جداسازی و مطالعه ویژگیهای فنوتیپی و مولکولی گونههای آئروموناسهای متحرک عامل سپتیسمی هموراژیک باکتریایی در برخی مزارع مبتلای کپورماهیان پرورشی کشور
جداسازی و مطالعه ویژگیهای فنوتیپی و مولکولی گونههای آئروموناسهای متحرک عامل سپتیسمی هموراژیک باکتریایی در برخی مزارع مبتلای کپورماهیان پرورشی کشور
عنوان فارسی :
جداسازی و مطالعه ویژگیهای فنوتیپی و مولکولی گونههای آئروموناسهای متحرک عامل سپتیسمی هموراژیک باکتریایی در برخی مزارع مبتلای کپورماهیان پرورشی کشور
عنوان انگلیسی :
Isolation, phenotypic and molecular characterization of motile Aeromonas species, the cause of bacterial hemorrhagic septicemia in affected farmed carp in Iran
چکیده:
زمینه مطالعه: آئروموناسهای متحرک عامل تلفات سنگین در مزارع پرورش کپورماهیان ایران در فصول بهار و تابستان می‌باشند. هدف: هدف از انجام مطالعه حاضر جداسازی و شناسایی ویژگیهای فنوتیپی و مولکولی گونههای آئروموناسهای متحرک در برخی از مزارع پرورشی کپورماهیان کشور بوده است. روش کار: به این منظور نمونه‌های بافت کلیه 40 نمونه ماهی دارای علائم بالینی از 22 مزرعه مورد بررسی قرار گرفت. پس از کشت از بافت کلیه ماهیان بیمار روی محیط ژلوز خوندار، آزمایش‌های بیوشیمیایی جهت شناسایی جنس‌های باکتریایی انجام شد. به منظور تأیید تشخیص پس از استخراج DNA نمونه‌ها و ارزیابی کیفیت DNAهای استخراج‌شده، آزمایش PCR صورت گرفت. در این آزمایش از یک جفت آغازگر برای شناسایی ژن 16S rRNA باکتری استفاده شد. نمونه‌های تأیید‌شده تعیین توالی گردید و مطالعات فیلوژنتیک بر روی جدایه‌ها با استفاده از نرم‌افزار MEGA نسخه 6 انجام شد. نتایج: از کل نمونه‌های مورد مطالعه 19 نمونه به عنوان گونههای آئروموناسهای متحرک با استفاده از آزمایش‌های بیوشیمیایی و نیز تولید باند 1200 بازی از ژن موردنظر روی ژل الکتروفور 1% شناسایی شدند. پس از تعیین توالی، این گونه‌ها به عنوان Aeromonas hydrophila و A. veronii biovar veronii تشخیص داده شد. نتیجه‌گیری نهایی: مطالعات فیلوژنتیک نشان داد که سویه‌های آئروموناسهای متحرک مورد مطالعه در دو خوشه و چهار گروه ژنتیکی قرار دارند.
چکیده انگلیسی:
Background: Motile Aeromonas species cause heavy mortalities in carp farms during spring and summer in Iran. Objectives: The aim of this study was to detect phenotypic and genotypic characterization of motile Aeromonas species isolated from diseased carps in some northern and southern provinces of Iran. Methods: A number of 40 samples from 22 fish farms were collected. The identified motile Aeromonas species were sequenced and phylogenetic tree was drawn by MEGA6 using UPGMA analysis. Results: A number of 19 bacterial isolates were identified as motile Aeromonas sp. by biochemical tests, and the DNA segments of 16S rRNA gene of all these strains gave 1200 bp after running on 1% agarose electrophorus gel. Also, the sequencing results showed that the bacterial samples were determined as A. hydrophila and A. veronii biovar veronii. Conclusions: Phylogenetic analysis revealed that motile Aeromonas strains in this study were separated in two clusters and four genogroups with high similarities
خبرنامه
برای ثبت نام در خبرنامه و دریافت خبرنامه ایمیل خود را وارد نمایید.
