در هنگام جستجو کلمه در قسمت عنوان میتوانید کلمات مورد جستجو را با کاراکتر (-) جدا کنید.
کاربرد نوع شرط:
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: QTL,جو,سنبله,نسل,نقشهیابی
- چکیده: جو پس از ذرت، گندم و برنج یکی از مهمترین غلات جهان میباشد. بهمنظور نقشهیابی صفات سنبله و دانه در دو نسل F3 و F4 حاصل از تلاقی ارقام بیچر× کویر جمعیتی شامل 103 خانواده F3 و F4 جو در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی طی دو سال زراعی 95-1393 در سه تکرار کشت شد. برای صفات مورد ارزیابی تفکیک متجاوز مشاهده شد که نشاندهنده وجود ترکیبات آللی متفاوت در والدین بود. نقشه پیوستگی با استفاده از نشانگرهای SSR، iPBS،IRAP و ISSR تهیه شد و 640 سانتی مورگان از ژنوم جو را پوشش داد. فاصلهی بین دو نشانگر 69/9 سانتی مورگان برآورد گردید. مکانیابی فاصلهای مرکب پانزده QTL در دو نسل مکانیابی نمود. برای صفات طول ریشک، قطر دانه و طول دانه در هر دو نسل F3 و F4 QTLهایی شناسایی شد. برای طول دانه و تعداد سنبلچه در نسل F4 به ترتیب QTLهای بزرگ اثر با ضریب تبیین 2/12 و 15، با درصد LOD 62/3 و 9/2 در فاصلهی 5/3 و 5/2 سانتیمورگان از نشانگر شناسایی شدند. صفات طول دانه و قطر دانه در نسل F3 با نشانگر iPBS2076-5 پیوسته و هممکان بودند. برای صفات طول ریشک، تعداد سنبلچه، طول دانه و قطر دانه نیز هممکانی شناسایی شد. شناسایی QTLهای کنترلکننده صفات میتواند در بهبود عملکرد مؤثر باشد. انتظار میرود بتوان پس از تعیین اعتبار در مکانها و جمعیتهای مختلف از QTLهای شناسایی شده در این بررسی در برنامههای انتخاب به کمک نشانگر و مکانیابی دقیق استفاده نمود.
- چکیده انگلیسی: Barley is one of the world's grain is the most important corps after maize, wheat and rice.In order to spike and grain mapping in F3 and F4 families in Becher × Kavir cultivars cross in barlypopulation of 103 families with parents in a randomized complete block design with three replications 2014-2016 during two growing seasons. Assessment transgressive segregation was observed that the existence of different allele combinations in their parents. Linkage map were prepared using SSR, iPBS, IRAP and ISSR marker that it covered 640 cM of barley genome. The distance between two markers 9.69 cM were estimated. Composite interval mapping identified fifteen QTLs in F3 and F4 families. QTLs for awn length, grain diameter and grain length was located in both F3 and F4 families. For grain length and number of spikelets in the F4 families was identified the major effect QTL by R2 12.2 and 15, with the percentage LOD 3.62 and 2.9 in 3.5 and 2.5 cM distance markers. Length grain and grain diameter were linked and co-location iPBS2076-5 markers in the F3 generation. co-location QTLs For awn length, number of spikelets, grain length and grain diameter identified. QTL identification characteristics of the controller can be effective in improving performance. It is expected to be followed by validation in various places and populations identified QTL in this study programs used in marker-assisted selection and accurate positioning.
- انتشار مقاله: 18-08-1395
- نویسندگان: رباب دغاغله,حسین صبوری,حسین حسینی مقدم3,عیسی جرجانی,حسینعلی فلاحی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: فیزیولوژی و بیوتکنولوژی آبزیان
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: شبکیه,Alosa braschnikowi,سلول مخروطی
- چکیده: شگ ماهی براشنی کووی (Alosa braschnikowi) با نام عام زالون، از ناحیه غربی جنوب دریای خزر، به منظور شناسایی ویژگیهای زیست شناختی بینایی نوعی ماهی استخوانی سطحزی و ارتباط چشم با تامین غذا در محیط زندگی، مورد مطالعه قرار گرفت. این ماهی شکارچی، گوشتخوار، فاقد خط جانبی و دارای رفتار گلهای است. ماهیهای نر از پرههای صیادی تهیه شدند و شبکیه چشم جهت مطالعات بافتشناسی و عکسبرداری با میکروسکوپ الکترونی آماده شدند. در نتایج به دست آمده، سه نوع گیرنده نوری استوانهای، مخروطی دوگانه و مخروطی منفرد کوتاه شناسایی شد. میانگین تعداد سلولهای مخروطی دوگانه به ترتیب از ربع شکمی- گیجگاهی به سمت ربع پشتی- گیجگاهی در جهت عقربههای ساعت کمتر و قطر سلولها بیشتر میشود. آرایش سلولها در ربعهای پشتی و در پیرامون ربعهای شکمی دارای الگوی موزائیک موازی و در قسمت مرکزی ربعهای شکمی دارای الگوی موزائیک مربع بود. با توجه به پژوهشهای قبلی، آرایش مربع سلولهای مخروطی باعث تیزبینی، تشخیص نور پلاریزه و دقت در شکار میشود. بنابراین دید در جهتهای جلو، بالا و عقب ماهی قوی است. همچنین ربعهای پشتی حساسیت نوری چشم براشنی کووی را در عمقی از آب که سطح نور پایین است، افزایش میدهد.
- چکیده انگلیسی: In order to identify the visual characteristics of pelagic fish eye and their eye relationship with feeding and living environment, Alosa braschnikowi in the west part of north of Caspian Sea was investigated. The eye of male fishes with the average weight of 338±10g were prepared for histological and SEM studies. Three types of light receiving cells including rod, short single cone and twin cone were identified. Tangential retinal sections showed that the diameter of cone cells decreased from periphery to the center. The density of twin cone cells from the ventro-temporal quadrant to dorso-temporal quadrant decreased clockwise orderly and the average of cells' diameter increased in the mentioned sections of retina. The arrangement of cells in dorsal quadrants and in the periphery ventral quadrants followed row mosaic pattern whereas in the central parts of ventral quadrants they were arranged in square mosaic pattern. According to the previous studies, the presence of the square pattern assisted visual acuity, identifying the polarized light and hunting skills. Thus Alosa braschnikowi possess remarkable sight to the up, front and rear orientations. Moreover dorsal quadrants would increase the light sensitivity of fish eye in low light illumination of deeper waters.
- انتشار مقاله: 12-11-1394
- نویسندگان: زهرا حسین زاده,نادر شعبانی پور,عیسی جرجانی,کیاوش گلزاریانپور,سهراب بوذرپور
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: زیست شناسی کاربردی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: ریختشناسی,هسته,تمشک,اندوکارپ,.SEM
- چکیده: در این تحقیق هسته میوه هفت گونه زیرسرده Rubusاز سرده Rubus توسط استریومیکروسکوپ و میکروسکوپ الکترونی (SEM) در شمال ایران مطالعه شد. نتایج نشان داد، که این هستهها دارای طول حدود 4-2 میلیمتر میباشند. بزرگترین هسته-ها مربوط به گونههای R. caesius و R. sanctus و کوچکترین هستهها مربوط به گونههای R. hirtus و R. dolichocarpusمیباشند. شکل هسته کلیوی (R. caesius)، سه ضلعی (R. discolor)، بیضوی (R. dolichocarpus، R. hirtus و R.hyrcanus)، تخممرغی (R. persicus) و مورب (R. sanctus) مشاهده میشود. تزئینات سطح خارجی اندوکارپ نیز بین گونهها متغییر بود به طوری که فرورفتگیهای کم عمق و عمیق در سطح اندوکارپ مشاهده شد. رنگ هسته تمام گونهها سفید میباشد. سطح هسته R. sanctus دارای کرکهای ساده و ستارهای شکل میباشند که سایر گونهها فاقد این صفت می-باشند. بنابراین مطالعه ریزریختشناسی هسته تمشک به عنوان یک صفت سیستماتیکی ارزشمند در شناسایی گونههای Rubus قابل استفاده میباشند.
- چکیده انگلیسی: In order to micro-morphology study of seed Rubus L. seven seed specimens were collected from different habitats in North of Iran stereo and SEM microscopic methods were applied. The characters were evaluated included dimension, shape, size, trichome and ornaments on surface. The results demonstrated that the mean size of seed was 2-4 mm; the biggest pyrenes were seen in R.caesius, R.sanctus and smallest in R.hirtus, R. dolichocarpus. pyrenes were formed in different shapes e.g., reniform (R. caesius), triangular form (R.discolor), elliptical form (R.hirtus, R.dolichocarpus, R.hyrcanus), ovate form (R. persicus) and oblique form (R. sanctus). Ornaments on the endocarp surface were presented variably; proments of surface was varied from low to high in treated species. White color was seen in all examined species. Stellate and simple trichome just presented in R. sanctus. General results confirmed that pyrenes morphology of Rubus were valuable character for identification.
- انتشار مقاله: 18-03-1395
- نویسندگان: راضیه کسلخه,عیسی جرجانی,حسین صبوری,میثم حبیبی,علی ستاریان
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: زیست شناسی میکروارگانیسم ها
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: بهینه سازی,گلیسرول,توئین 80,واژه های کلیدی: آئروموناس هیدروفیلا,جریان الکتریسیته,پروتئازخنثی
- چکیده: چکیده:
مقدمه: تولید مقرون به صرفه پروتئازها یکی از چالش های رو به رو در صنعت آنزیم است. در این راستا، گزارشی در مورد تاثیر جریان الکتریسیته با شدت کم و نانوذرات بر تولید پروتئازهای خنثی موجود نیست. هدف از این مطالعه افزایش بازده تولید پروتئاز توسط آئروموناس هیدروفیلا MSB16 با استفاده از این تیمارهاست.
مواد و روش ها: بدین منظور، نانوذرات مختلف مانند نقره، آهن سه ظرفیتی، آهن، آلومینیوم، روی و مس در غلظت ppm 2 و همچنین جریان الکتریسیته با شدت µA 50 استفاده شد. به علاوه، تولید پروتئاز MS16 در حضور SDS، Tween 80، Triton X-100، Span 80 و گلیسرول مورد بررسی قرار گرفت.
نتایج: در معرض قرار گرفتن با جریان الکتریسیته با سلول های باکتریایی در فاز سکون رشد به مدت 10 و 20 دقیقه تولید پروتئاز در MSB16 به ترتیب 48.2% و 59.1% افزایش می یابد. همچنین، گلیسرول، Tween 80، Span 80 و نانوذره نقره منجر به افزایش تولید پروتئاز به ترتیب برابر با 56.4%، 40.4%، 24.8% و 12.5% شده است.
بحث و نتیجه گیری: در مجموع، سورفاکتانت های غیر یونی، گلیسرول و جریان الکتریسیته می تواند منجر به افزایش تولید پروتئاز سویه MSB16 شود. تاثیر جریان الکتریسیته برتولید پروتئاز سویه MSB16 بستگی به فاز رشد باکتری داشت.- چکیده انگلیسی: Abstract:
Introduction: Cost-effective production of proteases is one of the challenges facing the enzyme industry. In this regard, there are no reports concerning the influence of low-intensity electric current and nanoparticles on microbial neutral proteases production. This study aimed at investigating the effect of these treatments on the neutral protease production of Aeromonas hydrophila MSB16.
Material and Method: The protease production of A. hydrophila MSB16 in the presence of ionic and non-ionic surfactants (SDS, Tween 80, Triton X-100, and Span 80), glycerol as well as various nanoparticles (Ag, Fe III, Fe (0), Al, Zn, and Cu), was investigated. Furthermore, the effect of an electric current (50 µA) exposure to the bacterial cells during the logarithmic and stationary phase for 10 min and 20 min was studied.
Results: According to the results, electric current exposure to the bacterial cells entered the stationary phase for 10 min and 20 min increased the protease production of A. hydrophila MSB16 by 48.2% and 59.1%, respectively. However, this positive effect was not observed for log phase-bacterial cells. Besides, glycerol, Tween 80, Span 80 and Ag nanoparticles enhanced the protease production of A. hydrophila MSB16 by 56.4%, 40.4%, 24.8%, and 12.5%, respectively.
Discussion and Conclusion: Non-ionic surfactants, glycerol, and electric current increased the protease production of A. hydrophila MSB16. Interestingly, the influence of electric current on the protease production of A. hydrophila MSB16 was dependent on the growth phase of the bacterium.- انتشار مقاله: 09-07-1398
- نویسندگان: ماتیا سادات برهانی,زهرا اعتمادیفر,عیسی جرجانی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: زیست شناسی کاربردی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: ریختشناسی,هسته,تمشک,اندوکارپ,.SEM
- چکیده: در این تحقیق هسته میوه هفت گونه زیرسرده Rubusاز سرده Rubus توسط استریومیکروسکوپ و میکروسکوپ الکترونی (SEM) در شمال ایران مطالعه شد. نتایج نشان داد، که این هستهها دارای طول حدود 4-2 میلیمتر میباشند. بزرگترین هسته-ها مربوط به گونههای R. caesius و R. sanctus و کوچکترین هستهها مربوط به گونههای R. hirtus و R. dolichocarpusمیباشند. شکل هسته کلیوی (R. caesius)، سه ضلعی (R. discolor)، بیضوی (R. dolichocarpus، R. hirtus و R.hyrcanus)، تخممرغی (R. persicus) و مورب (R. sanctus) مشاهده میشود. تزئینات سطح خارجی اندوکارپ نیز بین گونهها متغییر بود به طوری که فرورفتگیهای کم عمق و عمیق در سطح اندوکارپ مشاهده شد. رنگ هسته تمام گونهها سفید میباشد. سطح هسته R. sanctus دارای کرکهای ساده و ستارهای شکل میباشند که سایر گونهها فاقد این صفت می-باشند. بنابراین مطالعه ریزریختشناسی هسته تمشک به عنوان یک صفت سیستماتیکی ارزشمند در شناسایی گونههای Rubus قابل استفاده میباشند.
- چکیده انگلیسی: In order to micro-morphology study of seed Rubus L. seven seed specimens were collected from different habitats in North of Iran stereo and SEM microscopic methods were applied. The characters were evaluated included dimension, shape, size, trichome and ornaments on surface. The results demonstrated that the mean size of seed was 2-4 mm; the biggest pyrenes were seen in R.caesius, R.sanctus and smallest in R.hirtus, R. dolichocarpus. pyrenes were formed in different shapes e.g., reniform (R. caesius), triangular form (R.discolor), elliptical form (R.hirtus, R.dolichocarpus, R.hyrcanus), ovate form (R. persicus) and oblique form (R. sanctus). Ornaments on the endocarp surface were presented variably; proments of surface was varied from low to high in treated species. White color was seen in all examined species. Stellate and simple trichome just presented in R. sanctus. General results confirmed that pyrenes morphology of Rubus were valuable character for identification.
- انتشار مقاله: 18-03-1395
- نویسندگان: راضیه کسلخه,عیسی جرجانی,حسین صبوری,میثم حبیبی,علی ستاریان
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: زیست شناسی میکروارگانیسم ها
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: بهینه سازی,گلیسرول,توئین 80,واژه های کلیدی: آئروموناس هیدروفیلا,جریان الکتریسیته,پروتئازخنثی
- چکیده: چکیده:
مقدمه: تولید مقرون به صرفه پروتئازها یکی از چالش های رو به رو در صنعت آنزیم است. در این راستا، گزارشی در مورد تاثیر جریان الکتریسیته با شدت کم و نانوذرات بر تولید پروتئازهای خنثی موجود نیست. هدف از این مطالعه افزایش بازده تولید پروتئاز توسط آئروموناس هیدروفیلا MSB16 با استفاده از این تیمارهاست.
مواد و روش ها: بدین منظور، نانوذرات مختلف مانند نقره، آهن سه ظرفیتی، آهن، آلومینیوم، روی و مس در غلظت ppm 2 و همچنین جریان الکتریسیته با شدت µA 50 استفاده شد. به علاوه، تولید پروتئاز MS16 در حضور SDS، Tween 80، Triton X-100، Span 80 و گلیسرول مورد بررسی قرار گرفت.
نتایج: در معرض قرار گرفتن با جریان الکتریسیته با سلول های باکتریایی در فاز سکون رشد به مدت 10 و 20 دقیقه تولید پروتئاز در MSB16 به ترتیب 48.2% و 59.1% افزایش می یابد. همچنین، گلیسرول، Tween 80، Span 80 و نانوذره نقره منجر به افزایش تولید پروتئاز به ترتیب برابر با 56.4%، 40.4%، 24.8% و 12.5% شده است.
بحث و نتیجه گیری: در مجموع، سورفاکتانت های غیر یونی، گلیسرول و جریان الکتریسیته می تواند منجر به افزایش تولید پروتئاز سویه MSB16 شود. تاثیر جریان الکتریسیته برتولید پروتئاز سویه MSB16 بستگی به فاز رشد باکتری داشت.- چکیده انگلیسی: Abstract:
Introduction: Cost-effective production of proteases is one of the challenges facing the enzyme industry. In this regard, there are no reports concerning the influence of low-intensity electric current and nanoparticles on microbial neutral proteases production. This study aimed at investigating the effect of these treatments on the neutral protease production of Aeromonas hydrophila MSB16.
Material and Method: The protease production of A. hydrophila MSB16 in the presence of ionic and non-ionic surfactants (SDS, Tween 80, Triton X-100, and Span 80), glycerol as well as various nanoparticles (Ag, Fe III, Fe (0), Al, Zn, and Cu), was investigated. Furthermore, the effect of an electric current (50 µA) exposure to the bacterial cells during the logarithmic and stationary phase for 10 min and 20 min was studied.
Results: According to the results, electric current exposure to the bacterial cells entered the stationary phase for 10 min and 20 min increased the protease production of A. hydrophila MSB16 by 48.2% and 59.1%, respectively. However, this positive effect was not observed for log phase-bacterial cells. Besides, glycerol, Tween 80, Span 80 and Ag nanoparticles enhanced the protease production of A. hydrophila MSB16 by 56.4%, 40.4%, 24.8%, and 12.5%, respectively.
Discussion and Conclusion: Non-ionic surfactants, glycerol, and electric current increased the protease production of A. hydrophila MSB16. Interestingly, the influence of electric current on the protease production of A. hydrophila MSB16 was dependent on the growth phase of the bacterium.- انتشار مقاله: 09-07-1398
- نویسندگان: ماتیا سادات برهانی,زهرا اعتمادیفر,عیسی جرجانی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: زیست شناسی میکروارگانیسم ها
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: روششناسی سطح پاسخ,پروتئاز قلیایی,باسیلوس پسودوفیرموس MSB4,روش تک عاملی,طرح مرکب مرکزی چرخش پذیر
- چکیده: مقدمه: پروتئازهای قلیایی خارج سلولی با منشا میکروبی، یکی از مهمترین آنزیمهای صنعتی بوده که کاربردهای فراوان در صنایع مختلف دارند. در این مطالعه، تولید پروتئاز قلیایی باکتری باسیلوس پسودوفیرموس MSB4 با استفاده از روششناسی سطح پاسخ افزایش یافت.
مواد و روشها: چهار متغیر مستقل موثر، بر اساس نتایج به دست آمده از روش تک عاملی (غلظت زایلوز، غلظت عصاره گوشت، pH و دمای انکوباسیون)، به منظور تجزیه و تحلیل الگوی پاسخ و ساخت مدل با استفاده از روش طرح مرکب مرکزی چرخش پذیر انتخاب شدند. طراحی آزمایش، شامل 30 آزمایش دارای 4 تکرار در نقطه مرکزی می شد و هر متغیر در 5 سطح مختلف بررسی شد. به علاوه حضور ژنهای پروتئازهای قلیایی خارج سلولی در سویه MSB4 با استفاده از PCR ارزیابی شد.
نتایج: حداکثر مقدار تولید آنزیم (U/ml 397/185) که حدود 2/2 برابر بیشتر از روش تک عاملی و 7/3 برابر بیشتر از شرایط غیر بهینه است، بر طبق نتایج طرح مرکب مرکزی چرخش پذیر با استفاده از 3 درصد عصاره گوشت، اسیدیته 9 و دمای 37 درجه سانتیگراد به دست آمد. همچنین ژن های sub I, II و apr با سایز مورد انتظار (به ترتیب با 319، 486 و 194 زوج باز) مسؤول متالوپروتئاز و سرین پروتئاز قلیایی خارج سلولی در سویه MSB4 با استفاده از PCR تشخیص داده شدند.
بحث و نتیجهگیری: نتایج آزمایشگاهی به خوبی با مدل به دست آمده سازگاری دارند (9982/0 Adj R2:) و این مدل توانایی زیادی برای پیش بینی متغیر پاسخ برای مشاهدات جدید خواهد داشت (9967/0Pred R2: ). نتایج این مطالعه نشان داد که روش تک عاملی و سطح پاسخ به ترتیب روش مفیدی برای غربالگری و بهینهسازی تولید پروتئاز در سویه MSB4 بودند- چکیده انگلیسی: Introduction: Microbial extracellularalkaline proteases are one of the most important industrial enzymes with a wide range of applications in various industries. In the present study, the production of an alkaline protease by Bacillus pseudofirmus MSB4 was evaluated using response surface methodology (RSM).
Materials and methods: Four significant independent variables were selected, based on the results of one-factor-at-a-time (OFAT) approach (xylose concentration, beef extract concentration, pH and temperature), for rotatable central composite design (RCCD) to analyze the response pattern and to establish a model. The design consisted of total 30 runs, at five levels for each factor, with four replications of the center points. In addition, the presence of extracellular alkaline protease genes was evaluated by using PCR.
Results: Maximum protease production (185.397 U/ml), 2.2 times higher than that of OFAT method and 3.7 times higher than the unoptimized conditions, was obtained by using 3% w/v beef extract, at pH 9 and 37ºC according to the results of RCCD. Furthermore, the genes sub I, II and apr with the expected size (319, 486 and 194 bp, respectively) corresponding to the extracellular alkaline serine protease and metalloprotease were detected in MSB4 by using PCR.
Discussion and conclusion: The experimental data well fitted the model (Adj R2: 0.9982) and the established quadratic model has a great ability to predict responses for new observations (Pred R2: 0.9967). The results showed that the OFAT and RSM strategies were a useful screening and optimization method for enhancing protease production of MSB4, respectively.- انتشار مقاله: 09-03-1395
- نویسندگان: ماتیا سادات برهانی,زهرا اعتمادی فر,عیسی جرجانی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: زراعت و اصلاح نباتات
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی:
- چکیده:
- چکیده انگلیسی:
- انتشار مقاله: 08-04-1396
- نویسندگان: رباب دغاغله,حسین صبوری,حسین حسینی مقدم,عیسی جرجانی,حسینعلی فلاحی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تنشهای محیطی در علوم زراعی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: QTL,نشاسته,پرولین,فنل,نقشه پیوستگی
- چکیده: برنج یکی از مهمترین گیاهان زراعی است و شوری یک محدودیت عمده در توسعه کشت آن است. بهبود بخشیدن به تحمل به شوری در برنج از نظر ژنتیکی، یک مسئله بسیار مهم در برنامههای تولید برنج است. این پژوهش بهمنظور بررسی 96 لاین F8 حاصل از تلاقی رقم اهلمیطارم (مقاوم به تنش شوری) و رقم ندا (حساس به تنش شوری) به تنش شوری در دانشکده کشاورزی دانشگاه گنبدکاووس در سال 1393 به صورت هیدروپونیک انجام شد. نقشه پیوستگی مبتنی بر 96 فرد F8 با استفاده از 30 نشانگر SSR و 15 نشانگر ISSR تهیه شد که 1411.3 سانتی مورگان از ژنوم برنج را پوشش داد. میانگین فاصله بین دو نشانگر مجاور 15.34 سانتی مورگان بود. برای درجه تحمل به شوری یک QTL روی کروموزوم 7 ردیابی شد که توانست 9.3 درصد از تغییرات فنوتیپی صفت را توجیه کند. برای میزان نشاسته یک مکان ژنی روی کروموزوم 4 شناسایی شد که دارای LOD برابر با 2.799 بود. اثر افزایشی برای این QTL برابر با 6.576 بود و 12.6 درصد از تغییرات فنوتیپی صفت را توجیه کرد. برای میزان فنل یک مکان ژنی روی کروموزوم 7 ردیابی شد که 15.2 درصد از واریانس فنوتیپی صفت را توجیه کرد و به ترتیب دارای اثر افزایشی و LOD برابر با 2.728 و 3.438 بود. آللهای والد اهلمیطارم باعث افزایش این صفت شدند. برای میزان کلروفیل یک QTL روی کروموزوم 5 ردیابی شد که LOD آن برابر با 2.02 بود. این QTL به ترتیب دارای اثر افزایشی و ضریب تبیین 9.7 و 9.2 بود بنابراین میتوان QTLهای شناسایی شده را بعد از تعیین اعتبار ژنوتیپهای برتر از نظر صفات بررسی شده برای برنامههای انتخاب به کمک نشانگر استفاده نمود.
- چکیده انگلیسی: Introduction
Rice (Oryza sativa L.) is one of the most important crops in the world, especially in Asian countries that provides energy for more than 2.7 billion people worldwide daily, and is planted on approximately one-tenth of the earth's arable land. Rice is one of the most important cereal and salinity is a major limitation in the development of rice cultivation. Genetically improving salt tolerance of rice is a highly important objective of rice breeding programs. Traits such as salt tolerance are quantitatively inherited. Therefore, mapping quantitative trait loci (QTL) with molecular markers can be very helpful to plant breeders in the field of agricultural genomics. Therefore, the present study was conducted to mapping of genotype code, starch, phenol, proline and chlorophyll content.
Materials and methods
A F8 RILs population, derived from a cross between a salt tolerance Ahlemi Tarom (ATM) and salt sensitive Neda (NAD) which were used in this study. The genetic material involved 96 lines were used to evaluate the salt tolerance. This experiment was conducted at the Gonbad Kavous University at 2014 under hydroponics condition. The seeds were placed 50 ˚C for 3 days to break dormancy, and then germinated at 25 ˚C for four days. Finally, the germinated seeds were sown in holes of the Styrofoam board with a nylon net bottom and roots were placed in water. which floated on water for 3 days, and after were transferred to float on Yoshida's nutrient solution for 11 days. Two weeks after sowing, the seedlings were transferred to nutrient solution with electrical conductivity 6 dSm-1 for 7 days, then NaCl concentration was increased to 12 dSm-1 for further 7 days. This experiment was conducted in a controlled condition with 16-hours photoperiod, temperature of 29/21 ˚C, and minimum relative humidity of 70%. The culture solution was renewed weekly and pH solution was controlled three times a and was fixed constant by adding either NaOH or HCL. Chlorophyll content was measured using a SPAD device. The polymerase chain reaction was performed in a volume of 10 µL for each reaction. Polymerase chain reaction products were then separated using a 6% polyacrylamide gel and stained with fast nitrate of silver. The 96 lines Genetic linkage maps was prepared using 30 SSR markers and 15 ISSR markers covering 1411.3 cM of the rice genome. The average distance between two adjacent markers was 15.34 cM.
Results and discussion
For genotyping code, a QTL was detected on chromosome 7, explained 9.3% of phenotypic variation in the trait. For starch content, a gene locus was identified on chromosome 4, which had a LOD of 2.799. The additive effect for this QTL was 6.756 and explained 12.6% of the phenotypic variation in the trait. For the phenol content, a gene location was detected on chromosome 7, which explained 15.2% of the phenotypic variance of the trait, and had LOD and additive effect of 2.728 and 3.4338, respectively. The allels of the parents of Ahlemi Tarom increased this trait. For a chlorophyll content, a QTL was detected on chromosome 5, with an LOD of 2.2. This QTL had an additive effect and a R2 of 0.097 and 9.2, respectively.
Conclusion
A total of four genetic locations were identified for four traits genotype code, starch, phenol, proline and chlorophyll content, respectively, on chromosomes 7, 4, 7 and 5, and explained 9.3, 12.6, 15.2 and 9.2 % of phenotypic variation of the traits. These locus had a LOD were 2.038, 2.799, 3.438 and 2.02, respectively. No QTL was detected for proline. The results of this study can identify the better genotypes in term of traits checked for marker selection programs.- انتشار مقاله: 24-12-1397
- نویسندگان: فهیمه حسینی راد,عیسی جرجانی,حسین صبوری,ابراهیم غلامعلی پور علمداری
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تاکسونومی و بیوسیستماتیک
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: تنوع ژنتیکی,گلستان,واژههای کلیدی: تمشک,نشانگر AFLP
- چکیده: چکیده
جنس تمشک (Rubus) از خانوادۀ Rosaceae حدود 750 گونه در دنیا دارد که 8 گونه و 5 دورگۀ آن از ایران گزارش شده است. پژوهش حاضر بهمنظور ارزیابی تنوع ژنتیکی 21 جمعیت از 6 گونۀ جنس Rubus در نقاط مختلف استان گلستان با استفاده از 9 ترکیب آغازگری AFLP انجام شد. نرمافزارهای Excel و Pop Gen بهمنظور تجزیهوتحلیل دادهها استفاده شدند. ماتریس تشابه و تجزیۀ خوشهای با نرمافزار Past محاسبه و نمودار بر اساس الگوریتم و UPGMA با استفاده از ضریب تشابه جاکارد ترسیم شد. بر اساس نتایج پژوهش حاضر، 8 ترکیب (از 9 ترکیب آغازگر بررسیشده) چندشکلی مناسبی نشان دادند. از بین ترکیبهای آغازگری، M160-E110 با مقدار 203/0، بیشترین میزان تنوع ژنتیکی را نشان داد و برای بررسی تنوع ژنتیکی بهتر است. آغازگرها در مجموع توانستند 505 مکان را شناسایی کنند که 277 مکان از آنها، چندشکلی نشان دادند.
بر اساس نتایج نمودار، جمعیتهای مطالعهشده به دو گروه تقسیم شدند و جمعیتهای ناحیۀ خزری و ایرانی - تورانی تا حدودی از جمعیتهای متعلق به ناحیۀ خزری جدا شدند. طبق نتایج تجزیۀ ارتباط، بیشترین تعداد نشانگرها با صفتهای طول دمبرگ، طول برگچۀ انتهایی، طول برگچۀ جانبی، طول گلآذین، عرض برگچۀ جانبی و طول دمگل ارتباط داشتند. نتایج پژوهش حاضر نشان دادند نشانگر AFLP کارایی زیادی در جداسازی جمعیتهای گونههای بررسیشده از جنس Rubus دارد.
- چکیده انگلیسی: Abstract
The genus Rubus, from the family ofRosaceae Juss, has about 750 species worldwide, of which 8 species and 5 hybrids have been reported from Iran. The present study was conducted to evaluate the genetic diversity of 21 populations of 6 species of Rubus from different parts of Golestan province using 9 AFLP primer combinations. Excel and Pop Gen software were used for data analysis. Similarity matrix and cluster analysis were used by PAST software. The dendrogram was plotted based on unweighted pair group method with arithmetic average (UPGMA), using Jaccard's similarity coefficient. The results showed that eight out of nine selected primer combinations had appropriate polymorphic primer combinations. M160-E110 with 0.203 had the highest genetic variation among all used markers. All selected primer combinations found 505 position and 277 loci locations. Based on the results of the dendrogram, the studied populations were divided into two groups. Based on the results of the dendrogram, the studied populations were divided into two groups and the Caspian-Irano-Turanian populations were partially separated from the Caspian populations. According to the results of correlation analysis, the highest number of markers were related to traits of petiole length, terminal leaflet length, lateral leaf length, inflorescence length, lateral leaf width, and peduncle length. Results showed that AFLP marker was highly efficient in the separation and isolation of populations of species of Rubus species in this study.
- انتشار مقاله: 18-09-1397
- نویسندگان: راضیه کسلخه,عیسی جرجانی,حسین صبوری,میثم حبیبی,علی ستاریان
- مشاهده