چکیده:
تمرکز اصلاحگران بر صفات اقتصادی و افزایش تولید از طریق انتخاب ژنتیکی پیامدهای منفی همچون بروز همخونی را به دنبال خواهد داشت که نتیجۀ آن پسروی ژنتیکی، افزایش ناهنجاریهای ژنتیکی، حساسیت به بیماریها و نهایتاً مرگ و میر خواهد بود. افزایش میزان همخونی در صنعت دامپروری به مسئلهای جدی تبدیل شده است، به گونهای که محاسبه میزان آن، استفاده از نرمافزارهای جدید و ثابت نگاه داشتن میزان همخونی در حد بهینه در جمعیت، از اهمیت ویژهای برخوردار است. با استفاده از اطلاعات شجره، اطلاعات ژنوتیپی حاصل از نشانگرهای مولکولی و اخیراً ابردادههای حاصل از توالییابی نسل آینده و فناوری اسنیپ چیپ، محاسبه همخونی در سطوح مختلف را امکان پذیر ساخته است که هر کدام مزایا و معایب قابل بحث و همچنین ساختار محاسباتی ویژهای دارند. این روشها باعث شده است که محاسبه همخونی دقیقتر و با صحت بالاتری صورت گیرد. پیدایش تکنولوژیهای پیشرفته در ژنتیک مولکولی، منجر به شناسایی جزایر ROH در سطح کل ژنوم گونههای مختلف دامی شده است و به دنبال آن مطالعات گستردهای در علوم دامی در این زمینه صورت گرفته است. با استفاده از این روشها میتوان سهم همخونی با منشأ اجدادی و اطلاعات ژنومیکی حاصل از تلاقیهای صورت گرفته را طبقهبندی کرد. هدف اصلی در این مطالعه بیان مفهوم همخونی و علل بروز آن، اصول محاسباتی، تقسیر و پیشرفتههای اخیر در زمینه محاسبه همخونی از روشهای کلاسیک تا ژنومیک میباشد. ناگفته نماند که دستیابی به میزان همخونی در یک گله، پایان کار از دیدگاه اصلاحنژادی محسوب نمیشود، بلکه براساس ساختار و میزان همخونی در جمعیت، باید راهکارهای علمی و عملی مختلف جهت کاهش و اجتناب از همخونی بیشتر صورت پذیرد. با توجه به روشهای محاسبه همخونی بررسی شده در این مطالعه، روش ROH بهترین و قویترین روش میباشد، زیرا در این روش میتوان قطعات کوچک IBD را در محاسبه همخونی لحاظ کرد. در مقابل در روشهای کلاسیک (شجره)، به دلیل کامل نبودن شجرههای ثبت شده و اشتباهات موجود، دقت محاسبه همخونی پایین میباشد. در منابع مختلف علمی ضریب همبستگی بین FROH و Fp ، 85 -50 درصد گزارش شده است.
چکیده انگلیسی:
The focus of the breeders on economic traits and increased production through genetic selection will have negative consequences such as inbreeding, resulting in genetic recurrence, increased genetic abnormalities, susceptibility to disease and ultimately mortality. Increasing the amount of inbreeding in the livestock industry has become a serious issue, so it is important to calculate the amount, use of new software and keep the inbreeding rate optimum in the population. Using pedigree information, genotypic information from molecular markers and, more recently, metadata from next-generation sequencing and SNP-Chip technology, it has been possible to calculate inbreeding at different levels, each having its own disadvantages and disadvantages as well as its own computational structure. These methods have made the calculation of inbreeding more accurate. Recent advances in molecular genetics have led to the identification of the ROH Islets at the whole genome level of various animal species, followed by extensive studies in the animal sciences. These methods can classify the inbreeding rate of the ancestors and the genomic information obtained from the crosses. The main purpose of this study is to describe the concept of inbreeding and its causes, computational principles, recent advances in computational inference from classical to genomic methods. It goes without saying that achieving inbreeding is not an end of the breed from a eugenics perspective, but rather on the structure and extent of inbreeding in the population, different scientific and practical approaches must be taken to reduce and avoid further inbreeding. According to the inbreeding calculation methods studied in this study, the ROH method is the best and most powerful one because it can be considered small parts of IBD in inbreeding calculation. Conversely, in classical (pedigree) methods, the accuracy of inbreeding calculation is low because of incomplete registered pedigrees and errors. In various scientific sources, the correlation coefficient between FROH and Fp < /sub> is reported to be 50-85%.
خبرنامه
برای ثبت نام در خبرنامه و دریافت خبرنامه ایمیل خود را وارد نمایید.