ژنوتایپینگ و تقسیم بندی ویروس های برونشیت عفونی پرندگان بر اساس ژن کد کننده پروتئین S2و تقسیم بندی ویروس های برونشیت عفونی پرندگان بر اساس ژن کد کننده پروتئین S2
ژنوتایپینگ و تقسیم بندی ویروس های برونشیت عفونی پرندگان بر اساس ژن کد کننده پروتئین S2و تقسیم بندی ویروس های برونشیت عفونی پرندگان بر اساس ژن کد کننده پروتئین S2
عنوان فارسی :
ژنوتایپینگ و تقسیم بندی ویروس های برونشیت عفونی پرندگان بر اساس ژن کد کننده پروتئین S2و تقسیم بندی ویروس های برونشیت عفونی پرندگان بر اساس ژن کد کننده پروتئین S2
عنوان انگلیسی :
Molecular characterization of recent Iranian infectious bronchitis virus isolates based on S2 protein gene
چکیده:
زمینه مطالعه: ویروس برونشیت عفونی، عامل بیماری برونشیت عفونی از عوامل مهم در ایجاد خسارات اقتصادی در صنعت طیور دنیا می‌باشد. ویروس برونشیت عفونی به سروتیپ‌ها و ژنوتیپ‌های مختلفی طبقه بندی می‌شود. پروتئین اسپایک (S) (~ 3462)، واقع در سطح غشاء ویروسی، القاء عمده‌ای از آنتی بادی‌های خنثی است و مسئول ویروس اتصال و ورود به سلول‌های میزبان است. جدایه‌های ویروس برونشیت عفونی بطور گسترده بوسیله سکانس ژن پروتیین s1 ژنوتایپینگ می‌شوند. هدف: هدف از این مطالعه، ژنوتایپینگ جدید و طبقه‌بندی جدایه‌های ویروس برونشیت عفونی در ایران بر‌اساس پروتیین s2 می‌باشد. روش کار: ژن s2 نه جدایه ویروس برونشیت عفونی ابتدا توسط روش RT-PCR تکثیر داده شدند و مورد سکانس قرار گرفتند. سکانس آمینواسیدی این جدایه‌ها با سکانس جدایه‌های غیر ایرانی مورد مقایسه قرار گرفتند. نتایج: جدایه‌های ویروس برونشیت عفونی ایران به سه ژنوتیپ (I, VII, VIII) تقسیم‌بندی گردیدند. ژنوتیپ I شامل ویروس‌های مشابه سروتیپ ماساچوست بود. ژنوتیپ VII به دو شاخه تقسیم‌بندی شدند، اولین شاخه VIIa (مشابه IS-1494) و دومین شاخه VIIb نیز مربوط به ویروس‌های مشابه QX بودند. ژنوتیپVIIIشامل ویروس‌های مشابه 793/B بودند. نتیجه‌گیری‌نهایی: مطالعه حاضر نخستین اطلاعات در مورد ژنوتایپینگ و طبقه‌بندی جدایه‌های ویروس برونشیت عفونی ایران می‌باشد
چکیده انگلیسی:
Background: Avian infectious bronchitis (IB), with avian infectious bronchitis virus (IBV) as the causing agent, is a ubiquitous endemic disease of the chicken with devastating effects on its industry. A viral membrane surface protein called S not only induces neutralizing antibodies but also plays an important role in virus binding and entry to host cells. Technically, S1 protein gene sequencing also helps greatly in IBV genotyping. OBJECTIVES: The aim of this study was to characterize Iranian IBV based on S2 gene. METHODS: After RT-PCR amplification, the S2 gene of nine Iranian IBV isolates were sequenced and then compared with reference strains. RESULTS: The isolates were classified into genotype I as Massachusetts like IB Vs, genotype VII which clustered into two branches, VIIa (IS-1494 like IB viruses), and VIIb, and was related to QX- like viruses and Genotype VIII as 793/B like IBVs. CONCLUSIONS: As far as we know, this is the first S2-based classification study on Iranian IBV isolates providing a firm experimental basis to correlate with genotypic characterization
خبرنامه
برای ثبت نام در خبرنامه و دریافت خبرنامه ایمیل خود را وارد نمایید.
