در هنگام جستجو کلمه در قسمت عنوان میتوانید کلمات مورد جستجو را با کاراکتر (-) جدا کنید.
کاربرد نوع شرط:
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: برنج,جوانه زنی,انتخاب به کمک نشانگر,مکان های ژنی کنترل کننده صفات کمی
- چکیده: هدف: هدف از پژوهش حاضر، تهیه نقشه پیوستگی نشانگرهای SSR و ISSR در جمعیت برنج ایرانی و مکانیابی QTLهای دخیل در تحمل شوری و همجنین ارزیابی تحمل ژنوتیپهای مورد بررسی به تنش شوری بود.
مواد و روشها: به منظور شناسایی QTLهای تحمل به تنش شوری آزمایشی در مرحله جوانهزنی بر روی یک جمعیت برنج ایرانی (حاصل از تلاقی اهلمی طارم × ندا) به صورت فاکتوریل در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی با سه سطح تیمار شوری NaCl (0، 12، 22 دسیزیمنس بر متر) و سه تکرار انجام شد.
نتایج: اختلاف بین لاینهای جمعیت در سطوح مختلف شوری برای کلیه صفات مرتبط با جوانهزنی معنیدار بود. در شرایط نرمال، 4، 1، 2 و 1 QTLبه ترتیب برای وزن ریشهچه، وزن ساقهچه، درصد جوانهزنی و سرعت جوانهزنی ردیابی شد. در تنش شوری 12 دسیزیمنس بر متر به ترتیب 1، 1، 1، 2، 1 و 1 QTLبرای وزن گیاهچه، وزن ساقهچه، طول ریشهچه، طول کلئوپتیل، درصد جوانهزنی و سرعت جوانهزنی مشخص شد و در شوری 22 دسیزیمنس بر متر، به ترتیب 2، 1، 1 و 1 QTL برای وزن ریشهچه، طول گیاهچه، درصد جوانهزنی و سرعت جوانهزنی مکانیابی شد.
نتیجه گیری: QTLهای بزرگ اثر در این پژوهش نقش مهمی را در تحمل به شوری ایفا نمودند و میتوانند در برنامههای انتخاب به کمک نشانگر جوانهزنی برنج در شرایط شور مورد بررسی قرار گیرند.
- چکیده انگلیسی: Objective
This experiment was conducted for developing of linkage map using SSR and ISSR markers in Iranian rice population, mapping of QTLs involved in salinity tolerance, and also evaluation of salinity tolerance in studied genotype.
Materials and Methods
In order to determine the salinity tolerance QTLs in a germination stage on an Iranian rice population (caused Ahlami Tarom × Neda cross), a factorial experiment was performed based on a randomized complete block design with three replications under three salinity levels of NaCl (0, 12, 22 dS.m-1).
Results
The difference between populations in different levels of salinity was significant for all germination traits. Under normal conditions, 4, 1, 2 and 1 QTLs were detected for radicle weight, plumule weight, germination percentage and germination rate, respectively. In 12 dS.m-1, 1, 1, 1, 2, 1 and 1 QTL for seedling weights, plumule weight, radicle length, coleoptile, germination percentage and germination rate. In 22 dS.m-1, 2, 1, 1 and 1 QTL were located for radicle weight, plant length, germination percentage and germination rate.
Discussion
The major effects of QTLs in this study played an important role in salinity tolerance and can be studied in marker assisted selection programs in rice under saline conditions.- انتشار مقاله: 25-12-1397
- نویسندگان: محمد جواد بهروزبه,حسین صبوری,حسین حسینی مقدم,علی نخزری مقدم,علی راحمی کاریزکی,محسن رضایی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: ورم پستان,بیوانفورماتیک,KEGG,ریز RNA,مسیر پیامرسانی سلولی
- چکیده: هدف: کنکاش مسیرهای پیامدهی در بیماریهایی مثل ورم پستان در گاو شیری که بیشتر تحت تاثیر فرایندهای فراژنتیک هستند، ضروری به نظر میرسد.
مواد و روشها: در این پژوهش 5 مولکول ریزRNA کاندید با شماره دسترسیهای bta-mir- 223،bta-mir 21-5p ، bta-mir-181، bta-mir-146a و bta-mir-16a در منابع شناسایی و استخراج شدند و با استفاده از پایگاه داده Mirtarbase و پایگاه داده Targetscan به ترتیب ژنهای هدف تایید شده و پیشبینی شده برای هر یک از ریزRNAهای بالا استخراج شدند. سپس بیان ژنهای هدف پیشبینی شده و تایید شده برای هر یک از ریزRNAهای بالا در بافت غدد پستانی در پایگاه NCBI بررسی شدند. علاوه بر این با استفاده از نرم افزار DAVID، مسیرهای پیامرسانی سلولی در KEGG مشخص شدند.
نتایج: بر اساس نتایج بدست آمده مشخص شد که ریز bta-mir-146a RNAاز طریق تاثیر بر 7 پروتئین، و ریز RNA bta-mir-223 از طریق تاثیر بر 11 پروتئین و ریز bta-mir 21-5p RNA از طریق تاثیر بر 9 پروتئین در مسیرهای پیامدهی سلولی مختلفی درگیر هستند، و لذا احتمالا در بیماری ورم پستان گاو شیری نقش دارند. همچنین نتایج نشان داد که دو ریز bta-mir-181 RNAو bta-mir-16a در مسیرهای پیامدهی مهمی مثل GnRH signaling pathway، Estrogen signaling pathway، Progesterone-mediated oocyte maturation، Oxytocin Signaling Pathway و MAPK Signaling Pathway نقش مهمی را بازی میکنند.
نتیجه گیری: این پژوهش نشان میدهد که ریزRNAهای مورد بررسی میتوانند به عنوان نشانگرهای مولکولی، در علت یابی ملکولی بیماری ورم پستان گاو شیری نقش مهمی ایفا کنند.- چکیده انگلیسی: Objective
It is reasonable to investigate the signaling pathways in diseases such as mastitis in dairy cattle, which are more likely to be affected by epigenetics.
Materials and methods
In this research, 5 microscopic RNA molecules with the accession numbers bta-mir-223, bta-mir 21-5p, bta-mir-181, bta-mir-146a and bta-mir-16a in the sources were identified and extracted from the literatures. Using mirtarbase and targetcan databases, respectively, the confirmed and predicted target genes were extracted for each of the top microRNAs, respectively. Subsequently, the expression of the predicted and confirmed target genes for each of the top microRNAs in the mammary gland tissue was investigated at the NCBI database. In addition, using the DAVID software, cellular signaling pathways were identified in KEGG.
Results
Based on the results, bta-mir-146a microRNA through effects on of 7 proteins, and microRNA bta-mir-223 through effects on 11 proteins and micro RNA bta-mir21-5p through effects on 9 proteins, involved in various cellular signaling pathways, sought to be involved in mastitis in dairy cattle. The results also showed that two bata-mir-181 and bta-mir-16a played an important role in crucial pathways such as the GnRH signaling pathway, Estrogen signaling pathway, Progesterone-mediated oocyte maturation Oxytocin Signaling Pathway and MAPK Signaling Pathway.
Conclusions
This study shows that the microRNAs can be used as molecular markers to dissect molecular etiology of mastitis in dairy cattle.
Biranvad Z, Ghaderi-Zefrehei M, Mirhoseini SZ, Hosseini Moghaddam SH, Fazeli A (2019) Bioinformatics study of the role of micro RNAs bta-mir-146a, bta-mir-223, bta-mir 21-5p, bta-mir-181 and bta-mir-16a in the cellular signaling pathways of mastitis in dairy cows. Agricultural Biotechnology Journal 11 (1), 1-24.
Agricultural Biotechnology Journal 11 (1), 1-24.
DOI: 10.22103/jab.2019.12015.1046
Received: August 25, 2018; Accepted: February 21, 2019
© Faculty of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman-Iranian Biotechnology Society- انتشار مقاله: 03-02-1397
- نویسندگان: مصطفی قادری,زهرا بیرانوند,سید ضیا الدین میرحسینی,سید حسین حسینی مقدم,آرش فاضلی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: QTL,جو,سنبله,نسل,نقشهیابی
- چکیده: جو پس از ذرت، گندم و برنج یکی از مهمترین غلات جهان میباشد. بهمنظور نقشهیابی صفات سنبله و دانه در دو نسل F3 و F4 حاصل از تلاقی ارقام بیچر× کویر جمعیتی شامل 103 خانواده F3 و F4 جو در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی طی دو سال زراعی 95-1393 در سه تکرار کشت شد. برای صفات مورد ارزیابی تفکیک متجاوز مشاهده شد که نشاندهنده وجود ترکیبات آللی متفاوت در والدین بود. نقشه پیوستگی با استفاده از نشانگرهای SSR، iPBS،IRAP و ISSR تهیه شد و 640 سانتی مورگان از ژنوم جو را پوشش داد. فاصلهی بین دو نشانگر 69/9 سانتی مورگان برآورد گردید. مکانیابی فاصلهای مرکب پانزده QTL در دو نسل مکانیابی نمود. برای صفات طول ریشک، قطر دانه و طول دانه در هر دو نسل F3 و F4 QTLهایی شناسایی شد. برای طول دانه و تعداد سنبلچه در نسل F4 به ترتیب QTLهای بزرگ اثر با ضریب تبیین 2/12 و 15، با درصد LOD 62/3 و 9/2 در فاصلهی 5/3 و 5/2 سانتیمورگان از نشانگر شناسایی شدند. صفات طول دانه و قطر دانه در نسل F3 با نشانگر iPBS2076-5 پیوسته و هممکان بودند. برای صفات طول ریشک، تعداد سنبلچه، طول دانه و قطر دانه نیز هممکانی شناسایی شد. شناسایی QTLهای کنترلکننده صفات میتواند در بهبود عملکرد مؤثر باشد. انتظار میرود بتوان پس از تعیین اعتبار در مکانها و جمعیتهای مختلف از QTLهای شناسایی شده در این بررسی در برنامههای انتخاب به کمک نشانگر و مکانیابی دقیق استفاده نمود.
- چکیده انگلیسی: Barley is one of the world's grain is the most important corps after maize, wheat and rice.In order to spike and grain mapping in F3 and F4 families in Becher × Kavir cultivars cross in barlypopulation of 103 families with parents in a randomized complete block design with three replications 2014-2016 during two growing seasons. Assessment transgressive segregation was observed that the existence of different allele combinations in their parents. Linkage map were prepared using SSR, iPBS, IRAP and ISSR marker that it covered 640 cM of barley genome. The distance between two markers 9.69 cM were estimated. Composite interval mapping identified fifteen QTLs in F3 and F4 families. QTLs for awn length, grain diameter and grain length was located in both F3 and F4 families. For grain length and number of spikelets in the F4 families was identified the major effect QTL by R2 12.2 and 15, with the percentage LOD 3.62 and 2.9 in 3.5 and 2.5 cM distance markers. Length grain and grain diameter were linked and co-location iPBS2076-5 markers in the F3 generation. co-location QTLs For awn length, number of spikelets, grain length and grain diameter identified. QTL identification characteristics of the controller can be effective in improving performance. It is expected to be followed by validation in various places and populations identified QTL in this study programs used in marker-assisted selection and accurate positioning.
- انتشار مقاله: 18-08-1395
- نویسندگان: رباب دغاغله,حسین صبوری,حسین حسینی مقدم3,عیسی جرجانی,حسینعلی فلاحی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: جو,نقشه پیوستگی,تجزیه QTL,نشانگر ریز ماهواره
- چکیده: به منظور مکانیابی QTLهای کنترل کننده صفات مربوط به سنبله جمعیتی شامل 103 خانواده جو حاصل از تلاقی ارقام بادیا × کویر به مدت دو سال (95-1393) در مزرعه تحقیقاتی دانشگاه گنبدکاووس در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی با سه تکرار ارزیابی شدند. صفات مورد بررسی شامل تعداد دانه در سنبله، طول سنبله، تعداد سنبلچه در سنبله، وزن کل سنبله، تعداد کل سنبله و طول ریشک بودند. براساس مکانیابی فاصلهای مرکب برای صفات مورد مطالعه در مجموع 19 QTL بدست آمد. واریانس فنوتیپی توجیه شده به وسیله این QTLها از 10 تا 34 درصد متغیر بود. بیشترین و کمترین واریانس فنوتیپی به ترتیب برای صفات تعداد دانه در سنبله و وزن و طول سنبله در سال دوم بدست آمد. بیشترین و کمترین LOD به ترتیب مربوط به QTLهای تعداد دانه در سنبله و طول سنبله در سال دوم بدست آمد. اثر افزایشی مثبت و منفی برای QTLهای شناسایی شده بیانگر انتقال آللهای مطلوب از هر دو والد به نتاج در جایگاههای مذکور بود. پنج QTL مشترک برای صفات تعداد دانه در سنبله، وزن کل سنبله، تعداد سنبلچه در سنبله، طول سنبله و طول ریشک مکانیابی گردید نشانگرهای دارای پیوستگی شدید با QTLهای بزرگ اثر، میتوانند در برنامههای گزینش به کمک نشانگر برای گزینش خانوادههای برتر و نیز انتقال آللهای مطلوب به ارقام اصلاحی مورد استفاده قرار گیرند.
- چکیده انگلیسی: In order to identify QTLs controlling traits related to spike population of 103 family of barely derived from the cross of Badia and Kavir were assessed based on randomized complete block design with three replications at the Agriculture and Natural Resource of Gonbad Kavous University in 2014 and 2016. The studied traits were grains number in spike, spike length, spiklets in spike, total spike weight, total spike and awn length. Based on composite interval mapping, nineteen QTLs were identified for the traits under study. Phenotypic variation that were explained by these QTLs, varied from 10-34%. The highest and lowest phenotypic variations were related to grains in spike and spike weight, spike length in the second year respectively. The Highest and loest LOD scores were obtained for the QTLs of grains in spike and spike length in the second year respectively. Negative and positive additive effects for identified QTLs showed the inheritance of favorable alleles from both parental lines to progenies in the detected loci. For the studied traits, five QTLs were common for grain number per spike, spike weight, number of spikelets per spike, spike length and awn length was locating. The markers showed tight linkage with major QTLs, could be used in marker assisted selection breeding programs for selection of superior family and incorporating of favorable alleles in to commercial barley varieties.
- انتشار مقاله: 26-09-1395
- نویسندگان: زینب تقی زاده,حسین صبوری,حسین حسینی مقدم,حسینعلی فلاحی,مهناز کاتوزی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: فیزیولوژی محیطی گیاهی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: برنج,تنش خشکی,تنوع ژنتیکی,گیاهچه,تجزیه ارتباط
- چکیده: شناسایی ژنهای مرتبط با تحمل به تنشها و مکانیسمهای تحمل به آنها یک عامل مهم برای ایجاد مقاومت در گیاهان است. بههمین منظور؛ آزمایشی با استفاده از 99 ژنوتیپ برنج در سه تکرار در قالب طرح کاملاً تصادفی در شرایط غرقاب و تنش خشکی در گلخانه تحقیقاتی دانشکده کشاورزی دانشگاه گنبد کاووس در سال 1397 اجرا شد. در شرایط غرقاب در طول دوره رشد گیاه آبیاری انجام شد. برای اعمال تنش خشکی، آبیاری از مرحله سه برگی قطع شد. با توجه به منحنی رطوبت، میزان تنش 2 درصد رطوبت وزنی معادل 55/0- مگا پاسکل تخمین زده شد. صفات ارزیابیشده در هر دو شرایط کشت تفاوت معنیداری با هم داشتند. تجزیه ارتباط اطلاعات بهدست آمده از آزمایشهای مولکولی و بررسیهای فنوتیپی در شرایط غرقاب نشاندهنده این موضوع بود که از میان آللها، آلل RM129A با وزن تر ساقه و طول ریشه و آلل RM129G با وزنتر ریشه و عرض بزرگترین برگ و آلل RM129B با وزن خشک ریشه و طول بزرگترین برگ و آلل RM1029I با وزن خشک ساقه و طول بزرگترین برگ و در شرایط تنش خشکی آلل RM1029G با وزن خشک ساقه، حجم ریشه و تعداد ریشه دارای بیشترین ارتباط با صفتهای مورد ارزیابی در آزمایش بودند. پرایمر RM1029 یکی از پرایمرهای مهم در مرحله گیاهچه شناسایی شد. از نتایج حاصل از این پژوهش میتوان در جهت افزایش تحمل به خشکی ارقام برنج استفاده نمود.
- چکیده انگلیسی: Identification of genes related to stresses tolerance and mechanisms of tolerance is an important factor for developing tolerant plants. For this purpose, an experiment was conducted based on completely random design with three replications with 99 rice genotypes under flooding and drought stress at Gonbad Kavous University in 2018. To apply drought stress, irrigation was stopped at the three-leaf stage. According to the humidity curve, the stress level of 2% by weight moisture was estimated to be -0.55 MPa. Significant differences were detected between traits in both conditions. The result of association analysis of molecular and phenotype studies under flooding condition revealed that among the alleles, the RM129A allele with stem fresh weight and root length, the RM129G allele with root fresh weight and the width of the largest leaf, the RM129B allele with root dry weight and the length of the largest leaf, the RM1029I allele with stem dry weight and the length of the largest leaf, and under the drought condition, the RM1029G allele with stem dry weight, root volume, and the number of roots were maximally associated with the relevant traits under study. RM1029 was recognized as one of the most important primers at the seedling stage. The results of this research can be used to increase drought tolerance in rice varieties.
- انتشار مقاله: 24-03-1398
- نویسندگان: بهاره قاسمی,حسین صبوری,حسین حسینی مقدم,عباس بیابانی,محمد جواد شیخ زاده
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: فصلنامه محیط زیست جانوری
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: کرم ابریشم,پیله,هیبرید داخلی,هیبرید خارجی
- چکیده: هفت هیبرید تجاری کرم ابریشم موجود در کشور با چهار هیبرید تجاری وارداتی، در بهار سال 1392 پس از تفریخ در مزارع پرورشی شرکت سهامی پرورش کرم ابریشم ایران، مرکز تحقیقات کرم ابریشم کشور، و نوغان داران منتخب در شهرستان لنگرود پرورش داده شدند. کلیه مراحل پرورشی، با نظارت کارشناسان و تکنسینهای شرکت سهامی پرورش کرم ابریشم ایران و مرکز تحقیقات کرم ابریشم کشور انجام شد. پس از اتمام دوره پرورش، پیلههای تولیدی جمع آوری گردید و برای صفات تولیدی مورد رکوردگیری قرارگرفته و در نهایت با یکدیگر مقایسه شدند. با توجه به نتایج تجزیه و تحلیل آمای، اثر هیبرید در همه مکان های پرورشی معنی دار بود، که نشان دهنده عملکرد متفاوت هیبریدها در مکان های پرورشی مختلف بود. از نظر وزن پیله تولیدی هر ده هزار لارو در تمامی مکان های پرورشی، هیبرید خارجی Baiyue*Qiufeng، بیش ترین و هیبرید داخلی 104*103 کم ترین عملکرد را داشت (0/01>P). تفاوت آماری عملکرد سایر هیبریدهای خارجی با دیگر هیبریدهای داخلی معنی دار نبود (0/05
P). هم چنین تمام هیبریدهای خارجی به غیر ازHaoyue Jinysong از نظر درصد قشر پیله، ضعیف تر از هیبریدهای داخلی بودند (0/05>P). از نظر درصد پیله های خوب، تمامی هیبریدهای خارجی نسیت به هیبریدهای داخلی به غیر از 32*31 و 31*32، عملکرد بالایی داشتند (0/01>P). درشت ترین پیله ها متعلق به هیبریدهای Haoyue*Jinysong و 32*31 و ریزترین پیله ها به هیبریدهای 31*32، Qiufeng*Baiyue و Xianghui4532*Furong932تعلق داشت (0/01>P).
- چکیده انگلیسی: Seven Iranian commercial silkworm hybrids and four non-Iranian imported commercial hybrids were hatched and reared during the spring 2013 in farms of Iran Silkworm Rearing Corporation, Iran Silkworm Research Center, and elected Langroodian farmers. All stages of rearing were conducted under supervision and inspection of experts and technicians of Iran Silkworm Rearing Corporation, and Iran Silkworm Research Center. After finishing of rearing stages, the produced cocoons was collected and recorded for productive traits and the obtained data were analysed and compared. From statistical analysis it is showed that the effect of hybrid was significant at all rearing sites, indicating different performance of hybrids various sites. For produced cocoon weight of ten thousand larvae at all sites, non-Iranian hybrid Baiyue Qiufeng had th higest performance, and the Iranian hybrid 103×104 had the lowest pewrformance (P<0.01). Statistical difference of the other non-Iranian and Iranian hybrids was not significant (P>0.05). For cocoon shell percentage trait, hybrids 32×31, 31×32, 103×104, and 104×103 had the highest performance respectively (P<0.05). Also all non-Iranian hybrids except Haoyue Jinysong had lower cocoon shell ratio than Iranian hybrids (P<0.05). For good cocoon percentage, all non-Iranian hybrids had higher performance than Iranian hybrids except 31×32, and 32×31 (P<0.01). Hybrids Haoyue Jinysong and 31×32 had the largest cocoon, and hybrids 32×31, Qiufeng Baiyue, and 4532.Xianghui 932.Furong had the smallest cocoon (P<0.01).
- انتشار مقاله: 01-10-1393
- نویسندگان: شهلا نعمت الهیان,علی طرفه,معین الدین مواج پور,سیدحسین حسینی مقدم,علیرضا صیداوی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: فصلنامه محیط زیست جانوری
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: PCR-RFLP,ژن لپتین,چندشکلی DNA,گاو بومی,آمیخته
- چکیده: ژن لپتین به عنوان یک ژن کاندیدا و تنظیم کننده مهم در فرآیندهای مرتبط با صفات اقتصادی شناخته شده است. در این تحقیق، به منظور شناسایی چندشکلی ژن لپتین از 200 راس گاو نژاد بومی و آمیخته استان گیلان خونگیری شد. استخراج DNA به روش نمکی و تکثیر یک قطعه 522 جفت بازی این ژن توسط واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای اختصاصی صورت گرفت و سپس با آنزیم محدودگر BsaAI هضم و نمونه ها تعیین ژنوتیپ شدند. برای جایگاه مورد مطالعه دو الگوی باندیA و B به ترتیب با فراوانی 0/455 و 0/545 در گاو بومی و 0/365 و 0/635 در گاو آمیخته شناسایی شد. فراوانی ژنوتیپ های مشاهده شده AA، AB و BB به ترتیب 0/19، 0/53 و 0/28 در گاوهای بومی و 0/14، 0/45 و 0/41 در گاوهای آمیخته به دست آمد. براساس نتایج آزمون مربع کای، جمعیت های مورد بررسی در تعادل هاردی- واینبرگ قرار داشتند. شاخصهای نئی و شانون، هتروزیگوتی مشاهده شده و مورد انتظار به ترتیب 0/496 و 0/689، 0/53 و 0/498 در گاو بومی و 0/464 و 0/656، 0/45 و 0/466 محاسبه گردید. نتایج این مطالعه نشان داد که این ناحیه از ژنوم در گاوهای مورد مطالعه چندشکل بوده و تکنیک PCR-RFLP توانای شناسایی چندشکلی ها را دارد.
- چکیده انگلیسی: The leptin gene has been known as a candidate gene and a key regulator of processes that is related to economic traits. In order to study the polymorphism of Leptin gene, total blood samples were collected randomly from 200 of native and crossbreed cows of Guilan province. DNA was extracted using salting out procedure and polymerase chain reactions (PCR) were carried out using a specific primer pairs for amplification a 522 bp fragment of leptin gene. Amplified fragment was digested by BsaAIrestriction enzyme and then samples were genotyped. For the studied locus Two patterns of A and B were identified with the frequency of 0.455 and 0.545 in native cows and 0.365 and 0.635 crossbreed cows, respectively. Three genotypes of AA, AB and BB with the frequency of 0.19, 0.53 and 0.28 in native cows and 0.14, 0.45 and 0.41 in crossbreed cows were detected, respectively. The chi-square test results showed that the studied populations was in Hardy-Weinberg equilibrium. Nei and Shanon indexes, observed and expected heterozygosities were calculated as 0.496 and 0.689, 0.53 and 0.498 in native cows and 0.464 and 0.656, 0.45 and 0.466 in crossbreed cows, respectively. The results revealed that the marker site of Leptin gene is polymorph in studied cows and the PCR-RFLP technique has a great potential for detection of such polymorphism.
- انتشار مقاله: 15-09-1392
- نویسندگان: مجتبی رضایی,سیدضیاءالدین میرحسینی,سیدحسین حسینی مقدم,محمد آیت اللهی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: علوم و تحقیقات بذر ایران
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: جوانهزنی,برنج,تنش خشکی,تجزیه ارتباط
- چکیده: برنج بعد از گندم مهمترین محصول کشاورزی جهان است و نقش مهمی در تغذیه بیش از نیمی از جمعیت جهان دارد. مرحله جوانهزنی، از مهمترین مراحل رشدی برنج بهحساب میآید و تنش خشکی، تأثیر بهسزایی بر خصوصیات جوانهزنی برنج دارد. شناسایی ژنوتیپهای متحمل به تنشها و ساختار ژنتیکی کنترل صفات آنها از مهمترین عوامل برای ایجاد تحمل در گیاهان است. بههمین منظور؛ آزمایشی با استفاده از 102 ژنوتیپ برنج در دو تکرار در قالب طرح کاملاً تصادفی در آزمایشگاه دانشگاه گنبد کاووس در سال 97-1396 اجرا شد. صفات درصد جوانه زنی، طول ساقهچه، طول ریشهچه، طول کولئوپتیل، تعداد ریشهچه، وزن تر ساقهچه و وزن تر ریشهچه اندازهگیری شدند. اختلاف بین ژنوتیپها از نظر صفات مرتبط با جوانهزنی در شرایط نرمال و تنش خشکی معنیدار بود. نتایج حاصل از تجزیه ارتباط در مرحله جوانهزنی در شرایط نرمال نشان داد که RM12091A و RM1029B با صفات درصد جوانهزنی، طول کولئوپتیل، تعداد ریشهچه و وزن ریشهچه و در شرایط تنش خشکی RM129D با صفات تعداد ریشهچه و وزن ساقهچه و آلل RM530B با صفات طول کولئوپتیل و تعداد ریشهچه ارتباط داشتند. نتایج حاصل از این پژوهش نشان داد که میتوان از تنوع ژنتیکی بین ژنوتیپهای برنج و تجزیه ارتباط در جهت افزایش تحمل به خشکی در ارقام برنج استفاده نمود.
- چکیده انگلیسی: Rice is the world's most important agricultural product after wheat and important role in feeding more than half of the world's population. The germination stage is one of the most important stages in the development of rice. Drought stress has a significant effect on the germination characteristics of rice. Identification of tolerant genotypes and genetic structure of control their traits are an important factor for tolerance in rice. In order to detection of informative SSR alleles for control genes of germination components in rice under normal conditions and drought conditions, an experiment was conducted using 102 genotypes of rice in two replications in a Completely Randomized Design in Laboratory of Gonbad Kavous University in 2018. Germination percentage, plumule length, radicle length, coleoptile length, number of radicle, total fresh weight of plumule and fresh weight of radicle were measured. Significant differences were detected between genotypes for germination traits in normal and drought stress conditions. The results of the association analysis at normal condition showed that RM12091A and RM1029B were associated with germination percentage, coleoptile length, radicle total weight and under drought stress condition, the RM129D was related to number of radicle and total weight of plumule and the RM530B allele were correlated with length of the coleoptile and the number of roots. The results of this study showed that genetic variation among rice genotypes and association analysis could be used to increase drought tolerance in rice cultivars.
- انتشار مقاله: 08-10-1397
- نویسندگان: بهاره قاسمی مرزبالی,حسین صبوری,حسین حسینی مقدم,عباس بیابانی,محمد جواد شیخزاده
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: علوم و فناوری بذر ایران
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: ساقهچه,ریشهچه,ریز ماهواره,پلیاتیلن گلیکول
- چکیده: جوانهزنی بذر از خصوصیات بارز و مهم یک رقم زراعی توصیف میشود. به منظور شناسایی نواحی ژنومی کنترلکننده صفات مرتبط با جوانهزنی دانه جو، 103 خانواده F3 و والدین آنها بادیا و کویر طی سال زراعی 96-1395 در دو شرایط عادی و تنش خشکی مورد ارزیابی قرار گرفتند. صفات طول ساقهچه، تعداد ریشهچه، طول کلئوپتیل، وزن خشک ریشه-چه، وزن خشک ساقهچه و سرعت جوانهزنی مورد اندازهگیری قرار گرفتند. در این بررسی، 28 جفت آغازگر ریزماهواره برای تعیین چندشکلی والدین استفاده گردید. تجزیه QTL بهروش نقشهیابی فاصلهای مرکب (CIM) برای هر صفت در هر محیط انجام گردید. در مجموع، 27 QTL برای صفات مورد مطالعه شناسایی گردید. واریانس فنوتیپی توجیه شده بهوسیله این QTLها از 6/8 تا 3/37 درصد متغیر بود. بیشترین مقدار LOD برای QTL کنترلکننده تعداد ریشهچه 45/10LOD= روی کروموزوم 4 در شرایط تنش 15- بار بهدست آمد. نتایج نشان داد که QTLهای تعداد ریشهچه در هر دو شرایط از تظاهر خوبی برخوردار بودند. لذا از QTLهای پایدار و خوشهای شناسایی شده میتوان در برنامه گزینش به کمک نشانگر (MAS)، استفاده نمود.
- چکیده انگلیسی: Seed germination is a manifest characteristic of the standard germination test of a cultivated variety. In order to identify genomic regions associated with seed germination, 103 family of barley in F3 and their parents Badia and Kavir were cultivated in 2015-2016, under normal and drought stress conditions. Different traits including Plumule length, Radicle number, Cleoptil length, Radicle Dry weight, Plumule Dry weight and germination speed were measured. In this study, 28 pairs of microsatellite primers were used to determine the parental polymorphism. QTL analysis using composite interval mapping (CIM) for each trait in each environment for all studied traits. In general, twenty seven QTLs were detected for all traits. Total phenotypic variance explained by these QTLs varied from 8.6 to 37.3 percent. The highest LOD value for QTL controlling Radicle number (LOD=10.45) was obtained on chromosome 4 qNR-4a -15 in drought stress The results revealed that QTLs of Radicle number had desirable performance in all two environments. However, detected stable and cluster QTLs may be used in marker assisted selection (MAS) programs.
- انتشار مقاله: 16-09-1396
- نویسندگان: زینب تقی زاده,حسین صبوری,حسین حسینی مقدم,حسینعلی فلاحی,مهناز کاتوزی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: علوم دامی ایران
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: عملکرد,جوجههای گوشتی,نانو منگنز,استخوان درشتنی,تزریق درون تخممرغی,منگنز- متیونین
- چکیده: بهمنظور بررسی اثرات تزریق درون تخممرغی منابع مختلف منگنز بر عملکرد و خصوصیات استخوان درشتنی جوجههای گوشتی، تعداد 480 عدد تخممرغ بارور سویه راس 308 در قالب طرح کاملا تصادفی به 6 تیمار، 4 تکرار و 20 تخممرغ در هر تکرار اختصاص داده شد. تیمارهای آزمایشی شامل بدون تزریق یا شاهد منفی (NC)، و تزریق 1 میلیلیتر سرم فیزیولوژی یا شاهد مثبت (PC)، 1 میلیلیتر سولفات منگنز (MnS)، 1 میلیلیتر منگنز- متیونین (MnM)، 1 میلیلیتر نانو منگنز (NMn) و 1 میلیلیتر نانو منگنز متیونین (NMnM)بودند. نتایج بهدستآمده نشان دادند که تزریق درون تخممرغی منابع مختلف منگنز سبب بهبود رشد جوجههای گوشتی شد.بیشترین و کمترین افزایش وزن در کل دوره پرورش بهترتیب مربوط به تیمار حاوی NMn و گروه PC بود (05/0>P). بهترین ضریب تبدیل غذایی در کل دوره آزمایش مربوط به تیمار NMn و NMnM بود (05/0>P). طول استخوان درشتنی در سن 21 روزگی در تیمار حاوی MnS بهطور معنیداری بالاتر بود (05/0>P) و وزن تر و خشک استخوان درشتنی در سنین 21 و 42 روزگی در تیمار حاوی NMn بهطور معنیداری افزایش یافت (05/0>P). استحکام استخوان درشتنی در سنین 21 و 42 روزگی بهترتیب در تیمارهای حاوی NMnM و NMn بهطور معنیداری افزایش یافت (05/0>P). حجم، چگالی و درصد خاکستر استخوان درشتنی در سنین 21 و 42 روزگی تحت تأثیر تیمارهای آزمایشی قرار نگرفتند )05/0P>). بر اساس نتایج این آزمایش بهنظر میرسد که تزریق درون تخممرغی نانو ذرات منگنز به عنوان یک افزودنی خوراکی اثرات مثبتی بر عملکرد و خصوصیات استخوان درشتنی جوجههای گوشتی دارد.
- چکیده انگلیسی: In order to investigate the effects of in ovo injection of different sources of manganese on performance and tibia characteristics of broilers, a total of 480 fertile eggs from ROSS 308 were assigned to 6 treatments, 4 replicates of 20 eggs per replicate in a completely randomized design. The experimental treatments included non-injected (negative control, NC), injection of1 ml serum physiology(positive control, PC), 1 ml of manganese sulfate (MnS), 1 ml of manganese- methionine (MnM), 1 ml of nano manganese (NMn) and 1 ml of nano manganese methionine (NMnM). The results showed that the in ovo injection of different sources of manganese lead to improvement in broilers growth. The highest and lowest body weight gain in entire production period were recorded for NMn and PC group, respectively (P<0.05). NMn and NMnM groups showed the best feed conversion ratio in whole experimental period (P<0.05). The tibia length at 21 day of age was significantly higher in treatment containing MnS and fresh and dry weights of tibia at 21 and 42 days of age were significantly increased with NMn (P<0.05). The tibia breaking strength at 21 and 42 days of age was significantly increased in treatments containing NMnM and NMn (P<0.05). The tibia volume, density and ash percentage were not affected by experimental treatments on 21 and 42 days of age (P>0.05). According to these results, it seems that the in ovo injection of manganese nanoparticles as a feed additive has positive effects on performance and tibia characteristics of broilers.
- انتشار مقاله: 18-06-1397
- نویسندگان: مجید متقی طلب,مینو میرزاوند چگینی,سید حسین حسینی مقدم,مصطفی گلشکن
- مشاهده