Molecular characterization of Rhipicephalus (Boophilus) annulatus from Iran by sequences of cytochrome c oxidase subunit I (COI) and the second internal transcribed spacer (ITS2)
Molecular characterization of Rhipicephalus (Boophilus) annulatus from Iran by sequences of cytochrome c oxidase subunit I (COI) and the second internal transcribed spacer (ITS2)
عنوان فارسی :
Molecular characterization of Rhipicephalus (Boophilus) annulatus from Iran by sequences of cytochrome c oxidase subunit I (COI) and the second internal transcribed spacer (ITS2)
عنوان انگلیسی :
Molecular characterization of Rhipicephalus (Boophilus) annulatus from Iran by sequences of cytochrome c oxidase subunit I (COI) and the second internal transcribed spacer (ITS2)
چکیده:
زمینه مطالعه: به طور معمول، شناسایی کنه ریپیسفالوس (بوافیلوس) آنولاتوس از سایرکنه‌های مشابه با استفاده از ویژگی‌های ریخت شناسی صورت می‌گیرد. با توجه به این که این ویژگی‌ها جهت شناسایی دقیق گونه‌های مختلف کنه‌های ماده و برخی مراحل رشد کنه‌ها (لاروی و نوچه‌ای) به سختی امکان پذیر است لذا روش‌های بیولوژی مولکولی می‌تواند به عنوان روش‌های مکمل تشخیصی مفید واقع شود. هدف: توالی‌های ژن سیتوکروم اکسیداز یک(COI) و دومین ناحیه بین ژنی داخلی رونویسی شده ریبوزوم هسته‌ای (ITS2) جهت ارزیابی روش‌های مولکولی جهت شناسایی و مطالعات ریشه اجدادی کنه ریپیسفالوس (بوافیلوس) آنولاتوس تعیین توالی شدند. روش کار: واکنش زنجیره ایی پلیمراز (PCR) بر روی کنه‌های جدا شده از دو منطقه ایران (گیلان و مازندران) بر مبنای توالی‌های COI وITS2صورت گرفت. نتایج: اندازه توالی‌های COI و ITS2به ترتیب 1539 و 1158 جفت باز بودند. مقایسه توالی‌های ناحیه COI کنه‌های ریپیسفالوس (بوافیلوس) آنولاتوس دو منطقه جغرافیایی با همدیگر3/91٪ مشابهت را نشان داد. توالی اسیدهای آمینه ژن COI کنه‌های مورد بررسی، با یکدیگر 6/98% و با تنها توالی ثبت شده (AGH19677)در بانک ژن 2/98 و 6/99% تشابه داشتند. مقایسه توالی‌های ناحیه ITS2 کنه‌های ریپیسفالوس (بوافیلوس) آنولاتوس با همدیگر 9/99% و با توالی‌های ثبت شده در بانک ژن(KC503267, AF271270, AF271272, JQ412126) 95 تا 99% مشابهت را نشان داد. نتیجه‌گیری نهایی: نتایج حاصل از این تحقیق نشان می‌دهد که COI و ITS2 می‌تواند نشانگر ژنتیکی مناسبی برای تفریق و همچنین تعیین خصوصیات ژنتیکی ریپیسفالوس ( بوافیلوس) آنولاتوس باشد.
چکیده انگلیسی:
Background: Traditionally, morphological features of Rhipicephalus (Boophilus) annulatus from closely-related ticks have been considered for their identification and differentiation. However, it is difficult and requires expertise in order to accurately identify and differentiate engorged female ticks and some developmental stages such as larva and nymph from other similar ticks. Hence, molecular markers may be a suitable alternative. OBJECTIVES: Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene and the second internal transcribed spacer (ITS2) fragments of Rh. (Bo.) annulatus were sequenced to assess the use of molecular techniques for identifications and phylogenetic studies of these ticks. METHODS: Polymerase chain reaction (PCR) technique was performed based on the analyses of COI and ITS2 sequences of ticks collected from two different regions in Iran (Golestan and Mazandaran). RESULTS: The length of COI and ITS2 sequences were 1539 and 1158bp, respectively. The nucleotide similarity of COI gene was 91.3% between the ticks examined from the two different regions. The deduced amino acid sequences from COI showed 98.6% similarity between the ticks studied and showed 98.2 and 99.6% similarity with the only complete sequence of Rh. (Bo.) annulatus (AGH19677) registered in GenBank. The obtained complete nucleotide sequences of ITS2 from Rh. (Bo.) annulatus from Golestan and Mazandaran revealed 99.9% similarity, while the other ticks registered in GenBank 95 to 99% similarity (KC503267, AF271270, AF271272, JQ412126). CONCLUSIONS: It seems that COI and ITS2 sequences could provide suitable genetic markers for discrimination and genetic characterization of Rhipicephalus (Boophilus) annulatus.
خبرنامه
برای ثبت نام در خبرنامه و دریافت خبرنامه ایمیل خود را وارد نمایید.
