در هنگام جستجو کلمه در قسمت عنوان میتوانید کلمات مورد جستجو را با کاراکتر (-) جدا کنید.
کاربرد نوع شرط:
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: علوم دامی ایران
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: چندشکلی تکنوکلئوتیدی,IGF1,صفات مرتبط با رشد,گاو بومی ایران,IGF1/SnaBI
- چکیده: فاکتور رشد شبهانسولین (IGF-1) یک هورمون پپتیدی است که ساختار مشابهی با هورمون انسولین داشته و روی کروموزوم شمارة 5 گاو قرار دارد. IGF-1 نقش مهمی در رشد و نمو بافتهای مختلف بدن ایفا میکند. هدف از پژوهش حاضر، بررسی چندشکلیهای موجود در ژن IGF-1 و تأثیر آن بر صفات مرتبط با رشد در گاوهای سیستانی است. نمونههای خون از ورید گردنی 53 رأس گاو سیستانی )یکساله( گرفته شد و استخراج DNA به روش نمکی بهینهیافته از خون کامل انجام گرفت. تکثیر یک قطعه 249 جفت بازی از ناحیة اگزون 1 ژن IGF-1 توسط واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی صورت گرفت. وجود جهش نقطهای و تعیین ژنوتیپهای موجود در این جایگاه در هریک از نمونهها با استفاده از آنزیم برشی SnaBI انجام گرفت و روی ژل آگارز 2 درصد الکتروفورز شد. نتایج از وجود دو آلل A و B در جایگاه مورد مطالعه حاکی بود که فراوانی آنها به ترتیب 25/0 و 75/0 محاسبه شد. سه الگوی ژنوتیپی جایگاه مورد مطالعه شامل AA، AB و BB دارای فراوانیهای ژنوتیپی به ترتیب برابر با 057/0، 396/0 و 547/0 بودند. آزمون مربع کای برای ناحیة اگزون 1 ژنIGF-1 در جمعیت گاو سیستانی مورد مطالعه، بیانگر برقراری تعادل هاردی-واینبرگ بود. آنالیز ارتباط ژنوتیپها در این جایگاه با دادههای مرتبط با صفات رشد اختلاف معناداری (05/0P<) را بین ژنوتیپهای AA و AB نشان داد. بر اساس نتایج تحقیق حاضر میتوان نتیجه گرفت که ژن IGF-1 میتواند بهعنوان ژن کاندیدا برای صفات مرتبط با رشد در برنامههای بهنژادی گاو سیستانی استفاده شود.
- چکیده انگلیسی: Insulin-Like Growth Factor-I (IGF-1) is a peptide hormone which is similar in molecular structure to insulin and it is located on chromosome 5 in cattle. Since the IGF-1 plays an important role in the growth and development of multiple tissues, the purpose of current study was to identify the IGF-1 gene polymorphism in Sistani beef cattle. A total of 53 Sistani beef cattle (one year) were randomly selected and blood samples were drawn from the cervical vein. DNA was extracted from the whole blood with modified salting-out method. A 249 bp length fragment in exon 1 of IGF-1 gene was amplified by polymorphism chain reaction by using specific primer pairs. Genotyping of each sample was performed by using restriction enzyme SnaBI and electrophoresed on 2% agarose gel. The results revealed the existence of two alleles A and B for the examined locus with the frequencies of 0.25 and 0.75, respectively. Three different genotypic variants including AA, AB and BB were identified with genotypic frequencies of 0.057, 0.396 and 0.547, respectively. Chi square test based on observed and expected frequencies of different genotypic variants of the exon 1 of IGF-1 gene in Sistani cattle population showed that deviation from Hardy-Weinberg equilibrium was not significant. Analysis associate of the studied genotypes and growth related traits showed significant effects between AA and AB genotypes (P<0.05). On the basis of obtained results it was revealed that the IGF-1 gene can be used as a candidate gene for growth related traits in Sistani population.
- انتشار مقاله: 02-01-1393
- نویسندگان: سمیه علی پور,غلامرضا داشاب,مسعود علی پناه,محمد رکوعی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: علمی- ترویجی (حرفهای) دامستیک
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: یادگیری ماشین,جنگل تصادفی,یادگیری عمیق,ارزش اصلاحی,الگوریتم ژنتیکی,روشهای غیرپارامتریک
- چکیده: هدف از انتخاب ژنومی استفاده همزمان از دادههای ژنوتیپی به همراه دادههای فنوتیپی است تا بتوان در مدت زمان کوتاه، دامها را ارزیابی نموده و دامهای برتر از نظر ژنتیکی را گزارش نمود. توسعه الگوریتمهای داده کاوی مرتبط با اَبر دادهها در عصر دیجیتال در برآورد ارزشهای اصلاحی نقش قابل توجهی در اصلاحنژاد دام و طیور ایفا میکند. اخیراً روشهای یادگیری ماشین و الگوریتمهای زیرمجموعۀ آن مانند یادگیری عمیق، جنگل تصادفی، ماشین بردار پشتیبان و بوستینگ که جزء روشهای غیرپارامتریک هستند، به مباحث انتخاب ژنومی وارد شدهاند. یکی از مزایای روشهای یادگیری ماشین، پتانسیل و کارآیی بسیار بالای آنها به خصوص برای دادههای با حجم بالا یا به اصلاح اَبر دادهها و برآورد اثرات غیرافزایشی مانند غالبیت و اپیستازی و همچنین بررسی روابط پیچیده بین متغیرها (مانند اثرات متقابل بین نشانگرها) است. ایده اصلی در این الگوریتمها استفاده از دادههای آموزشی (در این جا اطلاعات ژنوتیپی و فنوتیپی حیوانات جمعیت مرجع) است تا الگوریتم براساس اطلاعات ژنوتیپی افراد جمعیت کاندید، ارزشهای اصلاحی ژنومی آنها را پیشبینی نماید. برخی از این روشها به طور موفقیتآمیزی در ارزیابیهای ژنومی مورد استفاده قرار گرفتهاند و نتایج قابل قبولی را با حداقل خطای ممکن ارائه دادهاند. در واقع هدف از این مطالعه بیانِ تعریفی از رویکرد یادگیری ماشین و الگوریتمهای زیرمجموعۀ آن و نیز نقش آنها در پیشبینی معماری ژنتیکی صفات با وراثتپذیری پیچیده است. در نتیجه، احتمالاً استفاده از رویکرد یادگیری ماشین با هدف یافتن کارآمدترین الگوریتم، همزمان با افزایش حجم دادههای فنوتیپی و ژنومی تأثیر قابل توجهی در آینده اصلاحنژاد دام و طیور، به ویژه پیشرفت ژنتیکی دامها به دنبال خواهد داشت.
- چکیده انگلیسی: Genomic selection strives to make use of genotypic and phenotypic data, simultaneously, in order to evaluate animals genetically in a short period of time to opt superior ones. The development of data mining algorithms related to big data analysis in the digital era makes a great contribution to estimating breeding values in livestock and poultry breeding. Recently, machine learning procedures and their sub-algorithms such as Deep Learning (DL), Random Forest (RF), Support Vector Machine (SVM), and boosting, which are categorized as non-parametric animal evaluation methods, have been introduced to the realm of genomic selection. Machine learning algorithms not only provide breeders with much more potential and efficiency but also they are more adapted with big data. These algorithms enable breeders to estimate non-additive effects such as dominance and epistasis, as well as studying of complex relationships between variables (such as marker interactions). The punch line of these algorithms is to use training data (here the genotypic and phenotypic information of the animals in reference population) to predict their genomic breeding values based on the genotypic information of the candidate population. Some of these methods have been used successfully in animal genomic evaluations and they have provided acceptable results with low error. In fact, the purpose of this study is to define machine learning approaches and their sub-algorithms besides their role in predicting the genetic architecture of traits with complex heritability. As a result, it is likely that using machine learning approach to find the most efficient algorithm, along with increasing the volume of phenotypic and genomic data, will have a significant impact on the future of livestock and poultry breeding.
- انتشار مقاله: 27-06-1399
- نویسندگان: فرزاد غفوری,سمیه علی پور,صادق محمدیان جشوقانی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: پژوهش و برنامهریزی شهری
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: پاکسازی,تخریب,اسکان غیررسمی,اسلامآباد
- چکیده: ناهنجاری و ناپایداری اسکان و سکونت اگرچه ریشهای دیرپا در سرزمین ما دارد اما تظاهر آن در اشکال حاشیهنشینی، اسکان غیررسمی، کانونهای خودرو و اسکان غیرقانونی و نامتعارف به عنوان محصول شرایط جدید شهرنشینی در کشور است به طوری که بیش از 50 درصد ساکنان شهرهای کم درآمد و 20 درصد ساکنان کشورهای با درآمد متوسط را نیز به خود اختصاص دادهاند. این پدیده به شیوه فعلی و مرسوم در ایران از دهه 1320 آغاز و تا اواخر دهه 1350 به شدت نسبتاً زیادی روند گسترش خود را طی نموده است. هدف این پژوهش بررسی فرآیند شکلگیری اسکان غیررسمی در منطقه اسلامآباد و در نهایت بررسی نتایج طرح تخریب و پاکسازی منطقه بعد از گذشت دو دهه از ابتدای اجرای طرح است. نوع پژوهش کاربردی و روش آن تحلیلی – توصیفی و گردآوری اطلاعات به صورت کتابخانهای، اسنادی و میدانی بوده و جهت نمایش روند انجام طرح از تصاویر ماهوارهای دورهای استفاده شده است. یافتههای پژوهش نشان میدهد که اسکان غیررسمی در منطقه اسلامآباد از سال 1311 با ثبت تپه مرادآب به عنوان مرتع مشاع قریه بیلقان و با هجوم مهاجران با ریشه روستایی به آن شکلگرفته و از سال 1347 با اعلام تپه به عنوان اراضی ملی از سوی وزارت منابع طبیعی منطقه مستعد شکلگیری سکونتگاهی غیررسمی شده است. طرح تخریب و پاکسازی منطقه نیز از سال 1374 برای محدوده 72 هکتاری منطقه آغاز شده است و تا پایان سال 1391 تعداد 3978 واحد تخریب شده است که 715 واحد آن در دهه اول و تعداد 3182 واحد آن در دهه دوم تخریب و پاکسازی شدهاند. با گذشت 17 سال از شروع طرح تعداد 14512 نفر تا سال 1380 و تعداد 15056 نفر در دهه دوم که جمعاً 29568 نفر از منطقه اسلامآباد منتقلشدهاند.
- چکیده انگلیسی: Deformity and instability in settlement and habitation although rooted in our country but its appearance in informal settlements forms and illegal settlements is product of new urbanization condition in our country so that included more than 50 percent low-income urban residents and 20 percent of middle-income countries. This phenomenon is common to current practices in the decade beginning in 1941 until late 1971; during its growth has relatively high intensity. The purpose of this study was to investigate the formation of informal settlements in Islamabad and also assessment of demolition and clearance policy results after the first two decades of this plan. Research type is applied research and methods are analytical and descriptive, data collection performed by library, documentary and field also for shows of implementation plan, satellite imagery was used in this research. The results indicate that informal settlements in case study area embodied since 1932 with sign Moradab hill as pasture in Bylqan condominium village with rural influx of immigrants, since 1968 with announcing this hill as national land by Department of Natural Resources this area is prone to formation of informal settlement. the demolition and clearance plan in this area has been started from 1995 for 72 hectares and till end of 2012 more than 3978 housing unit cleared that 715 units is related to first decade and 3182 units in second decade. Over 17 years from the start of project 14,512 people till 2001 and 15,056 in the second decade and totally 29,568 people have been moved from Islamabad area.
- انتشار مقاله: 13-10-1392
- نویسندگان: محسن احدنژاد,سمیه علی پور
- مشاهده