در هنگام جستجو کلمه در قسمت عنوان میتوانید کلمات مورد جستجو را با کاراکتر (-) جدا کنید.
کاربرد نوع شرط:
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تولیدات دامی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: PCR-SSCP,توالییابی,بز نجدی,ژن BMP15,نرخ تخمک گذاری
- چکیده: هدف از انجام تحقیق حاضر، بررسی چندشکلی ژن BMP15 که در کنترل شرح و بسط فولیکول در تخمدان، نرخ تخمکگذاری، و باروری نقش حیاتی دارد، است. نمونههای خون از 91 بز نجدی مربوط به سه موقعیت جغرافیایی شمال غربی، جنوب شرقی، و مرکز استان خوزستان بهطور تصادفی انتخاب شدند. بعد از استخراج DNA، تکثیر قطعۀ 235 جفت بازی از اگزون دو ژن BMP15 با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی انجام شد و قطعات مورد نظر توالییابی شدند. سپس رابطۀ بین ژن مذکور و صفت چندقلوزایی با نرمافزار آماری SAS بررسی شد. نتایج حاصل از توالییابی با نرمافزار Vector NTI، سه جهش در باز 529 از نوع T به G و در باز 530 از نوع C به G و در باز 576 از نوع T به C را مشخص کرد. همچنین بیشترین میانگین چندقلوزایی مربوط به الگوی AA بود. بهطورکلی، جهشهای نقطهای یافتشده در ژن مورد بررسی، بر نرخ تخمکگذاری در بز مؤثر است. ازاین رو امید است با انتخاب براساس نشانگر بتوان صفت مطلوب چندقلوزایی را در جمعیت بز نجدی افزایش داد.
- چکیده انگلیسی: This study was conducted to detect polymorphism of gene BMP15, a member of Transforming Growth
Factor β (TGFβ) family which has a crucial role in controlling the ovarian follicles development,
ovulation rate and fertility. Samples were randomly selected from 91 Najdi goats in 3 geographical
locations, northwest, southeast and center of Khuzestan province. After DNA extraction, amplification of
235 bp fragment of exon 2 of BMP15 gene was performed using specific primers. Sequence detection
was executed after amplification of gene fragments. The association of BMP15 gene and litter size was
done by SAS software. Results from sequencing were analyzed by Vector NTI software. The results
identified three mutations in bases 529 (T to G), 530 (C to G) and 576 (T to C). The largest litter size
belongs to AA pattern. Point mutations in this gene will alter the Ovulation rate of the goat. Therefore,
improving twining trait in Najdi population can be expected by marker assisted selection.- انتشار مقاله: 18-06-1392
- نویسندگان: الهام جاودان,جمال فیاضی,صالح طباطبایی,محمدتقی بیگی نصیری
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تحقیقات تولیدات دامی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: ویناس,تولید گاز,ملاس,هضم پذیری
- چکیده: این مطالعه جهت تعیین ارزش و مقایسه فراسنجههای تولید گاز ملاس و ویناس در قالب طرح کاملاً تصادفی با پنج تیمار و شش تکرار انجام شد. جهت تهیه مایع شکمبه از سه رأس گوسفند نر بالغ فیستولدار استفاده شد. جیرههای آزمایشی شامل: جیره 1) جیره پایه +20 درصد ملاس + صفر درصد ویناس (شاهد)، جیره 2) جیره پایه + 15 درصد ملاس + 5 درصد ویناس، جیره 3) جیره پایه + 10 درصد ملاس + 10 درصد ویناس، جیره 4) جیره پایه + 5 درصد ملاس + 15 درصد ویناس، و جیره 5) جیره پایه + صفر درصد ملاس + 20 درصد ویناس بودند. بر اساس نتایج به دست آمده پتانسیل تولید گاز، نرخ گاز تولید شده، انرژی قابل متابولیسم، قابلیت هضم ماده آلی و مقدار اسیدهای چرب کوتاه زنجیر در ملاس بطور معنیداری بیشتر از ویناس بود (05/0P<). عامل تفکیک، تولید توده میکروبی و راندمان تولید توده میکروبی در سطح 10 درصد ویناس کاهش معنیداری نسبت به شاهد نشان داد (05/0P<). حجم تولید گاز در سطح 15 درصد ویناس در تمامی ساعات انکوباسیون نسبت به گروه شاهد به طور معنیداری بیشتر بود (05/0P<). مقدار انرژی قابل متابولیسم، قابلیت هضم ماده آلی و مقدار اسیدهای چرب کوتاه زنجیر در در سطح 15 درصد ویناس افزایش معنیداری نسبت به شاهد نشان داد(05/0P<). به طور کلی جایگزینی ویناس با ملاس به نسبت 15 درصد در جیرههای غذایی، باعث افزایش ارزش غذایی جیرهها میشود.
- چکیده انگلیسی: This study was conducted to compare the nutritive value of molasses and vinasses by in vitro gas production technique using rumen fluid collected from three fistulated mature male sheep. The experiment used the completely randomized design with 5 treatments and 6 replications. Rumen fluid was collected from three fistulated mature male sheep.The experimental diets included: diet 1) basal diet + 20% molasses + 0% vinasses (control), diet 2) basal diet + 15% molasses +5% vinasses, diet 3) basal diet + 10% molasses + 10% vinasses, diet 4) basal diet + 5% molasses + 15% vinasses, and diet 5) basal diet + 0% molasses + 20% vinasses. Potential of gas production, rate of gas production, metabolizable energy, digestibilityof organic matter and short-chain fatty acids from molasses were more than those from vinasses (P<0.05). Partitioning Factor, microbial biomass and microbial biomass efficiency at level of 10% vinasses was less compared to the control (P<0.05). The volume of gas production from diet containing 15% vinasses was greater than the control throughout the fermentation period (P<0.05). Metabolizable energy, organic matter digestibility and short-chain fatty acids from the diet containing 15% vinasses was significantlyhigher compared to the control (P<0.05). Generally, substitution of vinasses with molasses up to 15% increased the nutritional value of the diets.
- انتشار مقاله: 06-01-1396
- نویسندگان: غلامعلی صنیعی,محمد بوجارپور,جمال فیاضی,مجتبی زاهدی فر
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تحقیقات دامپزشکی و فرآوردههای بیولوژیک
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: بافت شکمبه گاو,شبکه متابولیکی,تجزیه و تحلیل توپولوژیکی
- چکیده: شکمبه نقش محوری در بازده تولید در نشخوارکنندگان دارد. درک فرآیند متابولیسم بافت شکمبه میتواند منجر به بهبود بازده تولید و در نتیجه سود اقتصادی در نشخوارکنندگان شود. در پژوهش حاضر، شبکه متابولیکی بافت شکمبه گاو با استفاده از اطلاعات ژنومی و اطلاعات موجود در پایگاههای داده مختلف، بازسازی شد. نتایج حاصل از بازسازی شبکه شامل 410 آنزیم، 1429 متابولیت به عنوان گره و 1777 واکنش به عنوان یال بود. ویژگیهای این شبکهی متابولیت محور توسط چند پلاگین نرمافزار سایتواسکیپ تجزیه و تحلیل شد. 15هاب متابولیت تعیین شد. نتایج جستجو در سایت KEGG pathway نشان داد که بیشتر هاب متابولیتها شامل: کوآنزیم-آ، استیل کوآنزیم-آ، د- فرکتوز 6 فسفات، ابی کینون، سوکسینات، الکترون ترننسفراز فلافوپروتئین، پیروات، تتراهیدروفولات و 2 اگزالارات در واکنشهای مربوط به چرخه متابولیک دخیل هستند. همچنین ژنهای GPAT3، GPAT4، GPAM (2.3.1.15)، ETFDH (2.3.1.41)، CPT1C، CPT1B، CPT1A، CPT2 (2.3.1.21)i در متابولیسم اسیدهای چرب شرکت میکنند که این ژنها ممکن است برای بهبود بازده تولید محصولات گاوی ضروری باشند. توزیع درجه گره شبکه از توزیع درجه نمایی پیروی میکند بنابراین ویژگی مقیاس آزاد را نشان میدهد. میانگین طول مشخصه مسیر 142/13 و قطر شبکه 38 بود که نشان میدهد شبکه ویژگی جهان کوچک را نیز دارد. پژوهش حاضر اولین مطالعه با هدف بازسازی شبکه متابولیکی بافت شکمبه است که ممکن است اطلاعات در جهت درک بیشتر پتانسیل متابولیکی شکمبه را بهبود دهد. هاب متابولیتها در شبکههای مقیاس آزاد نقش معنیداری در حفظ ثبات توپولوژیک ایفا میکنند به همین دلیل بنظر میرسد برای تحقیقات اصلاح نژاد دام مفید باشند.
- چکیده انگلیسی: The rumen has a central role in production efficiency in ruminants. Understanding metabolism process of rumen tissue can improve production efficiency of ruminants. In the present work, the metabolic network in the rumen tissue of cattle was reconstructed using genome information and available knowledge of rumen tissue from BRENDA, KEGG, Uniprot and NCBI. The result of reconstruct network consisted of 410 enzymes, 1429 metabolites as nodes and 1771 reactions they take part as edges. The characteristics of the metabolite-centric network were analyzed using some plugins in Cytoscape software. The top 15 hub metabolites were determined. The result of search in KEGG pathway shown the most of hub metabolites include CoA, Acetyl-CoA, D-fructose-6-phosphate, ubiquinone, succinate, electron-transferring flavoprotein, pyruvate, tetrahydrofolate and 2-oxoglutarate, involved in reactions which participate in metabolic pathway. Also, the genes CPT2, CPT1A, CPT1B, CPT1C (EC 2.3.1.21), ETFDH (EC 2.3.1.41), GPAM, GPAT4, GPAT3, GPAT2 (EC 2.3.1.15) participate in fatty acid metabolism that genes associated with this pathway may be essential to improve meat production efficiency of cattle research. The degree distribution of network follow power-law distribution hence displays a scale-free property. The average path length was 13.142 and diameter was 38 that shows the network also has small world properties. The present work is the first study to reconstruct rumen tissue network that may provide information to greater understanding on metabolic potential of rumen. Hub metabolites in scale-free networks paly significant role in maintaining topological robustness, for this reason seem to be useful for bovine breeding researches.
- انتشار مقاله: 01-12-1397
- نویسندگان: مریم قلی زاده,جمال فیاضی,یزدان عسگری,حکیمه زالی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: تحقیقات تولیدات دامی
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: پارامترهای ژنتیکی,روند ژنتیکی و فنوتیپی,صفات رشد و تولیدمثل
- چکیده: در این پژوهش مولفههای (کو) واریانس و پارامترهای ژنتیکی صفات رشد شامل وزن تولد (BW)، وزن از شیرگیری (WW) و وزن شش ماهگی (6MW) و همچنین پارامترها و روند ژنتیکی و فنوتیپی صفات تولیدمثلی شامل مجموع وزن برههای از شیر گرفته شده بهازای هر میش مولد (TWLW) و تعداد برههای متولد شده در هر زایش به ازای هر میش مولد (NLBE) در گوسفند نژاد لری با استفاده از روش بیزی برآورد شد. اطلاعات مورد استفاده شامل 7363 رکورد وزن تولد، 7054 رکورد وزن از شیرگیری، 6765 رکورد وزن شش ماهگی، 1012 رکورد برای TWLW و 1048 رکورد برای NLBE بود که طی سالهای 1380 تا 1389 توسط سازمان جهاد کشاورزی استان لرستان جمعآوری شده بود. وراثتپذیری مستقیم برآورد شده برای صفات BW، WW و 6MW بهترتیب 36/0، 11/0 و 05/0 بود. روند ژنتیکی و فنوتیپی صفات تولیدمثل به ترتیب از تابعیت میانگین ارزشهای اصلاحی بر سال تولد و تابعیت میانگین عملکرد بر سال تولد محاسبه شد. وراثتپذیری، روند ژنتیکی و فنوتیپی برای صفت TWLW بهترتیب 05/0، 16/1±4/5 و 45/36±255 گرم در سال بود. وراثتپذیری، روند ژنتیکی و فنوتیپی برای صفت NLBE بهترتیب 09/0، 02/0±002/0 و 07/0±125/0 برآورد شد. پیشرفت ژنتیکی صفات TWLW و NLBE در دوره مورد بررسی بهترتیب 64/31 گرم و 008/0 بره بود. با توجه به بالا بودن ضریب وراثتپذیری وزن تولد نسبت به سایر صفات مورد مطالعه، انتخاب بر اساس این صفت میزان پیشرفت ژنتیکی را افزایش خواهد داد. روند ژنتیکی و فنوتیپی صفات تولیدمثل معنیدار نبوده و مقدار روند ژنتیکی این صفات ناچیز بود.
- چکیده انگلیسی: (Co) variance components and genetic parameters for growth traits including birth weight (BW), weaning weight (WW) and six-month weight (6MW) as well as parameters, genetic and phenotypic trends of reproductive traits including total weight of lambs weaned per the ewe (TWLW) and the number of lambs born at birth per ewe (NLBE) in Lori sheep were estimated using the Bayesian method.The data included 7363 records for BW, 7054 records for WW, 6765 records for 6MW, 1012 records for TWLW and 1048 records for NLBE.The data were collected by the Agricultural Organization of Lorestan Province between the 2001 to 2010 years (for growth traits) and 2003 to 2010 years (for reproductive traits).The estimates of direct heritability forlamb body weights were 0.36 at birth, 0.11 at weaning and 0.05 at six months of age. The genetic and phenotypic trends reproductive traits were calculated based on regression of the mean of breeding value on birth year and mean of phenotypic value on birth year, respectively. Heritability, genetic and phenotypic trends for TWLW trait were 0.05, 5.4±1.16and 255±0.45 grams per year, respectively. Heritability, genetic and phenotypic trends of NLBE trait were 0.09, 0.002±0.02and 0.125±0.07, respectively. Genetic improvement of TWLW and NLBE traits at considered period were 31.64 grams and 0.008 of Lamb. The estimate of heritability at birth was higher than other traits so selection based on this trait would increase the genetic advances. Genetic and phenotypic trends for reproductive traits were not significant and the genetic trend was low.
- انتشار مقاله: 29-03-1394
- نویسندگان: فاطمه بیرانوند,جمال فیاضی,محمد تقی بیگی نصیری,صادق اسدالهی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: پژوهش های علوم دامی (دانش کشاورزی)
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: الگوی رشد,گوسفند مغانی,توابع غیرخطی,روش بیزی
- چکیده: زمینه مطالعاتی: مدلهای رشد، توابع ریاضی هستند که برای توصیف الگوی رشد به کار میروند. هدف: هدف از انجام این پژوهش، برآورد فراسنجههای ژنتیکی پارامترهای رشد حاصل از بهترین مدل غیرخطی و عوامل محیطی مختلف مؤثر بر این پارامترها در گوسفندان مغانی بود. روشکار: در این پژوهش، به منظور برآورد اجزاء (کو)واریانس پارامترهای الگوی رشد، از تعداد 7278 رکورد وزن تولد، 5881 رکورد وزن شیرگیری، 5013 رکورد وزن ششماهگی، 2819 رکورد وزن نهماهگی و 2883 رکورد وزن یکسالگی گوسفندان مغانی که طی سالهای 1374 تا 1389 در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد این گوسفند واقع در جعفرآباد مغان جمعآوری شده بود، استفاده شد. در این مطالعه پارامترهای الگوی رشد (وزن بلوغ، نرخ رشد و نرخ بلوغ) با استفاده از چهار مدل رگرسیون غیرخطی گومپرتز، لجستیک، برودی و ونبرتالانفی با رویه NLIN نرمافزار SAS محاسبه شد. جهت برآورد اجزای واریانس-کواریانس پارامترهای الگوی رشد از روش آماری بیزی مبتنی بر تکنیک نمونهگیری گیبس و نرمافزار MTGSAM استفاده شد. نتایج: مدل ونبرتالانفی به علت داشتن بیشترین ضریب تبیین و کمترین مقدار آکائیکی به عنوان مدل برتر در مقایسه با سایر مدلها، انتخاب شد. عوامل محیطی سال تولد (01/0p <)، جنسیت بره (01/0p <) و سن مادر هنگام زایش (05/0p <) بر وزن بلوغ و نرخ رشد از لحاظ آماری معنیدار بودند. اثرات ثابت سال تولد و جنسیت بره بر نرخ بلوغ اثر معنیدار داشتند (01/0p <). از بین شش مدل خطی برازش شده در روش بیزی، بر اساس کمترین مقدار واریانس باقیمانده برای وزن بلوغ مدل 4، برای نرخ رشد مدل 6 و برای نرخ بلوغ مدل 5 انتخاب گردید. وراثتپذیری مستقیم برآورد شده بر اساس مدل مناسب انتخاب شده، برای صفات مذکور به ترتیب برابر 003/0±29/0، 004/0±35/0 و 005/0±21/0 بود. همبستگی بین پارامترهای الگوی رشد مثبت و نزدیک به صفر برآورد شد. نتیجهگیری کلی: طبق نتایج به دست آمده، اثر عوامل محیطی بر پارامترهای الگوی رشد مهم و تأثیرگذار هستند و باید در تجزیه و تحلیل این پارامترها مورد بررسی قرار گیرند.
- چکیده انگلیسی:
- انتشار مقاله: 11-10-1397
- نویسندگان: آذر راشدی دهصحرائی,جمال فیاضی,عباس مسعودی,رستم عبداللهی آرپناهی
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: پژوهش های علوم دامی (دانش کشاورزی)
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی: آنالیز مولفههای اصلی,پویش کل ژنومی,تنوع تک نوکلئوتیدی,گاومیش خوزستانی
- چکیده: زمینه مطالعاتی: باتوجه به اهمیت گاومیش در جهت سازگاری با محیطهای خشک، مقاومت در برابر بیماریها، پایین بودن هزینههای نگهداری و استفاده موثر از مواد خشبی کم ارزش در جهت تولید مواد پروتئینی با ارزش، ارتقا ژنتیکی آن حائز اهمیت فراوانی است. هدف: این تحقیق به منظور یافتن فواصل ژنتیکی گاومیشهای مناطق مختلف خوزستان و ارتباط ژنتیکی آنها به کمک آرایه چندشکلی تک نوکلئوتیدی اجرا شد. روش کار: در این مطالعه از تعداد 121 راس گاومیش از گلههایی که تحت پوشش سیستم ثبت مشخصات و رکوردگیری شیر در شهرستانهای اهواز، دزفول، شادگان، شوش، شوشتر، دشت آزادگان، کرمانشاهی با منشاء خوزستانی و سایر مناطق بودند، نمونهگیری شد. نمونهها با استفاده از تراشه ژنومی اختصاصی گاومیش با تعداد 90 هزار نشانگرSNP تعیین ژنوتیپ شدند. سپس جایگاههای با حداقل فراوانی آللی کمتر از 01/0، تعادل هاردی واینبرگ کمتر از 6-10 و نرخ خوانش کمتر از 05/0 کنار گذاشته شدند. دادهها بکمک روشهای آماری چند متغییره همچون آنالیز مولفههای اصلی مورد کنکاش قرار گرفتند. نتایج: نتایج آنالیز روابط فیلوژنتیکی نشان داد گاومیشهای اهواز بدلیل مرکزیت، متاثر از گاومیشهای سایر نقاط استان میباشند، ولی گاومیشهای شوشتر و دزفول و دشتآزادگان، نسبت به اهواز اختلاط کمتری دارند. با استفاده از آنالیز مولفههای اصلی نتایج فوق تایید شد. جهت بررسی الگو و ساختار ژنتیکی برای جمعیتهای گاومیش استان خوزستان ارزشهای FSTبرای هر SNP به روش نااریب تتا محاسبه گردید. بیشترین میانگین ارزش FST بین جمعیت مربوط به گاومیشهای شهرستانهای دشتآزادگان و شادگان به ترتیب 0159/0 و 0147/0 و کمترین مربوط به شهرستانهای اهواز و شوش به ترتیب 0087/0 و 0086/0 بود. آزمونهای آماری ژنتیکی جمعیتی و تنوع نژادی نشان داد که در درون جمعیت گاومیشهای خوزستانی تنوع ژنتیکی بالایی وجود دارد. نتیجه گیری نهایی: نتایج گرافیکی آزمونهای خوشهبندی و انتساب حاکی از وجود حداقل 3 زیر جمعیت نسبتاً مجزا در گاومیشهای خوزستان میباشد. نتایج این تحقیق در مورد تنوع ژنتیکی مشاهده شده در سطح نوکلئوتیدها و فاصله ژنتیکی بین گروههای جمعیتی گاومیش استان، در مطالعات بعدی همچون تشکیل جمعیت پایه گاومیش خوزستان و انتخاب ژنومیکی شایسته توجه هستند.
- چکیده انگلیسی:
- انتشار مقاله: 09-04-1397
- نویسندگان: محمدرضا زرگر,جمال فیاضی,محمدتقی بیگی نصیری,حسین مرادی شهربابک
- مشاهده
- جایگاه : پژوهشی
- مجله: پژوهش های علوم دامی (دانش کشاورزی)
- نوع مقاله: Journal Article
- کلمات کلیدی:
- چکیده:
- چکیده انگلیسی:
- انتشار مقاله: 28-12-1392
- نویسندگان: بهزاد علیپور علیپور,جمال فیاضی
- مشاهده