در هنگام جستجو کلمه در قسمت عنوان میتوانید کلمات مورد جستجو را با کاراکتر (-) جدا کنید.
کاربرد نوع شرط:
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: رگرسیون,ژن DGAT1,پیش بینی تولید و همبستگی
- چکیده: ژن DGAT1 به عنوان یک ژن کاندید در کروموزوم شماره 14 برای درصد چربی و تولید شیر مطرح می باشد. این ژن با کد کردن آنزیم دی آسیل گلیسرول اسیل ترانسفراز نقش اصلی را در سنتز تری گلیسیرید و در نهایت چربی شیر دارد. در این پژوهش 398 نمونه خون از گاوهای هلشتاین استانهای تهران و اصفهان جمع آوری گردید، با انجام واکنش PCR یک قطعه 411 جفت بازی از اگزون شماره 8 این ژن تکثیر گردید. تعیین ژنوتیپ افراد جمعیت با استفاده از تکنیک PCR-RFLP انجام شد. بر اساس نحوه برش آنزیم CfrI سه نوع ژنوتیپ KK ،KA ،AA شناسایی شدند، همچنین فراوانی آللی K و A به ترتیب برابر با 37/0 و 63/0 تعیین شدند. سپس با استفاده از برازش GLM ، صفاتی که اثر ژن DGAT1 برا ی آنها معنی دار بود تعیین شدند و در نهایت با استفاده از کد بندی عامل های مدل و رگرسیون متغیر های ظاهری، مدل های پیش بینی ارائه شدند. از ضریب همبستگی بین رکورد های واقعی و پیش بینی شده به عنوان معیار اعتبار سنجی مدل های ارائه شده استفاده شد. نتایج این پژوهش نشان داد که مدل های ارائه شده برای پیش بینی صفات تولید شیر 305 روز، ارزش اصلاحی درصد چربی و درصد چربی بر اساس دو بار دوشش در روز، تا حدودی قادر به پیش بینی تولید می باشند اما به دلیل استفاده از حجم اطلاعات کم، مقدار عددی ضرایب همبستگی به میزان کمی برآورد شدند. با استفاده از اطلاعات ژن ها و رکورد های یبشتر می توان نتایج دقیق تری بدست آورد.
- چکیده انگلیسی: The results of multiple QTL mapping design in recent years, quantitative trait loci for milk fat percentage and milk yield was described in BTA14. With the coding of diacylglycerol-acyltransferase enzyme, DGAT1 gene has the main role in the triglyceride synthesis and finally fat milk synthesis. In this research, 398 blood samples were collected from Tehran and Esfahan province. In PCR reaction, 411 bp fragment of exon 8 DGAT1 gene was amplified. Finally, genotyping population was performed using RFLP-PCR technique. Three genotypes such as KK, AA and KA were detected. Frequencies of DGAT1 alleles (K and A) were estimated 0.37 and 0.63 respectively. Using of fitted fixed model and animals ‘records significant traits were recognized. Finally using of parameters coding and regression model prediction models were presented. Correlation coefficient was utilized for validation of prediction models. The results of this study indicated presented model can be prediction of Milk305 (milk production adjusted for milking in 305 days), EBVFP (estimated breeding value for milk fat percentage, %) and FATP2X (milk fat percentage adjusted for two milking per day, %) traits in population.
- انتشار مقاله: 17-05-1391
- نویسندگان: حامد خراتی کوپایی,محمدرضا محمدآبادی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: کنجاله بادام,CNCPS,زیرواحدهای پروتئینی,الکتروفورز SDS-Page
- چکیده: در این پژوهش به منظور مطالعه زیر واحدها و بخش های مختلف پروتئین کنجاله بادام و مقایسه آن با کنجاله های سویا و پنبه دانه از دو روش الکتروفورز SDS-PAGE و روش CNCPS استفاده شد. نتایج بخش های مختلف پروتئین بر اساس روش CNCPS در این پژوهش نشان دهنده اختلاف معنی دار بین میانگینهای نیتروژن غیرپروتئینی (بخشA)، پروتئین حقیقی محلول (بخش B1)، پروتئین با قابلیت هضم سریع در شکمبه (بخشB 2)، پروتئین با قابلیت هضم کند در شکمبه (بخشB3) و پروتئین غیرقابل تجزیه در شکمبه (بخش C) برای کنجاله بادام در مقایسه با کنجاله های سویا و تخم پنبه است (05/0>p). در روش SDS- Page دو پلی پپتید اصلی اسیدی با دامنه وزن مولکولی 63 تا 100 کیلودالتون و پلی پپتید بازی با دامنه وزن مولکولی20 تا 35 کیلودالتون برای پروتئین آماندین بادام مشاهده گردید. همچنین دو نوع پروتئین عمده در کنجاله سویا شامل گلیسینین و بتاکنگلیسینین مشاهده شد. گلیسینین دارای دو زیرواحد اسیدی (عمدتا دارای اسیدهای آمینه اسیدی) و بازی (دارای اسیدهای آمینه بازی) به ترتیب با وزن مولکولی 40 و 30/21 کیلودالتون و پروتئین بتاکنگلیسینین دارای سه زیرواحد α، ά و β با وزن مولکولی به ترتیب 83/91، 49/80 و 16/47 بود. در پژوهش حاضر، الگوی زیرواحدهای پروتئینی در کنجاله پنبه دانه نشان دهنده 4 زنجیره پلی پپتیدی بوده که مربوط به پروتئین های گلوبولین S9 با دو زیر واحد به وزن مولکولی 36/78 کیلودالتون و 10/71 کیلودالتون، گلوبولین 5S با یک زیر واحد به وزن مولکولی 47/25 کیلودالتون و آلبومین 2S با یک زیر واحد به وزن مولکولی 84/15 کیلودالتون می باشد. نتایج پژوهش حاضر نشان داد که کنجاله بادام با توجه زیر واحدها و بخش های مختلف پروتئین دارای ارزش تغذیه ای مناسب برای جایگزینی با کنجاله سویا در تغذیه دام می باشد.
- چکیده انگلیسی: To study the protein subunits and fractions of almond meal in comparison to soybean meal and cottonseed meal, two methods including SDS-Page electrophoresis and CNCPS were used in this research. The results of protein fractions according to CNCPS shows a significant difference (p<0.05) among non-protein nitrogen (A), rapidly degradable true protein (B1), moderately degradable true protein (B2), slowly degradable true protein (B3) and undegradable true protein (C) fractions of almond meal in comparison to soybean meal and cottonseed meal. In regards to SDS-Page electrophoresis results, amandin protein was mainly composed of two major polypeptides with estimated MWs in the range 63-100 kDa (acidic polypeptides) and 20-35 kDa (basic polypeptides). Furthermore, two major polypeptides including β-Conglycinin (three subunits, α, ά, β with MWs of 91.83, 80.49 and 47.16 respectively) and glycinin (two acidic and basic subunits with MWs of 40 and 21.30 kDa respectively) were observed in soybean meal. The pattern of protein subunits in cottonseed meal shows four major polypeptides including Globulin 9S (with MWs of 78.36 and 71.10 kDa), Globulin 5S (with MW of 25.47 kDa) and Albumin 2S (with MW of 15.84 kDa). The results of the current study shows that almond meal have a good nutritive value and can be a good substitute for soybean meal in animal nutrition.
- انتشار مقاله: 20-07-1390
- نویسندگان: امین خضری,محسن یوسفی انصاری,محمدرضا محمدآبادی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: علوم دامی ایران
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: زندهمانی,وراثتپذیری,بز کرکی راینی
- چکیده: در اﻳﻦ ﭘﮋوﻫﺶ از رﻛﻮردﻫﺎی زﻧﺪهﻣﺎﻧﻲ شمار 3055 رأس بزغاله، ﻣﺮﺑﻮط ﺑﻪ ﮔﻠۀ اﻳﺴﺘﮕﺎه ﭘﺮورش و اﺻﻼح نژاد بز کرکی راینی واﻗﻊ در شهرستان بافت، گردآوریشده ﻃﻲ سالهای 1386-1372 استفاده شد.دادهها ﺑﺎ ﻣﺪلﻫﺎی ﺧﻄﻲ و ﻧﺴﺒﺖ ﺧﻄﺮ ﺑﺎ ﺗﺎﺑﻊ وﻳﺒﺎل ﺗﺠﺰﻳﻪ ﺷﺪﻧﺪ. اﻳﻦ ﻣﺪلﻫﺎ ﺷﺎﻣﻞ اﺛﺮگذاریهای عاملهای ﺛﺎﺑﺖ ﺳﺎل، ﻣﺎه ﺗﻮﻟﺪ، ﺟﻨﺲ، ﻧﻮع ﺗﻮﻟﺪ، ﺳﻦ ﻣﺎدر و ﻣﺘﻐﻴﺮ کمکی وزن ﺗﻮﻟﺪ بهصورت درﺟﻪ دوم و اﺛﺮگذاریهای ﺗﺼﺎدﻓﻲ ژﻧﺘﻴﻜﻲ اﻓﺰاﻳﺸﻲ ﻣﺴﺘﻘﻴﻢ، ژﻧﺘﻴﻜﻲ اﻓﺰاﻳﺸﻲ ﻣﺎدری، ﻣﺤﻴﻂ دائمی ﻣﺎدری و باقیمانده ﺑﻮدند. فراسنجهﻫﺎی ژﻧﺘﻴﻜﻲ از روش بیشینه درستنمایی محدودشده ﺑﺎ و ﺑﺪون اﺛﺮگذاریهای ﻣﺎدری و ﻣﺪل ﭘﺪری ﺑﺮآورد شد. وراﺛﺖﭘﺬﻳﺮی ﻣﺴﺘﻘﻴﻢ ﻣﻴﺰان زﻧﺪهﻣﺎﻧﻲ ناشی از ﻣﺪلﻫﺎی ﻣﺨﺘﻠﻒ ﺧﻄﻲ در ﺣﺪ ﭘﺎﻳﻴﻦ (01/0 تا 06/0) ﺑﺮآورد شد. وراﺛﺖﭘﺬﻳﺮیﻫﺎی ﻣﺴﺘﻘﻴﻢ در ﻣﻘﻴﺎس ﻟﮕﺎرﻳﺘﻤﻲ، ﻣﻘﻴـﺎس اوﻟﻴﻪ و وراﺛﺖﭘﺬﻳﺮی مؤثر ﻧﺴﺒﺖ ﺧﻄﺮ بهدستآمده از ﻣﺪل ﭘﺪری و دارای ﺗﺎﺑﻊ وﻳﺒﺎل در ﻣﻘﺎﻳﺴﻪ ﺑﺎ مدل خطی، ﺑﻴﺸﺘﺮ و در ﺣﺪ ﻣﺘﻮﺳﻂ ﺗﺎ ﺑﺎﻻ (17/0 تا 70/0) ﺑﻮدﻧﺪ. ﺑﺮآوردﻫﺎی ﻣیانگین ﺑﯿﺎﻧﮕﺮ اﯾﻦ اﺳﺖ ﮐﻪ عاملهای ﻣﺨﺘﻠﻒ ژﻧﺘﯿﮑﯽ و ﻏﯿﺮ ژﻧﺘﯿﮑﯽ ﺑﺮ زندهمانی تأثیرگذار اﺳﺖ. ﻟﺬا، ﺑﺮای ﺑﻬﺒﻮد اﯾﻦ ﺻﻔﺎت میبایست در ﮐﻨﺎر ﺷﺮاﯾﻂ ﻣﺪﯾﺮﯾﺘﯽ مطلوب، اﺻﻼح ژﻧﺘﯿﮑﯽ نیز اﻧﺠﺎم ﮔﯿﺮد.
- چکیده انگلیسی: In this study, the records of survival of 3056 kids related to the breeding station of Raini Cashmere goat were used during years 1993-2004. These records were collected in Raein Breeding station located in the Baft city, Kerman province, Iran. The data were analyzed using linear and hazard ratio models with Weibul function. These models included fixed factors such as year and month of birth, sex, type, age of dam and birth weight as quadratic covariate, and direct additive genetic, maternal additive genetic, maternal permanent environmental and residual random effects. Genetic parameters were estimated using restricted maximum likelihood procedure and different animal models contained with and without maternal and common environmental effects and sire model. The direct heritability of length of life and survival rate estimated from different linear models was low (0.01 to 0.06). The estimates of heritability in logarithmic scale, original scale and effective heritability obtained from sire and animal models with Weibull function were medium to high (0.17 to 0.70) and higher than analogous values estimated by different linear models. Medium estimates show that genetic and non-genetic factors affect survival. Hence, to improve these traits, selecting beside suitable management are necessary.
- انتشار مقاله: 20-04-1396
- نویسندگان: فاطمه محمدی نژاد,محمدرضا محمدآبادی,ارسلان برازنده
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تولیدات دامی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: کرمان,چندشکلی,بتالاکتوگلوبولین,روش PCR-RFLP,گاو بومی
- چکیده: بتالاکتوگلوبولین یکی از پروتئین های مهم در شیر پستانداران است که به وسیله سلول های پوششی غدد پستان سنتز شده و در کیفیت شیر و فرآیند لخته شدن آن نقش دارد. در این تحقیق، برای تعیین آلل های ژن بتالاکتوگلوبولین گاوهای بومی و هلشتاین استان کرمان از روش PCR-RFLP استفاده شد. چندشکلی ژنتیکی در جایگاه بتالاکتوگلوبولین به وسیله هضم محصولات PCR با اندونوکلئاز HaeIII، الکتروفورز در ژل آگارز و رنگ آمیزی با استفاده از اتیدیوم بروماید در 100 نمونه DNA گاوهای بومی و هلشتاین استان کرمان برای آلل های A و B تعیین شد. فراوانی آلل های A و B برای گاوهای هلشتاین به ترتیب 62/0 و 38/0 با متوسط هتروزایگوتی 47/0 و برای گاوهای بومی به ترتیب 55/0 و 45/0 با متوسط هتروزایگوتی 46/0 تعیین شد. نتایج نشان داد که جمعیت های مورد مطالعه از نظر جایگاه مزبور در تعادل هاردی - وینبرگ نبودند.
- چکیده انگلیسی: Beta-lactoglobulin (LGB) is one of the proteins in the mammals’ milk synthesized by the epithelial cells of the mammary glands and affects the quality and coagulation of the milk. The aim of this study was to determine allele frequencies in LGB gene of Native and Holstein cattle in Kerman province using PCR-RFLP method. Genetic polymorphism, for 100 DNA samples in the locus was determined by digestion of PCR products with endonuclease HaeIII (LGB), followed by electrophoresis in agarose gel stained with ethidium bromide. Allele frequency for the A and B alleles in Holstein cattle was 0.62 and 0.38 and in Native cattle was 0.55 and 0.45, respectively. Average heterozygosity in Holstein and Native cattle was 0.47 and 0.46, respectively. Results indicated that the studied populations were not in Hardy-Weinberg equilibrium for the LGB locus.
- انتشار مقاله: 31-03-1395
- نویسندگان: محمدرضا محمدآبادی,اکرم محمدی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تولیدات دامی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: نشانگرهای ریزماهواره,بلدرچین ژاپنی,صفات لاشه,طرح F2,نقشهیابی QTL
- چکیده: هدف از انجام پژوهش حاضر، شناسایی جایگاه صفات کمّی (QTL) مرتبط با صفات لاشه روی کروموزوم یک در جمعیت F2 بلدرچین ژاپنی بود. بدین منظور، جمعیتی سهنسلی از آمیزش متقابل دوسویۀ سفید (تخمگذار) و وحشی (گوشتی) بلدرچین ژاپنی ایجاد شد. هشت جفت بلدرچین سفید و وحشی آمیزش داده شد و تعداد 34 پرنده F1 تولید شد. از تلاقی پرندگان F1 تعداد 422 پرنده F2 تولید شد. رکوردهای فنوتیپی وزن اجزای متفاوت لاشۀ پرندگان نسل F2 ثبت شدند. ژنوتیپ همۀ پرندگان هر سه نسل (472) برای هشت نشانگر ریزماهوارۀ موجود روی کروموزوم شمارۀ یک تعیین شد. آنالیز QTL به روش مکانیابی درونفاصلهای مبتنی بر رگرسیون انجام گردید. پس از آنالیز، QTLهای معنیداری برای صفات وزن سینه، وزن لاشه، وزن سر، و درصد سینه شناسایی شد. نتایج نشان داد که یک QTL معنیدار با اثر ایمپرینتینگ روی کروموزوم شمارۀ یک وجود دارد که بر وزن سینه بهعنوان قطعهای با ارزش اقتصادی مؤثر است. واریانس QTL برآوردشده در پژوهش حاضر برای QTLهای با اثرهای افزایشی، غلبه، و ایمپیرینتینگ بهترتیب در محدودۀ 8/1–3/2، 2/1–2/2، و 5/0–2/2 درصد بود.
- چکیده انگلیسی: The purpose of this study was to identify genomic regions of quantitative trait loci (QTL), affecting
carcass traits on chromosome 1 in an F2 population of Japanese quail. For this purpose, a three-generation
resource population was developed by using two distinct Japanese quail strains, wild (meat type) and
white (layer type). Eight pairs of white and wild birds were crossed reciprocally and 34 F1 birds were
produced. The F1 birds were intercrossed to generate 422 F2 offspring. Phenotypic data including weight
of carcass parts were collected on F2 birds. All of the animals from three generations (472 birds) were
genotyped for eight microsatellite markers on chromosome 1. QTL analysis was performed with least
squares interval mapping method fitting three various statistical models. Significant QTL were identified
for breast weight, carcass weight, head weight and percentage of breast. There was also evidence for
imprinted QTL affecting breast weight, a carcass part of high economic value, on chromosome 1. The
proportion of the F2 phenotypic variation explained by the significant additive, dominance and imprinted
QTL effects ranged from 1.8 to 2.3, 1.2 to 3.3 and 0.5 to 2.2 percent, respectively.- انتشار مقاله: 01-08-1392
- نویسندگان: حسن مرادیان,علی اسمعیلیزاده کشکوئیه,محمدرضا محمدآبادی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تحقیقات تولیدات دامی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: نشانگر ریزماهواره,بلدرچین ژاپنی,سرعت رشد نسبت کلیبر,جایگاه صفات کمی (QTL)
- چکیده: این تحقیق با هدف شناسایی جایگاههای صفات کمی (QTL) موثر بر سرعت رشد و نسبت کلیبر روی کروموزوم شماره 5 بلدرچین ژاپنی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره انجام شد. آزمایش در قالب یک طرح سه نسلی با استفاده از تلاقی دو جانبه دو سویه سفید و وحشی اجرا شد. از میان پرندگان نسل دوم 34 پرنده بطور تصادفی انتخاب و با تلاقی بین آنها 422 پرنده نسل سوم ایجاد شدند. رکوردهای فنوتیپی مربوط به میانگین افزایش وزن روزانه و نسبت کلیبر روی پرندگان نسل F2 ثبت شدند. تمامی 472 پرنده مربوط به هر سه نسل برای نشانگرهای ریزماهواره موجود بر روی کروموزوم شماره 5 تعیین ژنوتیپ شدند. برای آنالیز جایگاه صفات کمی، روش مکانیابی درون فاصلهای مبتنی بر رگرسیون در 5 مدل مختلف آماری مورد استفاده قرار گرفت. نتایج بیانگر وجود جایگاههای صفات کمی معنیداری با اثر افزایشی برای صفات میانگین افزایش وزن روزانه از یک روزگی تا یک هفتگی در موقعیت 21 سانتی مورگانی و نسبت کلیبر سه تا چهار هفتگی در موقعیت 18 سانتیمورگانی بود. اثرات غلبه و ایمپرینتینگ جایگاه صفات کمی بر هیچکدام از صفات مورد مطالعه معنیدار نبود. واریانس افزایشی جایگاههای صفات کمی شناسایی شده برای صفات مختلف در محدوده 1/1 تا 6/3 بود. با برازش مدلهای آماری مختلف، برای صفات میانگین افزایش وزن روزانه و نسبت کلیبر جایگاههای صفات کمی معنیدار با اثرات مختلف شناسایی شد.
- چکیده انگلیسی: This research carried out to identify effective quantitative trait loci in growth rate and Keliber ratio on chromosome 5 of Japanese quail by microsatellite markers. A three-generation resource population was developed by using two distinct Japanese quail strains, wild and white, to map quantitative trait loci underlying growth rate and Kleiber ratio. Eight pairs of white (S) and wild (W) birds were crossed reciprocally and 34 F1 birds were produced. The F1 birds were intercrossed to generate 422 F2 offspring. All of the animals from three generations (472 birds) were genotyped for three microsatellite markers on chromosome 5. Phenotypic data including average daily again and Kleiber ratio were collected on F2 birds. QTL analysis was performed using least squares regression interval mapping method fitting five various statistical models. Significant additive QTL were identified for average daily gain from hatch to one week of age and Kleiber ratio between 3 to 4 weeks of age. Dominance and imprinting QTL effects were not significant. The F2 phenotypic variance explained by the detected additive QTL effects ranged from 1.1 to 3.6 for different traits Significant QTLs identified by doing various statically types for average daily gain and keliber ratio with various effect.
- انتشار مقاله: 02-06-1394
- نویسندگان: محبوبه ایرانمنش,علی اسمعیلی زاده کشکوئیه,محمدرضا محمدآبادی,سعید سهرابی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تحقیقات تولیدات دامی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: بز سرخ جبالبارز,ژن GOLA-DRB3,PCR-REFLP
- چکیده: بز سرخ جبالبارز با جمعیتی بالغ بر 450 هزار رأس در منطقه جیرفت و کهنوج پرورش مییابد و با تولید کرک، گوشت قرمز و محصولات لبنی از منابع درآمد مهم عشایر و دامداران محسوب میشود. در این پژوهش که به منظور بررسی چند شکلی ژن GOLA-DRB3 با استفاده از PCR-REFLP در این دامها صورت گرفت از 100 بز به صورت تصادفی و انفرادی خونگیری شد. سپس DNA نمونههای خون دامها با استفاده از کیت استاندارد استخراج و تعیین کمیت و کیفیت شد. ناحیه اگزون 2 جایگاه GOLA-DRB3 به طول bp285 با روش Heminested-PCR در دو مرحله تکثیر و محصول PCR توسط آنزیم TaqI برش داده شد. محصولات هضم شده توسط الکتروفورز با ژل اکریل آمید10% یا ژل 2% و رنگ آمیزی اتیدیوم بروماید آشکار شد. نتایج هضم محصولات PCR با آنزیم TaqI شامل دو قطعه 163bp و bp 122 (الگوی هضمی T) یا قطعه هضم نشده bp 285 )الگوی هضمی T) بود. جمعیت از لحاظ ژن GOLA-DRB3انحراف از تعادل هاردی- واینبرگ نشان نداد (05/0P<). شاخص شانون، شاخص نیی، هتروزایگوسیتی مشاهده شده و هتروزایگوسیتی مورد انتظار به ترتیب 69/0، 50/0، 52/0 و 50/0 محاسبه شد. نتایج نشان داد که جمعیت مورد مطالعه تنوع ژنتیکی خوبی دارد و کارایی نشانگر GOLA-DRB3 جهت تعیین تنوع ژنتیکی خوب است. با استفاده از نتایج این پژوهش و پژوهش های قبلی و با در دست داشتن رکوردها و اطلاعات کمی جایگاه در این جمعیت، میتوان شناسایی و تعیین محل جایگاههای مؤثر بر صفات کمی را انجام داد.
- چکیده انگلیسی: More than 450000 Jabalbarez Red Goat are breeding in the cities of Jiroft and Kahnooj and produce cashmere, meat and dairy products. In this study which was carried out to analyse the polymorphism of GoLA-DRB3 gene in Jabalbarez Red goat using PCR-RELP, blood samples were randomly and individually taken from 100 goats. Then DNA was extracted from blood samples using DIAtom DNA prep Kit and its quantities and qualities were determined. Exon 2 of DRB 3.2 gene encompassing 285 bp amplified with heminested-PCR method in two rounds and PCR products were digested into fragments at 122bp and 163bp (T restriction pattern) or an undigested fragment at 285bp (t restriction patten). The Population was hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05). Shanon Index, Nei index, observed heterozygosity and expected heterozygosity were calculated 0.69, 0.50, 0.52 and 0.50 respectively. Results show that the studied population has good genetic diversity, and the efficiency of GOLA-DRB3 marker for determination of genetic diversity is good. By using the results of this study and previous studies and the application of quantitative records and information for locus of this population, loci affecting quantitative traits can be detected.
- انتشار مقاله: 31-03-1394
- نویسندگان: محمدرضا محمدآبادی,کبری دستافکن
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تحقیقات تولیدات دامی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: شتر یک کوهانه,نشانگرهای ریزماهواره,تنوع زنتیکی
- چکیده: در این پژوهش تنوع ژنتیکی جمعیت شترهای یک کوهانه شمال استان کرمان با استفاده از پنج جفت نشانگر ریزماهوارهی VOLP03، VOLP08، YWLL08، YWLL38 و CVR01 مطالعه شد. از شترهای شهرستانهای شهربابک، رفسنجان و راور تعداد 81 نمونه خون (5 جمعیت) گرفته شد. DNA به روش فنل کلروفورم استخراج و PCR انجام شد. جایگاهYWLL08 با 14 آلل و جایگاه CVR01 با 5 آلل به ترتیب بیشترین و کمترین تعداد آلل واقعی و نیز این جایگاهها با 54/10 و 35/4 آلل به ترتیب بیشترین و کمترین آلل مؤثر را نشان دادند .بیشترین میزان هتروزیگوسیتی مورد انتظار در جایگاه YWLL08 (9108/0) و کمترین آن مربوط به جایگاه CVR01 (7754/0) بود. تمامی جایگاههای مورد بررسی در این جمعیت انحراف از تعادل هاردی واینبرگ را نشان دادند. محتوای اطلاعات چندشکلی در دامنه 9165/0-7801/0 بهدست آمد. مقادیر شاخص تثبیت برای نشانگرهای YWLL08، VOLP03، VOLP08، YWLL38 و CVR01 به ترتیب 036/0، 089/0، 073/0، 046/0، 054/0 و 056/0 بهدست آمد که نشاندهنده تمایز خیلی زیاد بین جمعیتها است. نتایج نشان داد که جمعیت شترهای شمال استان کرمان تنوع ژنتیکی نسبتاً بالایی دارند که همین امر یکی از مهمترین دلایل سازگاری آنها به تغییرات شدید محیطی کرمان است. لذا ضروری است این تنوع ژنتیکی و این دام با ارزش را حفظ نمود.
- چکیده انگلیسی: This study investigated genetic variation within indigenous Camelus dromedarius in north of Kerman province using five microsatellite markers (VOLP03, VOLP08, YWLL08, YWLL38 and CVR01). The blood samples were collected from 81 camels of Shahr Babak, Rafsanjan and Ravar (5 populations). Phenol - chloroform extraction method was used to isolate the DNA. The highest and the lowest allele number and effective alleles are shown in YWLL08 (14 and 10.54) and CVR01 (5 and 4.35), respectively. The expected heterozygosity varied from 0.9108 (YWLL08) to 0.7754 (CVR01). The Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) test showed that all loci deviated from HWE (P<0.05). Polymorphism information content ranged from 0.7801 to 0.9165. Fixation index (FST) values for markers YWLL08, VOLP03, VOLP08, YWLL38 and CVR01 was obtained respectively 0.036, 0.089, 0.073, 0.046, 0.054 and 0.056 that indicates the distinction is too much between the populations. The results of the current study indicated that the Camelus dromedarius in the North of Kerman province populations have a relativity high genetic variation, which makes them compatible to drastic environmental changes existing in Kerman province. Therefore, it is essential to maintain this genetic diversity and this valuable animal.
- انتشار مقاله: 26-03-1394
- نویسندگان: مهرداد قاسمی میمندی,محمدرضا محمدآبادی,علی اسمعیلی زاده کشکوئیه
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تحقیقات تولیدات دامی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: PCR-SSCP,چندقلوزایی,ژن GDF9,گوسفندان آمیخته
- چکیده: برای کاهش تعداد میشهای مولد روی مراتع و جلوگیری از تخریب مراتع به نظر میرسد که برنامههای اصلاحنژادی جهت شناسایی ژنهای کاندیدای موثر بر صفت چندقلوزایی در نژادهای بومی کشور و استفاده از آنها مفید هستند. از جمله مهمترین عوامل مؤثر بر چندقلوزایی گوسفندان ژنهای خانواده TGFβهستند. ژن فاکتور رشد و تمایز شماره 9(GDF9) از اعضای مهم این خانواده است. هدف از انجام این تحقیق شناسایی چندشکلیهای تکنوکلئوتیدی موجود در نیمه اول (منتهی به 5َ رشته پیشرو) اگزون 2 ژنGDF9 در گوسفندان آمیخته حاصل از تلاقی بین قوچهای نژاد رومانوف با میشهای نژاد لریبختیاری به روش PCR-SSCP بود. در تحقیق حاضر پس از استخراج DNA به روش نمکی از 36 نمونه خون گوسفندان آمیخته نر و ماده 6-3 ماهه (17 نر و 19 ماده)، از واکنش زنجیرهای پلیمراز برای تکثیر قطعه 634 جفت بازی DNA استفاده شد. سپس بررسی چندشکلی فرم فضایی رشتههای منفرد (SSCP) محصولات PCR به وسیله ژل پلیاکریلآمید 8 درصد و رنگآمیزی نیترات نقره انجام و سپس از هر الگو یک نمونه تعیین توالی شد. در نمونههای مورد مطالعه، سه الگوی باندی 1، 2 و 3 به ترتیب با فراوانی 305/0، 584/0 و 111/0 برای قطعه تکثیر شده بهدست آمد. همچنین نتایج توالییابی منجر به شناسایی چهار جهش در موقعیتهای نوکلئوتیدی 471، 477، 520 و 721 ژن GDF9 در جمعیت مورد مطالعه شد.
- چکیده انگلیسی: For decreasing the number of breeding ewes on pastures and prevention of demolition pastures, it seems that animal breeding programs are benefit for identifying effective candidate genes on litter size in Iranian sheep breeds and using those. The TGFβ family genes are one of the most important effective factors on litter size in sheep. The GDF9 gene is one of the most important members from this family. The aim of the present study was to identify available mutations in exon 2 of GDF9 gene in crossbred sheep (Romanov rams × Lori-Bakhtiari ewes) using PCR-SSCP. In this study, after extraction genomic DNA from blood samples of 36 crossbred animals with 3-6 months old (17 males and 19 females), the first region (from 5’ end) of exon 2 (634bp segments) of GDF9 gene was amplified using PCR. The single stranded conformation polymorphism (SSCP) patterns of PCR products were studied using acrylamide gel electrophoresis and silver staining method and then from any pattern one sample sequenced. In the studied population, 3 banding patterns 1, 2, and 3 obtained with frequencies of 0.305, 0.584 and 0.111, respectively. The sequencing results showed presence of 4 mutations (471, 477, 520 and 721 situations) in the studied population.
- انتشار مقاله: 10-01-1395
- نویسندگان: رسول خدابخش زاده,محمدرضا محمدآبادی,حسین مرادی شهربابک,علی اسمعیلی زاده کشکوئیه
- مشاهده