در هنگام جستجو کلمه در قسمت عنوان میتوانید کلمات مورد جستجو را با کاراکتر (-) جدا کنید.
کاربرد نوع شرط:
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: Iranian Journal of Veterinary Research
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: Iran,genotyping,Phylogenetic tree,Avian Infectious bronchitis,Q1
- چکیده: پیشینه:برونشیت عفونی پرندگان (IB) یک بیماری ویروسی عفونی ماکیان است. محافظت موثر ماکیان علیه تعدادی از واریانتهای مختلف ویروس برونشیت عفونی (IBV) به دست نمیآید مگر اینکه ژنوتیپهای در حال چرخش در آن ناحیه شناسایی شوند و توانایی محافظت متقاطع واکسنهای در حال استفاده به دست آید. هدف: در یک برنامه نظارتی IBVs، یک ژنوتیپ جدید در شمال ایران در سال 1398 شناسایی شد. این مطالعه به منظور جدا سازی و مشخص کردن این ژنوتیپ جدید IBV انجام شد. روش کار: بافتهای نای از ماکیان که علایم تنفسی داشتند جمع آوری شد. نمونهها همگن و به مایع آلانتوئیک تخم مرغهای جنیندار عاری از عوامل بیماریزا (SPF) تلقیح شدند. ویروس برونشیت عفونی به وسیله واکنش زنجیرهای پلیمراز زمان حقیقی (RT-PCR) شناسایی شد. ناحیه بسیار متغیر ژن S1 ویروس برونشیت عفونی برای توالی یابی تکثیر شد. نتایج: نمونههای مثبت از لحاظ فیلوژنی تحلیل شدند، و دو جدایه مثبت همراه با سویههای Q1 ویروس برونشیت عفونی در یک خوشه قرار گرفتند. نتیجهگیری: این اولین گزارش شیوع Q1 در ایران است. تحقیقات بیشتری به منظور یافتن نقش ژنوتیپ Q1 ویروس برونشیت عفونی در کمپلکس بیماری تنفسی ماکیان مورد نیاز است.
- چکیده انگلیسی: Background: Avian infectious bronchitis (IB) is an infectious viral disease of chickens. The effective protection of chickens against many different infectious bronchitis virus (IBV) variants is not achieved unless the circulating genotypes in the region are identified and the cross-protection of the potential of vaccines in use is assessed. Aims:In a monitoring program of IBVs, a new genotype was identified in the north of Iran, 2019. This work was conducted to isolate and characterize this new IBV genotype. Methods: Tracheal tissues were collected from chickens showing signs of respiratory involvement. Specimens were homogenized and inoculated to the allantoic fluid of embryonated specific pathogen-free (SPF) eggs. Infectious bronchitis virus was detected using real time-polymerase chain reaction (RT-PCR). The hypervariable region of the IBV S1 gene was amplified for sequencing. Results: Positive samples were phylogenetically analyzed, and both positive isolates were clustered with Q1 IBV strains. Conclusion: This is the first report of the Q1 outbreak in Iran. More investigations are needed to find the role of Q1 IBV in the respiratory disease complex of chickens.
- انتشار مقاله: 04-10-1398
- نویسندگان: A. Ghalyanchilangeroudi,H. Najafi,M. H. Fallah Mehrabadi,Z. Ziafati Kafi,N. Sadri,A. Hojabr Rajeoni,A. Modiri,A. Safari,H. Hosseini
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: Iranian Journal of Veterinary Research
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: Iran,vaccine,H9N2,Vaccination,Viral load
- چکیده: پیشینه: آنفلوانزای پرندگان (AI) که توسط تحت تیپ H9N2 ایجاد میشود یک بیماری ویروسی شایع با خسارات اقتصادی فراوان از طریق تظاهرات قابل توجه تنفسی و گوارشی در مزارع پرورش طیور است. میزان ایمنی ایجاد شده توسط یک واکسن به طور عمده به سطح شباهت آنتی ژنی بین سویه چالش و سویه واکسن بستگی دارد. هدف: هدف این مطالعه بررسی اثر احتمالی تغییرات آنتی ژنی مداوم رخ داده در ویروسهای در حال گردش ایران از سال 1998 بر تاثیرات واکسنهای تجاری تهیه شده از بذرهای همه گیریهای قبل برای مهار میزان تکثیر ویروس در ارگانهای هدف جوجههای گوشتی چالش داده شده با جدایههای اخیر، میباشد. روش کار: نود قطعه جوجه گوشتی در سن یک روزگی به صورت تصادفی به 5 گروه تقسیم شدند و با واکسنهای اتوژن یا تجاری (A یا B) واکسینه شدند. دو گروه باقیمانده شامل گروه بدون واکسیناسیون و گروه چالش بود. واکنش زنجیرهای پلیمراز زمان حقیقی (qRT-PCR) بر روی نمونههای نای و مدفوع جوجههای چالش داده شده با ویروس H9N2 جدید جهت تعیین تکثیر ویروس انجام شد. همچنین آنتی بادیهای هومورال توسط آزمون آگلوتیناسیون مهاری (HI) ارزیابی شدند. نتایج: تفاوت معنیداری در تکثیر ویروس H9N2 در نای بین گروههای واکسینه شده در روز 5 پس از چالش (DPC) وجود نداشت، اما در روز 15 پس از چالش، واکسن اتوژن در مقایسه با واکسنهای تجاری به طور معنیداری تکثیر ویروس را کاهش داد (P≤0.05). تفاوت معنیداری در میزان ویروس سواب مدفوعی، بین گروه واکسن اتوژن و واکسن تجاری A مشاهده نشد و هر دو واکسن به طور معنیداری موجب مهار تکثیر ویروس در مقایسه با گروه واکسینه نشده، شدند (P≤0.05). همچنین، واکسن اتوژن بیشترین تیتر HI را باعث میشود. نتیجهگیری: واکسنهای غیر فعال شده که از جدایههای همه گیریهای قبلی تهیه میشوند چندان قادر به ایجاد ایمنی مناسب بر علیه ویروسهای H9N2 اخیر نیستند. به نظر میرسد اکنون زمان تغییر واکسنها با استفاده از جدایههای جدید است که شباهت آنتی ژنی بیشتری با ویروسهای H9N2 جدید در حال گردش در منطقه دارند.
- چکیده انگلیسی: Background: Avian influenza (AI) caused by AI virus subtype H9N2 is a prevalent viral disease with enormous economic losses in poultry farms through significant respiratory and gastrointestinal manifestations. The degree of protection obtained from a vaccine strongly depends on the level of antigenic similarity between challenge and vaccine virus. Aims: The study aimed at investigating the possible effects of continuous antigenic changes occurring in circulating Iranian viruses since 1998 on the commercial vaccines outcome by using vaccine seeds from earlier outbreaks for inhibiting viral replication in target organs of broilers challenged with the recent isolate. Methods: Ninety broilers at one day of age were randomly allocated into 5 groups and vaccinated with autogenous or commercial vaccines (A or B). Two remaining groups consisted of challenged without vaccination and intact birds. Quantitative real time-polymerase chain reaction (qRT-PCR) was performed on the trachea and faecal samples of challenged chickens with recent H9N2 virus to determine viral load. Moreover, humoral antibodies titers were evaluated by hemagglutination inhibition (HI) assay. Results: There was no significant difference in H9N2 viral load in the trachea among vaccinated groups on 5 days post challenge (DPC), but on 15 DPC, the autogenous vaccine significantly lowered viral load compared to commercial vaccines (P≤0.05). No significant differences in faecal swab’s viral load was observed between autogenous and commercial vaccine A, and both of them significantly inhibited viral load compared to unvaccinated group (P≤0.05). In addition, the autogenous vaccine elicited the highest HI titer. Conclusion: Inactivated vaccines that use isolates from previous outbreaks are no longer able to induce proper immunity against recent H9N2 viruses. It seems the time to change vaccine strains to more recent isolates that have better antigenic similarity with current circulating H9N2 viruses in the region has come.
- انتشار مقاله: 25-01-1398
- نویسندگان: M. H. Fallah Mehrabadi,A. Ghalyanchilangeroudi,S. A. Ghafouri,H. Hosseini,M. T. Zabihi Petroudi,A. Modiri Hamadan,H. Rezaee,P. Motamed Chaboki,S. Vatandour,A. Shayeganmehr
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: Iranian Journal of Veterinary Research
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: Afghanistan,genotyping,Avian Infectious bronchitis,GI-19,GI-23
- چکیده: پیشینه: برونشیت عفونی (IB) پرندگان یک بیماری ویروسی بسیار واگیردار است که دارای اثرات اقتصادی بر صنعت طیور میباشد. این ویروس دارای ژنوتیپهای متفاوتی میباشد و برای طبقهبندی سویههای ویروس برونشیت عفونی (IBV) از تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک استفاده شده است. هدف: تعیین ژنوتیپهای ویروس برونشیت عفونی پرندگان در حال چرخش در افغانستان برای اولین بار بوده است. روش کار: نمونههای نای از 100 گله مختلف گوشتی تجاری با علایم تنفسی در افغانستان در طی سالهای 2016 تا 2017 جمعآوری شد. بعد از انجام نسخه برداری معکوس-واکنش زنجیرهای پلیمراز زمان حقیقی RRT-PCR))، نمونههای مثبت مشخص شد. یک بخش ژن گلیکوپروتئین اسپایک bp 390 با استفاده از واکنش زنجیرهای پلیمراز آشیانهای، توالی یابی گردید و مورد بررسی قرار گرفت. نتایج: نتایج RRT-PCR نشان داد که 45 گله از 100 گله ذکر شده مثبت بودند. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک تمام نمونههای مثبت نشان داد که سویههای ویروس برونشیت عفونی به دو گروه ژنوتیپ متمایز تقسیم میشوند: LX4 (GI-19) (9/45) و شبه IS-1494 (34/45) (GI-23). همچنین 2 نمونه از 45 نمونه قابل شناسایی نبودند. نتیجهگیری: این اولین مطالعهای است که بر روی اپیدمیولوژی مولکولی ویروس برونشیت عفونی در افغانستان تمرکز دارد و بینش ما از برونشیت عفونی در منطقه را گسترش داده است. این نتایج نشان دهنده میزان بالای عفونت برونشیت عفونی در مزارع طیور گوشتی افغانستان میباشد و بر ادامه پایش روی ویروس برونشیت عفونی جهت اصلاح برنامههای واکسیناسیون تایید مینماید.
- چکیده انگلیسی: Background: Avian infectious bronchitis (IB) is a highly contagious viral disease which affects the poultry industry. The virus exists in a wide variety of genotypes, and phylogenetic analysis has been used to classify infectious bronchitis virus (IBV) strains. Aims: The object of the study is a molecular characterization of circulating IBV in Afghanistan as a first study. Methods: The tracheal tissue specimens from 100 different commercial broiler flocks with respiratory distress in Afghanistan were collected during 2016-2017. After real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RRT-PCR), IBV-positive samples were further characterized. A 390 bp hypervariable spike glycoprotein gene segment was amplified using Nested PCR, sequenced, and analyzed. Results: The results of real-time RT-PCR showed that 45/100 of the mentioned flocks were IBV positive. Phylogenetic analysis of all positive samples revealed that IBV strains were clustered into two distinct genotypes: LX4 (GI-19) (9/45) and IS-1494 like (GI-23) (34/45). Also, 2 of the 45 samples remained uncharacterized. Conclusion: It is the first study focusing on the molecular epidemiology of IBV in Afghanistan, extending our understanding of IB in the region. These results showed the high rate of IB infection in Afghanistan broiler farms and confirm the continuing monitoring of IBVs to modify the vaccination program.
- انتشار مقاله: 16-02-1397
- نویسندگان: N. Sadri,A. Ghalyanchilangeroudi,M. H. Fallah Mehrabadi,H. Hosseini,A. Shayeganmehr,M. S. Sediqian,M. Jabbarifakhr,A. M. Hamdan,F. S. Mousavi
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: Archives of Razi Institute
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: Iran,Seroprevalence,broiler farms,Avian Influenza H9N2,Abattoirs
- چکیده:
- چکیده انگلیسی: The present study aimed to determine the seroprevalence of H9N2 influenza in broiler farms at the time of slaughter in Iran. A total of 747 birds were sampled from 74 Farms in 13 provinces within 2013-2016. The obtained sera were investigated using the hemagglutination inhibition (HI) test. Out of 74 sampled farms and 747 birds, 57 farms (77%) and 445 (59.57%) birds were reported to be seropositive. In 2013, 10 farms and 110 birds were sampled out of which three farms (29.6%) and 29 birds (30%) were seropositive. In 2014, 24 farms and 220 birds were sampled out of which 22 farms (91.6%) and 220 birds (86.6%) were positive in six provinces. In 2015, 30 farms and 278 birds were sampled out of which 5 farms (16%) and134 birds (48.2%) were positive in four provinces. Finally, in 2016, 7 farms (70%) out of 10 sampled farms and 62 birds (59%) out of 105 sampled birds were positive for H9N2 in eight provinces. The mean titer of units in 2013 was statistically lower, as compared to that in 2014 (P<0.01). In addition, the proportion of positive serum units in 2013 was statistically lower, as compared to that in 2014 (P<0.001). In general, the prevalence of H9N2 was high indicating the continuous circulation of the virus in Iran. Given the importance and impact of this virus on the poultry industry, people’s livelihood, and public health, more epidemiological studies are needed to evaluate the effectiveness of the adopted measures and methods in controlling the H9N2 virus.
- انتشار مقاله: 14-08-1397
- نویسندگان: M. H. Fallah Mehrabadi,N. Motamed,A. Ghalyanchilangeroudi,F. Tehrani,A. Borhani Kia
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: Archives of Razi Institute
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: Phylogenetic analysis,live bird market,Backyard poultry,Avian Infectious bronchitis,Gilan Province
- چکیده:
- چکیده انگلیسی: Coronaviruses (AvCoV) which include infectious bronchitis virus (IBV) and other bird coronaviruses belong to the genus gammacoronavirus, subfamily Coronavirinae. One of the most prominent representatives of gammacoronavirus genus is infectious bronchitis virus (IBV) which is a highly contagious viral pathogen of chickens causing considerable economic losses to the poultry industry. IBVs mostly affect the respiratory, urinary, and reproductive tracts leading to a substantial drop in production. Backyard poultry in the villages usually share their food and water with free flight birds which puts them at serious risk of disease transmission. Furthermore, the poor hygienic measurements which are often used in backyard flocks make them a potential reservoir for diseases that can be transferred to commercial poultry flocks. Live bird markets (LBMs) which receive live poultry to be resold or slaughtered and sold onsite play a significant role in spreading infectious diseases among the different bird species. In the present study, a number of 354 cloacal swab samples were collected from different bird species from LBMs of Gilan province. Subsequently, after RNA extraction, reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) technique was carried out using specific primers of S1 gene to detect coronavirus infectious bronchitis virus. Two samples from backyard chickens were reported to be positive to coronavirus which were named Iran/Backyardchicken96/2017 and Iran/Backyardchicken94/2017. The results of the phylogenetic analysis demonstrated that these two isolates are placed in QX and IS-1494 strains, respectively. On a final note, the obtained results highlighted the role of live birds offered in LBMs in the epidemiology of IBV and the transmission of the virus to the industrial flock.
- انتشار مقاله: 07-05-1397
- نویسندگان: H. Rezaee,A. Ghalyanchilangeroudi,V. Karimi,M. H. Fallah Mehrabadi,P. Motamed Chaboki,A. Shayganmehr,R. Esmaeelzadeh Dizaji
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: Archives of Razi Institute
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: Iran,Real-time RT-PCR,D1466 infectious bronchitis,Commercial farms
- چکیده:
- چکیده انگلیسی: Infectious bronchitis is one of the most common diseases in the poultry industry in many countries, especially in the regions with a dense poultry farming industry. Gammacoronavirus is the etiologic agent of this disease, with the chickens and poultries as the natural reservoirs of the virus. Various strains of infectious bronchitis virus have been reported in poultry around the world. In terms of pathogenicity, this virus can induce a spectrum of diseases ranging from the moderate respiratory tract to kidney and reproductive diseases. The serotypes of this virus do not cause cross-immunity against each other. This issue makes it difficult to control the disease. Based on the analysis of the highly variable region of the glycoprotein S1 gene, the isolated strains in Iran were classified into seven different phylogenetic groups, including Massachusetts, QX, IS-720, IS-1494, 793/B, IR-1, and IR-2. The D1466 genotype has not been reported in the country; however, the killed vaccine is used in broiler breeder farms. In this study, tissue specimens were collected from 700 farms (i.e., broiler, egg-laying, and broiler breeder farms) suspected of infectious bronchitis within 2013-2017. The samples were examined using real-time reverse transcription-polymerase chain reaction. The D1466 genotype was not detected in any of the studied specimens. Due to the lack of immunity of the D1466 serotype against the dominant types in the country, one has to be careful in choosing the right vaccine. It is necessary to perform continuous monitoring of the circulation status of the various serotypes of viruses in the country to identify the dominant and possible new serotypes for the utilization of the appropriate vaccine.
- انتشار مقاله: 08-02-1397
- نویسندگان: R. Khaltabadi Farahani,A. Ghalyanchilangeroudi,M. H. Fallah Mehrabadi,S. A. Ghafouri,H. Maghsoudloo
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: Archives of Razi Institute
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: Molecular identification,Iran,Turkey,Phylogenetic tree,Bordetella avium
- چکیده:
- چکیده انگلیسی: Bordetellosis or turkey coryza, caused by Bordetella avium, has been an issue for turkey industry since its first description in 1967 when it was reported for the first time. Bordetella avium causes a highly contagious upper respiratory disease in turkeys. Therefore, this study aimed to isolate and characterize this species from commercial and backyard turkeys in Tehran, Isfahan, and Northern provinces of Iran. For the purpose of the study, 625 tracheal swabs were taken from 425 commercial poults and 200 backyard poults aged 2-6 weeks from September 2016 to September 2018. The swabs were immediately plated on MacConkey and blood agar plates and then pooled (5 swabs/pool) in tubes, containing 2 mL distilled water, to perform direct polymerase chain reaction (PCR) for the identification of B. avium. A total of 17 swab pools were found to be positive for B. avium. A subset of seven positive samples were sequenced for the flanking region of piuA gene. The analysis of the sequences indicated that the sequences were 98%, 96%, and 98% similar to B. avium 197N (AM167904.1), 4142 (AY925058.1), and 4156 (AY925068.1) sequences, respectively. To the best of our knowledge, the current study is the first attempt toward the molecular detection and characterization of B. avium in Iran. It is highly recommended to perform further studies to isolate, characterize, and differentiate the regional isolates in order to help the developing turkey industry of Iran meet the increasing demands for protein in the diet of the citizenry.
- انتشار مقاله: 11-10-1397
- نویسندگان: M. Ehsan,M. Hassanzadeh,A. Barrin,M. H. Bozorgmehri Fard,M. Askari Badouei,A. Ghalyanchilangeroudi,L. Temple,S. Turkyilmaz
- مشاهده