در هنگام جستجو کلمه در قسمت عنوان میتوانید کلمات مورد جستجو را با کاراکتر (-) جدا کنید.
کاربرد نوع شرط:
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: علوم و تکنولوژی محیطزیست
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: هیبریدهای کرم ابریشم,پلی هیدروسیس هسته ای,ماندگاری شفیره ای
- چکیده: بیماری گراسری با عامل مولد پلی هیدروسیس هسته ای (NPV)، عمده ترین آلاینده بیولوژیک و عامل اصلی مرگ و میر کرم ابریشم می باشد. NPV به دلیل دامنه وسیع اثرگذاری بر روی تعداد قابل توجهی از حشرات، جایگاه ویژه ای را در کنترل بیولوژیک حشرات آفات به خود اختصاص داده است.
امروزه پژوهش های نوین به منظور کاربردهای بیوتکنولوژی بر روی NPV در حال انجام می باشد که در آینده نزدیک، افق روشنی را در خصوص حامل های فعال در پروتیین سازی نمایان خواهد نمود.
NPV به دلیل قابلیت های ویژه در همانندسازی سریع، توانایی گسترده ای در سازوکارهای انتقال ژن از خود بروز داده است.
پژوهش حاضر به منظور بررسی میزان اثرات NPV بر روی 9 هیبرید کرم ابریشم در قالب طرح کاملا تصادفی مشتمل بر 5 تکرار برای هر هیبرید و هر تکرار با جمعیتی به میزان 110 عدد لارو پوست اندازی نموده سن چهارم انجام شده است.
سوسپانسیون همولنف لاروهای آلوده پس از خالص سازی بر روی برگ های توت به صورت مصنوعی اسپری شده و تلفات حاصل از بیماری گراسری به صورت روزانه ثبت و جمع آوری شده اند.
نتایج حاصل از این آلوده سازی که با دوز LD50 و به ازای هر لارو 550 پی پی ام صورت گرفته است، نشان می دهد که هیبریدهای 110×107 و ( 104×110)×107 دارای بیشترین پیله سالم و شفیره زنده می باشند و بیشترین مقاومت را از خود بروز داده اند (110×104)×(103×1-m1) و با بیشترین عملکرد پیله در زنده اول تولید قرار دارند. در حالی که koming2× Xinhang3 ، حساس ترین ترکیب ژنتیکی موجود می باشد.- چکیده انگلیسی: 5
- انتشار مقاله: 01-01-1380
- نویسندگان: احمد مهدوی,محمدرضا بیابانی,سید ضیاء الدین میرحسینی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تحقیقات تولیدات دامی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: تئوری اطلاعات,گاو شیری,خوشه بندی ژن,واگرایی کولبکلیبلر
- چکیده: نظریه اطلاعات، شاخهای از ریاضیات است که با مهندسی ارتباطات، زیستشناسی و پزشکی همپوشانی دارد. هدف از بررسی حاضر ارائه روشی جهت خوشهبندی تعدادی از ژنهای موثر روی تولید شیر در گاو شیری با استفاده از الگوریتمی متکی بر واگرایی کولبک - لیبلر بود. در این پژوهش بعد از استخراج توالی DNA ژن و اگزونهای موثر بر تولید شیر در گاو شیری، فراسنجه آنتروپی در مراتب یک تا چهار برای هر ژن و اگزونهای هر ژن محاسبه شد. جهت استخراج فاصله میان ژنها از یکدیگر، از واگرایی کولبک - لیبلر در سه روش مختلف استفاده شد. روشهای اول و دوم مبتنی بر همترازی ولی روش سوم غیر مبتنی بر همترازی و بر پایه آنتروپی نسبی ژنها بود. نتایج هر سه روش واگرایی کولبک - لیبلر روی توالی DNA ژنها و اگزونها با استفاده از هفت روش معمولSingle ،Complete ،Average ،Weighted ، Centroid، Medianو KMeansخوشهبندی شدند. تجمیع نتایج هر خوشهبندی که با الگوریتم AdaBoost انجام شد، و خود نوعی درخت ژنی را تداعی کرد، نشان داد که روش سوم، خوشهبندی معقولی را از نظر زیستی برای مجموعهای از ژنها حاصل نمود چرا که با نتایج حاشیهنویسی ژنومی ژنهای حاصل ازGeneMANIA مطابقت داشت. این اعتقاد وجود دارد که روش ارائه شده برای ایجاد درخت ژنی میتواند با سایر روشهای متکی بر توالی DNA ژنها جهت خوشهبندی مجموعهای از ژنها، رقابت نماید و لذا میتواند در گروهبندی ژنهای سایر گونهها نیز بکار رود.
- چکیده انگلیسی: Information theory is a branch of mathematics that overlaps with communications, biology. The aim of the current study was to provide a method for clustering a number of Milk Governing Genes in Dairy Cattle using an algorithm based on Kullback-Leibler divergence. In this study, after retrieving gene and exon DNA sequences affecting milk yield in dairy cattle, the entropy in orders one to four was calculated. In order to extract gene distances, Kullback-Leibler divergence over three different methods was calculated. The first and second methods were based on the genes alignment but the third method was based on non-alignment and the relative entropy of the genes. The results of each method of Kullback-Leibler divergence over DNA and exon sequences were entered as input into 7 general clustering algorithms: Single, Complete, Average, Weighted, Centroid, Median and K-Means. Integrated result of each clustering algorithm due to AdaBoost algorithm, which implied as gene tree, indicated that the third method was based on the relative entropy of the genes, biologically grouped set of genes as it was proved by their gene annotation using GeneMANIA. We believe that the proposed method might be used with other DNA based clustering competitive methods and therefore, it can be used to group set of genes in other species.
- انتشار مقاله: 05-06-1396
- نویسندگان: هوشنگ دهقان زاده,سید ضیاء الدین میرحسینی,مصطفی قادری زفرهیی,حسن توکلی,سعید اسماعیل خانیان
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تحقیقات تولیدات دامی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: QTL,نشانگرهای ریزماهواره,بز مرخز,نرخ چندقلوزایی
- چکیده: صفت چندقلوزایی از جمله صفات آستانهای میباشد که بهوسیله ژنهای زیادی کنترل میشود. به دلیل وراثتپذیری پایین این صفت (حدود 10/0) استفاده از روشهای کلاسیک اصلاح نژاد، پیشرفت کندی دارد. بنابراین، نیاز به استفاده از فناوریهای جدید در بهبود این صفت میباشد. طول کروموزوم 1 بز حدود 186 سانتی مورگان میباشد. با توجه به تحقیقات پیشین و همولوژی بالای نقشه ژنومی گاو و بز، در این تحقیق منطقه بین 16 تا 169 سانتیمورگان از کروموزوم 1 برای مکانیابی جایگاه ژنتیکی صفت چندقلوزایی بز مرخز انتخاب شد. جمعیت مورد مطالعه شامل 8 خانواده ناتنی پدری غیرخویشاوند بود. تعداد فرزندان به ازای هر پدر در دامنه 30 تا 40 فرزند قرار داشتند. همه افراد برای 6 نشانگر ریزماهواره مربوط به کروموزوم 1 تعیین ژنوتیپ شدند. مکانیابی QTLهای کنترل کننده صفت چندقلوزایی در خانوادههای ناتنی پدری با استفاده از نرم افزار GridQTL انجام گرفت. نتایج این تحقیق بیانگر تفرق یک QTL موثر بر چندقلوزایی در موقعیت 165 سانتیمورگان کروموزوم 1 بز مرخز بود. مکان QTL تعیین شده در نزدیکی نشانگر CSSM19 قرار داشت و توانست 20/2 درصد تغییرات ژنتیکی صفت چندقلوزایی را توصیف کند. QTL مکانیابی شده در این پژوهش میتواند در ارتباط با ژن POU1F1 باشد. بنابراین این ژن میتواند یک ژن کاندید برای اثرات مشاهده شده QTL بر صفت چند قلوزایی در بز مرخز باشد.
- چکیده انگلیسی: The litter size is a threshold trait that is controlled by many genes. Due to the low heritability (0.10), of litter size, classical breeding methods lead to slow genetic progress. Hence it is essential to use new technology to improve this trait. Length of chromosome 1 in goat is approximately 186 cM. Based on previously published data in addition to a high genetic homology between goat and cattle choromosome 1, a region between 16 to 169 cM of chromosome 1 was selected for QTL detection of litter size in the Markhoz goat breed. Sample population included 8 paternal half-sib families. The numbers of half-sib offspring per buck ranged from 30 to 40. All individuals were genotyped by six microsatellites specific to chromosome 1. QTL analyses were performed using multiple regression method under a half-sib model. Our study indicated that a QTL in position 165 cM on chromosome 1 affect litter size rate in Markhoz goats. Its location was near to CSSM19 marker and was able to explaining 2.20 percent of the genetic variance of litter size. The QTL detected in this research could be related with POU1F1 gene. Hence this gene could be a candidate for the associated QTL on goat chromosomes 1.
- انتشار مقاله: 31-02-1394
- نویسندگان: نجات بادبرین,سید ضیاء الدین میرحسینی,بابک ربیعی,نوید قوی حسین زاده
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تحقیقات تولیدات دامی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: Real-time PCR,cDNA,بیان ژن,آمیخته گری,IL8RB
- چکیده: یکی از گیرندههای کموکاینها در سطح نوتروفیلها IL8RB است که برای حداکثر کارآیی نوتروفیلها در زمان بروز عفونت حیاتی است. تفاوت در توالی و بیان ژن IL8RB منجر به ایجاد تفاوت در مقاومت به ورم پستان در جمعیتهای مختلف گاو میشود. هدف از این مطالعه بررسی تغییرات میزان بروز ژن IL8RB در نتیجة آمیختهگری در گاوهای بومی استان گیلان با گاوهای اصیل هلشتاین است. به این منظور 56 نمونه خون از 5 جمعیت گاو ایستگاه اصلاح نژاد گاو بومی استان گیلان جمعآوری شد. پس از استخراج RNA و ساخت cDNA، واکنشهای real-time PCR در تمامی نمونهها و با سه تکرار برای هر نمونه انجام گرفت. از ژنهای GAPDH و RPLP0 برای کنترل داخلی استفاده شد. بیشترین متوسط بیان ژن IL8RB (77/0±74/0) در جمعیت گاوهای بومی و کمترین میزان بیان این ژن (22/0±12/0) در گاوهای آمیختة 75 درصد هلشتاین بدست آمد. بیشترین به کمترین متوسط بیان این ژن در پنج جمعیت با استفاده از روش پافل به ترتیب شامل گاو بومی (77/0±74/0) ، گاو آمیختة 50 درصد پدر بومی و مادر هلشتاین (27/0±3/0) ، گاو آمیختة 50 درصد پدر هلشتاین و مادر بومی (3/0±26/0)، گاو هلشتاین (26/0±23/0) و گاو آمیختة 75 درصد هلشتاین (22/0±12/0) بود. چون بیان این ژن در گاو بومی بیشترین (77/0±74/0) مقدار بود بود و افزایش سهم خونی گاو هلشتاین که نسبت به ورم پستان حساس است در دامهای آمیخته سبب کاهش بیان این ژن شد، لذا میتوان تغییرات بیان این ژن را با مقاومت به ورم پستان مرتبط دانست. با توجه به اینکه این مطالعه تأثیر آمیختهگری در تغییر بیان ژن IL8RB را به خوبی نشان داد، ضروری است عواقب آمیختهگری در برنامه اصلاح نژاد گاو بومی پیشبینی شود.
- چکیده انگلیسی: IL8RB gene is one of the chemokine receptors presented on neutrophil surfaces which are necessary for maximizing of neutrophils ability during infection. Different sequence and expression of IL8RB gene lead to different resistance to mastitis in cow populations. The aim of current study was to investigate expression changes of IL8RB gene resulted from crossbreeding of Guilan Native cows with Holstein cows. We collect 56 blood samples from 5 different cow populations in Guilan Native cattle breeding center. After RNA extraction and cDNA synthesis, real-time PCR reactions were performed in all samples with three repeats for each sample. We used GAPDH and RPLP0 as internal reference control genes. The maximum amount of IL8RB gene (0.74±0.77) average normalized expression was in Native cow populations and the minimum expression (0.12±0.22) was in 75 percent Holstein crossbred cow populations. Highest to lowest amount of IL8RB gene average normalized expression was in Native cow (0.74±0.77), 50 percent sire Native and dam Holstein crossbred cow (0.3±0.27), 50 percent sire Holstein and dam Native crossbred cow (0.26±0.3), Holstein cow (0.23±0.26), and 75 percent Holstein crossbred cow (0.12±0.22), respectively. With Consideration of highest gene expression in Native cow and decreasing in gene expression respect to increasing in blood contribution of Holstein cow which they are sensitive to mastitis, consequently changes in gene expression of IL8RB are related to resistance to mastitis. As this study showed the effect of crossbreeding on IL8RB gene expression changes, then it is necessary to consider the consequences of crossbreeding on native cattle breeding program.
- انتشار مقاله: 26-03-1394
- نویسندگان: میثاق مریدی,سید حسین حسینی مقدم,سید ضیاء الدین میرحسینی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تحقیقات تولیدات دامی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: PCR-RFLP,پروتئین شیر,چند شکلی ژنی,کاپاکازئین,گاو بومی گیلان
- چکیده: در این پژوهش رابطه ژنوتیپهای ژن کاپاکازئین با صفات تولیدی در گاوهای بومی استان گیلان بررسی شد. از 100 راس گاو ماده در فومن، رشت و آستانه اشرفیه خونگیری به عمل آمد. استخراج DNA با استفاده از روش شستشوی نمکی بهینه انجام گرفت. با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی، قطعهای به طول350 جفت باز از ژن کاپا کازئین با استفاده از واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) تکثیر شد. جهت تعیین ژنوتیپ ژن کاپاکازئین با استفاده از نشانگر PCR-RFLP، محصول واکنش زنجیرهای پلیمراز به وسیله آنزیم Hinf I هضم شد. فراوانی مشاهده شده ژنوتیپهایAA ،AB و BB بهترتیب 48/0 ، 52/0 و 00/0 و فراوانی آللهای A و B بهترتیب 74/0 و 26/0 بود. بر اساس نتایج آزمون مربع کای، جمعیتهای مورد بررسی در تعادل هاردی-واینبرگ قرار نداشتند. مقایسه میانگین حداقل مربعات در این جایگاه نشان داد که اثر چندشکلی بر صفات تولید شیر، درصد چربی و درصد پروتئین معنیدار بود (01/0P<). تولید شیر روزانه گاوهای با ژنوتیپ AA در مقایسه با گاوهای با ژنوتیپ AB بیشتر بود (به میزان 81/0 کیلوگرم ). همچنین درصد چربی و پروتئین شیر گاوهای دارای ژنوتیپ AB نسبت به گاوهای با ژنوتیپ AA بیشتر بوده است (به ترتیب 1/0 و 14/0). در تحقیق حاضر گاوهای دارای ژنوتیپ AB نسبت به افراد با ژنوتیپ AA درصد چربی شیر بالاتری داشتند (01/0>P) و ژنوتیپ AA دارای درصد چربی و درصد پروتئین کمتر بود.
- چکیده انگلیسی: In this research, the relationship between polymorphism of CSN (Kappa-Casein) gene and production traits in Guilan native cattle was studied. Blood samples were taken from 100 cows Fouman, Rasht and Astaneh-ye-Ashrafiyeh. Genomic DNA was extracted by modified salting out method. A 350 bp fragment of the bovine kappa-CSN gene was amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) using a specific primer. The PCR products were digested by Hinf I to determine kappa-casein genotypes with PCR-RFLP marker. Observed frequencies for genotypes AA, AB, BB were 0.48, 0.52, 0.00 and allelic frequencies for A and B were 0.74 and 0.26, respectively. The chi-square test results showed that the studied population were not at Hardy-Weinberg equilibrium. Comparison of least square means indicated that the polymorphism has a significant effect on milk yield, fat and protein percentage (P<0.01). The cows with genotype AA produced 0.81 kg more milk over the cows with genotype AB. The cows with genotype AB produced 0.1 and 0.14 percentages higher milk fat content compare to the cattle with genotypes of AA (P<0.01). The results also revealed that the cattle with genotypes of AA produced milk with lowest fat and protein content.
- انتشار مقاله: 01-11-1395
- نویسندگان: فردین ناظمی,سید ضیاء الدین میرحسینی,نوید قوی حسین زاده,هوشنگ دهقان زاده,مختار مهدیزاده
- مشاهده