در هنگام جستجو کلمه در قسمت عنوان میتوانید کلمات مورد جستجو را با کاراکتر (-) جدا کنید.
کاربرد نوع شرط:
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: علوم دامی ایران
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: تنوع ژنتیکی,آنالیز لایهبندی جمعیت,نژاد بومی
- چکیده: استفاده از نشانگرهای مولکولی در سالهای اخیر جهت تعیین تنوع ژنتیکی بین جمعیتها و گونههای مختلف جانوری کاربرد گستردهای یافته است. مطالعات ژنتیک مولکولی، مقایسه تنوع ژنتیکی درون و بین نژادها و بازسازی از تاریخ نژاد و جمعیت اجدادی را امکانپذیر مینماید .این تحقیق با بررسی ساختار ژنتیکی در نژادهای بومی و خارجی با استفاده از 50000 نشانگر SNP با هدف شناسایی تنوع ژنتیکی انجام شد. اطلاعات ژنوتیپی مورد نیاز از پروژه Ovine HapMapشامل نژادهای بومی (نژاد افشاری، مغانی و قزل) و خارجی (نژاد دورپر، مرینوس و رامنی) اخذ گردید. آنالیز آماری با استفاده از چندین روش لایهبندی جمعیت، بررسی ساختار جمعیت با استفاده از آمار چند متغیره بیزی و روش مبتنی بر مدل بررسی شد. نتایج بهدستآمده از آنالیز مشخص مؤلفههای اصلی، تفکیک نژادهای ایرانی و خارجی را بهخوبی نشان داد و هر دو تصویر آشکاری از ساختار ژنتیکی جمعیتهای مورد بررسی را نشان داد. در روش DAPC، برای ارزیابی شمار بهینه خوشه با معیار ارزیابی BIC، 4K=بهترین نتیجه را نشان داد. علیرغم اینکه در این مطالعه از روشهای مختلف برای بررسی ساختار جمعیت استفاده شد، همه این روشها توانستند ساختار جمعیتهای بومی و خارجی را متمایز از هم نشان دهند که نژادهای ایرانی بررسیشده (افشاری، مغانی و قزل) در مقایسه با نژادهای خارجی دارای تشابه ژنتیکی بیشتری بوده و در یک گروه نژادی و نژادهای دورپر، مرینوس و رامنی در گروههای مجزای ژنتیکی قرار گرفتند. البته زمانیکه نژادهای داخلی به تنهایی مورد بررسی قرار گرفتند. این نژادها از لحاظ ژنتیکی کاملاً از هم متمایز بودند و میزان آماره تمایز جمعیتی Fst برای نژادهای افشاری، مغانی و قزل بهترتیب 038/0، 107/0 و 298/0 برآورد شد.
- چکیده انگلیسی: The use of molecular markers in recent years has been widely used to determine the genetic diversity between populations and animal species. Molecular genetics studies allow a comparison of genetic diversity within and across breeds and make a new insight to reconstruct the breed history and history of ancestral populations. The aim of this study was to investigate the genetic structure and genetic variation of indigenous and exotic sheep breeds using 50,000 SNP markers. Genotype data of indigenous breeds (Afshari, Ghezel and Moghani) and exotic breeds (Dorper, Merinos and Romney) were obtained from the Ovin HapMap project. Multiple population stratification analysis such as, population structure using multivariate statistics and model-based approach were applied. The result of all methods obviously showed the correct population differentiation. In DAPC K=4 inferred best cluster results by BIC. Despite the use of different methods, all of these methods showed a distinct structure for indigenous and exotic populations and it can be concluded that Iranian sheep breeds has more genetic similarity rather than exotic breeds and Iranian sheep breeds grouped as one category and Romney, Merinos and Dorper breeds were separated as distant groups. However, when the indigenous breeds were studied alone, the breeds were genetically separated and population differentiation statistic (Fst) for Afshari, Moghani and Qezel was 0.038, 0.107, and 0.298, respectively.
- انتشار مقاله: 29-01-1397
- نویسندگان: رقیه نبی لو,محمد باقر زندی باغچه مریم,محمدطاهر هرکی نژاد
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تحقیقات تولیدات دامی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: وراثت پذیری,چندقلوزایی,گوسفند افشاری,پیشرفت ژنتیکی,ژنFecB
- چکیده: در این تحقیق از اطلاعات ثبت شده تعداد بره متولد شده به ازای هر زایش گوسفند نژاد افشاری به عنوان صفت چندقلوزایی که شامل اطلاعات زایش 1882 رأس میش و اطلاعات تولد 3351 رأس بره بود و در سالهای 1379 تا 1395 در ایستگاه تحقیقاتی دانشگاه زنجان جمعآوری شده بود، استفاده شد. دادهها با استفاده از مدل آستانهای و نرمافزار ASReml در شش مدل مختلف تجزیه و تحلیل شدند. آثار ثابت سال و فصل زایش، سن میش، تعداد شکم زایش و گروه ژنتیکی (در پنج سطح شامل افشاری خالص، 50 درصد افشاری (F1)، 75 درصد افشاری (B1)، 5/87 درصد افشاری (B2) و 75/93 درصد افشاری (B3)) معنیدار بودند (05/0>p ). وراثتپذیری و تکرارپذیری صفت چندقلوزایی در این گله به ترتیب 08/0 و 17/0 برآورد شد. روند ژنتیکی صفت چندقلوزایی در این گله، در دو بازه زمانی از سالهای 1379 تا 1385 (قبل از انتقال ژن، 004/0 رأس، 05/0<p ) و از سالهای 1386 تا 1395 (پس از انتقال ژن، 059/0 رأس، 05/0>p ) برآورد شد. روند فنوتیپی این صفت در بازه اول غیرمعنیدار (37/1 رأس) و در بازه دوم معنیدار (69/1 رأس) برآورد شد (05/0>p ). نتایج نشان داد انتقال ژن FecB و تثبیت آن سبب افزایش چندقلوزایی شده و به دلیل سودآوری بیشتر با استقبال پرورشدهندگان گوسفند مواجه شد. بنابراین برآورد فراسنجههای ژنتیکی و روند ژنتیکی صفت چندقلوزایی در این گله میتواند در تدوین راهبرد پایدار اصلاح نژادی مؤثر باشد.
- چکیده انگلیسی: In this study, data from 1882 ewes, including 3351 lambs born, was used as litter size trait in Afshari sheep breed. The data were collected from 2000 to 2016 by the research station at Zanjan University. The data were analyzed by ASReml software via threshold model in six different models. Fixed effects of year and season, age of ewe, number of parturition and genetic group [at five levels including pure Afshari, 50% Afshari (F1), 75% Afshari (B1), 87.5% Afshari (B2) and 93.75% Afshari (B3)] were significant (p < /em><0.05). Heritability and repeatability were estimated to be as 0.08 and 0.17, respectively. Genetic trends of this trait, in two periods between 2000 to 2006, before the gene introgression design as first period, and from 2007 to 2016, after the introgression as second period, were 0.004 (p < /em>>0.05) and 0.059 (p < /em><0.05), respectively. Also, the phenotypic trends were 1.37 (p < /em>>0.05) and 1.69 (p < /em><0.05) for two periods, respectively. The results showed that the FecB gene transfer increased the litter size. Consequently, because of the direct relationship between the more profitability of flock and the increase in the number of lambs born, the gene transfer design will be followed and more welcomed by sheep breeders. Therefore, genetic parameters and genetic trends estimation of litter size in this flock can be effective for developing continues genetic breeding strategy.
- انتشار مقاله: 19-08-1398
- نویسندگان: مهدی پورطهماسبیان اهرابی,مراد پاشا اسکندری نسب,محمد باقر زندی باغچه مریم
- مشاهده