گردید. از مجموع 46 نمونه جمعآوری شده، با استفاده از روش سروتایپینگ 44 نمونه به عنوان سالمونلا تایید شدند. تمامی 44 جدایه سالمونلا در این روش، به گروه سرمی C1 و سرووار اینفنتیس تعلق داشتند. سرووار این جدایهها، با روش واکنش زنجیرهای پلیمراز، به عنوان سرووار اینفنتیس تایید شدند. در این آزمون تمامی نمونهها به آنتی بیوتیکهای تتراسایکلین و داکسی سایکلین و بیش از 70% نمونهها به آنتی بیوتیکهای کلرامفنیکل و فلورفنیکل مقاومت نشان دادند. آزمون واکنش زنجیرهای پلیمراز جهت تعیین ژنهای مقاومت، انجام گردید. در این مطالعه از ژنهای floR، catI جهت تعیین ژنهای مقاومت به فلورفنیکل و کلرامفنیکل و از ژنهای tetA و tetG جهت تعیین ژن مقاومت به تتراسایکلین استفاده شد. تمامی نمونههای مقاوم به فلورفنیکل و کلرامفنیکل، دارای ژنهای floR و cat بودند. هیچکدام از نمونههای مقاوم به تتراسایکلین دارای ژن tetA یا tetG نبودند. واکنش زنجیرهای پلیمراز از پرگنه و کشت در محیط آنتی بیوتیکدار به طور همزمان انجام گردید و تمامی نمونههای دارای ژن مقاومت روی محیطهای آنتی بیوتیکدار قادر به رشد بودند.
- چکیده انگلیسی: This study aims at molecular identification of Salmonella Infantis isolated from backyard chickens and the detection of their antibiotic resistance genes. A total of 46 Salmonella-suspected samples isolated from backyard chickens of northern Iran were collected. Serotyping was done by the traditional method and then confirmed by PCR. Antimicrobial susceptibility of the isolates against 13 antimicrobial agents was determined by the standard disk diffusion method. There were 44 samples identified as Salmonella. Serotyping results showed that all 44 isolates belonged to serogroup C1 and serovar Infantis. The most resistance observed was to tetracycline and doxycycline (100%), chloramphenicol (79%) and florfenicol (72%). The floR, catI, tetA and tetG genes were used for the detection of florfenicol chloramphenicol and tetracycline resistance. In order to identify the phenotypic resistance in strains which showed resistance genes by PCR, colony PCR and culture on plates each containing antibiotic was performed simultaneously. All the Salmonella Infantis resistant to florfenicol and chloramphenicol harbored floR and catI. None of the Salmonella resistant to tetracycline carried tetA or tetG. The result of colony PCR and culture in antibiotic medium confirmed the
results of PCR and indicated phenotypic resistance in these samples.- انتشار مقاله: 16-07-1393
- نویسندگان: A. Ghoddusi,B. Nayeri Fasaei,V. Karimi,I. Ashrafi Tamai,Z. Moulana,T. Zahraei Salehi
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: Iranian Journal of Veterinary Research
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: Backyard chickens,resistance genes,Salmonella Infantis
- چکیده: هدف از این مطالعه شناسایی مولکولی سالمونلا اینفنتیس جدا شده از طیور بومی و تعیین ژنهای مقاومت آنتی بیوتیکی آنها به روش واکنش زنجیرهای پلیمراز میباشد. در این مطالعه 46 نمونه سالمونلا که از طیور بومی استان مازندران جدا گردیده بود، مورد مطالعه قرار گرفت. ابتدا آزمایش سروتایپینگ نمونهها با استفاده از آنتی سرمهای O و H صورت گرفت. سپس سرووار سالمونلاهای سروتایپ شده با روش واکنش زنجیرهای پلیمراز تایید شد. روش استاندارد دیسک دیفوزیون برای تعیین حساسیت جدایهها نسبت به 13 عامل ضد میکروبی انجام گردید. از مجموع 46 نمونه جمعآوری شده، با استفاده از روش سروتایپینگ 44 نمونه به عنوان سالمونلا تایید شدند. تمامی 44 جدایه سالمونلا در این روش، به گروه سرمی C1 و سرووار اینفنتیس تعلق داشتند. سرووار این جدایهها، با روش واکنش زنجیرهای پلیمراز، به عنوان سرووار اینفنتیس تایید شدند. در این آزمون تمامی نمونهها به آنتی بیوتیکهای تتراسایکلین و داکسی سایکلین و بیش از 70% نمونهها به آنتی بیوتیکهای کلرامفنیکل و فلورفنیکل مقاومت نشان دادند. آزمون واکنش زنجیرهای پلیمراز جهت تعیین ژنهای مقاومت، انجام گردید. در این مطالعه از ژنهای floR، catI جهت تعیین ژنهای مقاومت به فلورفنیکل و کلرامفنیکل و از ژنهای tetA و tetG جهت تعیین ژن مقاومت به تتراسایکلین استفاده شد. تمامی نمونههای مقاوم به فلورفنیکل و کلرامفنیکل، دارای ژنهای floR و cat بودند. هیچکدام از نمونههای مقاوم به تتراسایکلین دارای ژن tetA یا tetG نبودند. واکنش زنجیرهای پلیمراز از پرگنه و کشت در محیط آنتی بیوتیکدار به طور همزمان انجام گردید و تمامی نمونههای دارای ژن مقاومت روی محیطهای آنتی بیوتیکدار قادر به رشد بودند.
- چکیده انگلیسی: This study aims at molecular identification of Salmonella Infantis isolated from backyard chickens and the detection of their antibiotic resistance genes. A total of 46 Salmonella-suspected samples isolated from backyard chickens of northern Iran were collected. Serotyping was done by the traditional method and then confirmed by PCR. Antimicrobial susceptibility of the isolates against 13 antimicrobial agents was determined by the standard disk diffusion method. There were 44 samples identified as Salmonella. Serotyping results showed that all 44 isolates belonged to serogroup C1 and serovar Infantis. The most resistance observed was to tetracycline and doxycycline (100%), chloramphenicol (79%) and florfenicol (72%). The floR, catI, tetA and tetG genes were used for the detection of florfenicol chloramphenicol and tetracycline resistance. In order to identify the phenotypic resistance in strains which showed resistance genes by PCR, colony PCR and culture on plates each containing antibiotic was performed simultaneously. All the Salmonella Infantis resistant to florfenicol and chloramphenicol harbored floR and catI. None of the Salmonella resistant to tetracycline carried tetA or tetG. The result of colony PCR and culture in antibiotic medium confirmed the
results of PCR and indicated phenotypic resistance in these samples.- انتشار مقاله: 16-07-1393
- نویسندگان: A. Ghoddusi,B. Nayeri Fasaei,V. Karimi,I. Ashrafi Tamai,Z. Moulana,T. Zahraei Salehi
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: Iranian Journal of Veterinary Research
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: Avian Influenza,Phylogenetic analysis,H9N2,PB2
- چکیده:
پروتئین PB2 ویروسهای آنفلوانزای A نقش مهمی در تعیین طیف میزبانی آنها دارد. در این مطالعه بخشی از ژن PB2 ویروسهای آنفلوانزای H9N2 جدا شده از جوجه مرغهای تجاری در استان تهران تکثیر و توالی نوکلئوتیدی و اسید آمینهای آنها تعیین گردیدند. تجزیه و تحلیل و مطالعه شجرهشناسی این توالیها و مقایسه آنها با برخی توالیهای موجود در بانک جهانی ژن از ویروسهای H9N2 انجام گردید. مطالعه شجرهشناسی به روی توالیهای ژن PB2 استفاده شده در این مطالعه نشان میدهد که جدایههای H9N2 ایران را میتوان در دودمان اروپایی-آسیایی طبقهبندی نمود؛ همان طوری که بر اساس نتایج حاصل از مطالعههای انجام شده به روی ژن HA نیز مشخص شده است. در پروتئین PB2 جدایههای H9N2 ایران در این مطالعه در محل 621 گلوتامیک اسید، در 701 آسپارتیک اسید و در 714 سرین قرار دارد. وضعیت مشابهی در مورد تحت تیپهای مختلف جدا شده از گونههای پرندگان در سطح دنیا نشان داده شده است. منشاء ژن PB2 جدایههای ایرانی متفاوت از امارات متحده عربی، پاکستان، عربستان سعودی (کشورهای خاورمیانه) و هند میباشد و احتمال دارد که اجداد ایزولههای H9N2 ایرانی دچار بازآرایی با سایر تحت تیپها شده باشند. توالی نوکلئوتیدی ژن PB2 این پنج جدایه ایرانی تشابه بالایی در حدود 5/97% تا 6/99% با یکدیگر دارند که نشان میدهد طی سالهای 1998 تا 2001 جهشهای بسیار کمی در آنها رخ داده است. مطالعه ژن PB2 در جدایههای سالهای اخیر از سایر استانها جهت بررسی تغییرات ممکن در آن و نیز مطالعه بیماریزایی جدایههای ایرانی در میزبان پستاندار قابل توصیه میباشد.
- چکیده انگلیسی:
The PB2 protein of influenza A viruses has been shown as host range determinant. In this study PB2
gene of five H9N2 isolates from Tehran province during the period of 1998-2001 were partially amplified
and sequenced to do phylogenetic study. Iranian isolates could be classified in Eurasian lineage according to
their PB2 gene sequences. The PB2 genes of these isolates are different from those of Middle-East countries
such as the UAE, Pakistan and Saudi Arabia, as well as India, and it is probable that their ancestors have
undergone reassortment with other subtypes. The Nucleotide sequences of their PB2 are highly similar to
each other with 97.5-99.6% homology percentage showing the least mutations in their genes during the
period of 1998 to 2001. The PB2 of the Iranian isolates contain Glutamic acid-(E) in position 627, Aspartic
acid-(D) in 701 and Serine-(S) in 714 as other avian isolates.- انتشار مقاله: 20-07-1389
- نویسندگان: J Pazani,V. Karimi,M. H. Bozorgmehri Fard,A. Ghalyanchi Langeroudi,A. Barin
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: Iranian Journal of Veterinary Research
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: PCR,Colibacillosis,Drinking Water,Qom province,Poultry farms
- چکیده:
یکی از عفونتهای خطرناک طیور که خسارت زیادی به اقتصاد مرغداران و نهایتا کشور وارد میکند کلی باسیلوز است. عامل ایجاد کلی باسیلوز، اشریشیا کلی است که از طریق آب، دان، هوای آلوده، وسایل پرورشی آلوده و یا از مادر به تخم مرغ و نهایتا جوجه منتقل میشود. از آنجایی که آب یکی از راههای انتقال آلودگی به جوجهها بوده در این تحقیق سعی شد تا احتمال ارتباط آلودگی آب با وقوع کلی باسیلوز در استان قم مورد بررسی قرار گیرد که توسط مواردی از جمله جداسازی اشریشیا کلی از آب و لاشههای مرغان مبتلا به کلی باسیلوز، PCR، تعیین سروتیپ جدایههای اشریشیا کلی و آنتیبیوگرام آنها احتمال این ارتباط برقرار گردید. جهت انجام این مطالعه، نمونهبرداری به صورت تصادفی از آب 70 مرغداری انجام شد و کشت آنها در محیطهای مربوطه صورت گرفت. طبق نتایج حاصله 13 مرغداری (57/18%) آلوده به اشریشیا کلی بودند. از لاشههای مرغان مبتلا به کلی باسیلوز در مرغداریهایی که آلودگی به اشریشیا کلی در آب آنها محرز شده بود نیز نمونهگیری به عمل آمد و 13 جدایه اشریشیا کلی از آنها به دست آمد. PCR کلیه جدایهها انجام گرفت. یک نمونه هم در آب و هم در لاشه طیور از نظر ژنهای حدت espB، stx2 و eae، یک نمونه از نظر ژنهای stx1 و stx2 و 5 نمونه نیز از نظر stx1 مشابه بودند. دو نمونه اشریشیا کلی هم در آب و هم در لاشه از نظر سروتیپ، O2 بودند و تمامی نمونهها هم در آب و هم در لاشه نسبت به آنتیبیوتیک تتراسیکلین بیشترین مقاومت و نسبت به لینکواسپکتین بیشترین حساسیت را نشان دادند. طبق این بررسی مشخص شد که احتمال وقوع کلی باسیلوز با منشاء آب آلوده در استان قم وجود دارد.
- چکیده انگلیسی:
Seventy poultry farms’ drinking water was tested for Escherichia coli contamination in Qom province in
Iran. The cases of colibacillosis from positive farms were also collected and tested. The isolates were
examined for serotype, detection of virulence genes by multiplex PCR and antibiotic resistance. Thirty
poultry farm water samples were E. coli positive (18.57%), although 13 E. coli isolates were recovered from
carcasses of related farms. The isolates belonged to O2 serogroup and one O157, with approximately 29% of the strains being non-typeable. Two isolates from water and carcasses were serotyped O2 and one sample serotyped O157, which needs to be further studied. The PCR method was on the basis of showing virulence genes of espB, stx1, stx2 and eae. One sample from water and one from a carcass were shared espB, stx2 and eae genes. Stx1 and stx2 genes were common in a sample from both water and carcass, although five samples from both water and carcass shared a stx1 gene as well. All isolates showed maximum sensitivity and resistance to lincospectine and tetracycline, respectively.- انتشار مقاله: 09-06-1389
- نویسندگان: V. Karimi,T. Zahraei Salehi,M. Sadegh,S. Jaafarnejad
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: Archives of Razi Institute
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: Phylogenetic analysis,live bird market,Backyard poultry,Avian Infectious bronchitis,Gilan Province
- چکیده:
- چکیده انگلیسی: Coronaviruses (AvCoV) which include infectious bronchitis virus (IBV) and other bird coronaviruses belong to the genus gammacoronavirus, subfamily Coronavirinae. One of the most prominent representatives of gammacoronavirus genus is infectious bronchitis virus (IBV) which is a highly contagious viral pathogen of chickens causing considerable economic losses to the poultry industry. IBVs mostly affect the respiratory, urinary, and reproductive tracts leading to a substantial drop in production. Backyard poultry in the villages usually share their food and water with free flight birds which puts them at serious risk of disease transmission. Furthermore, the poor hygienic measurements which are often used in backyard flocks make them a potential reservoir for diseases that can be transferred to commercial poultry flocks. Live bird markets (LBMs) which receive live poultry to be resold or slaughtered and sold onsite play a significant role in spreading infectious diseases among the different bird species. In the present study, a number of 354 cloacal swab samples were collected from different bird species from LBMs of Gilan province. Subsequently, after RNA extraction, reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) technique was carried out using specific primers of S1 gene to detect coronavirus infectious bronchitis virus. Two samples from backyard chickens were reported to be positive to coronavirus which were named Iran/Backyardchicken96/2017 and Iran/Backyardchicken94/2017. The results of the phylogenetic analysis demonstrated that these two isolates are placed in QX and IS-1494 strains, respectively. On a final note, the obtained results highlighted the role of live birds offered in LBMs in the epidemiology of IBV and the transmission of the virus to the industrial flock.
- انتشار مقاله: 07-05-1397
- نویسندگان: H. Rezaee,A. Ghalyanchilangeroudi,V. Karimi,M. H. Fallah Mehrabadi,P. Motamed Chaboki,A. Shayganmehr,R. Esmaeelzadeh Dizaji
- مشاهده