در هنگام جستجو کلمه در قسمت عنوان میتوانید کلمات مورد جستجو را با کاراکتر (-) جدا کنید.
کاربرد نوع شرط:
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: Journal of Medicinal plants and By-product
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: Cloning,Portulaca oleracea,Sequence analysis,Tyrosinase,Tyrosine decarboxylase
- چکیده:
- چکیده انگلیسی: Dopamine is one of the important medications of Portulaca oleracea L. To optimize the production of dopamine, one of the methods is the identification and engineering of metabolite pathways. To investigate the tyrosine decarboxylase (TDC) and tyrosinase, which seem to be the most important genes in dopamine synthesis pathway, hairy roots were produced from Portulaca oleracea using Agrobacterium rhizogenes and total RNA was extracted from hairy roots. A cDNA library was synthesized using RT-PCR. Then, the twogenes were amplified, isolated and cloned in a pTG 19-T vector. Bioinformatics' databases were used to predict the details of the structural, functional and biological characteristic of these genes. Nucleotide sequence analysis revealed that the cloned cDNAs expressed TDC and tyrosinase, and contained a single open reading frame of 1800 bp and 1750 bp, respectively. TDC has the most similarity with TDC of Arabidopsis thaliana (L.) Heynh.,but tyrosinase has 98% similarity withtyrosinase of Agaricus bisporus. Because of More negatively charged amino acids the TDC has hydrophobic properties, therefore affinity and hydrophilic chromatography can be used for purification of TDC. But tyrosinase has hydrophilic properties and hydrophobicity chromatography can be used for its purification. There were two peroxisomal signal peptide (KLAKEFEQL) and (KIEGRPLHL) in the TDC and tyrosinase, respectively. Therefore, they are biologically active in the peroxisomes, and included in biosynthesis dopamine through the transformation of L-lysine to L-dopa and finally to the dopamine. In conclusion, increasing the expression of TDC and tyrosinase through the genetic engineering can increase dopamine production in the Portolaca.
- انتشار مقاله: 01-10-1396
- نویسندگان: Somayeh Babashpour,Khosro Piri,Haidar Saify Nabiabad,Farzaneh Sabouni
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: Iranian Journal of Genetics and Plant Breeding
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: ISSR,comparative analysis,Pythium aphanidermatum,Repetitive element-PCR
- چکیده: 60 جدایه Pythium aphanidermatum، عامل پوسیدگی ریشه چغندرقند، بر اساس منشاء جغرافیایی برای مطالعات تنوع ژنتیکی و مورفولوژیکی انتخاب شدند. آزمون بیماریزایی با استفاده از آنالیز کروسکال والیس اختلاف معنیداری بین جدایهها از لحاظ قدرت بیماریزایی نشان داد. جدایهها براساس سرعت رشد به دو گروه با میزان رشد بالا و میزان رشد پایین گروهبندی شدند. به منظور بررسی پتانسیل انگشت نگاری ISSR و rep-PCR از هشت آغازگر ISSR و سه آغازگر rep-PCR استفاده شد. همبستگی خطی بسیار بالایی بین قدرت تفکیک، PIC و MI هر آغازگر مشاهده شد. شاخص PIC برای آغازگرهای rep-PCR (41/0) بالاتر از آغازگرهای ISSR (39/0) بود. براساس روش UPGMA و ضریب جاکارد، ISSR جدایههای استانهای خوزستان و فارس را در سطح تشابه 63% از بقیه استانها جدا کرد، درحالیکه rep-PCR این جدایهها را در سطح تشابه %61 از بقیه استانها جدا کرد. آنالیز PCA نشان داد که باوجود تشابههای هر دو نشانگر، rep-PCR قدرت تفکیک بالاتری نسبت به ISSR نشان داد. بنابراین نشانگر rep-PCR منجر به تفکیک بیشتر جدایهها شد. بین تنوع ژنتیکی و منشاء جغرافیایی جدایهها ارتباط وجود دارد. در مطالعات تنوع ژنتیکی، Rep-PCR به دلیل داشتن دقت مقایسهای در تفسیر تنوع ژنتیکی جدایهها، میتواند جایگزین ISSR شود.
- چکیده انگلیسی: Sixty isolates of Pythium aphanidermatum as the causal agent of sugar beet root rot were selected on the basis of their geographical origins, morphological and genetic diversity studies. Pathogenicity test using the Kruskal-Wallis analysis showed significant differences between the pathogenic potential of isolates. Based on the growth rate, isolates were categorized in two groups with low and high growth rate. The potential of ISSR and rep-PCR for fingerprinting purposes was evaluated using eight ISSR and three rep-PCR primers. A strong linear relationship was observed between resolving power of a primer, PIC, and MI. PIC value for the rep-PCR primers (0.41) was higher than the ISSR primers (0.39). Based on UPGMA method and Jaccard's coefficient, ISSR separated Khuzestan and Fars provinces isolates from other isolates at 63% similarity level, while rep-PCR separated these isolates at 61% similarity level. The PCA analysis showed that despite the similarities of both markers, rep-PCR represent a higher resolution than the ISSR. So the rep-PCR marker leads to further differentiating of the isolates. There was a relationship between genetic divergence and geographical origins of isolates. rep-PCR can replace ISSR in diversity studies because of their comparable accuracy in the interpretation of genetic diversity of isolates.
- انتشار مقاله: 22-01-1395
- نویسندگان: Massoume Amini,Naser Safaie,Haidar Saify Nabiabad
- مشاهده