چکیده:
در این تحقیق، یک پویش ژنومی برای شناسایی جایگاههای مؤثر بر صفات تولیدمثلی در گوسفند بلوچی انجام شد. به این منظور، نمونهبرداری خون از 96 رأس میش همراه با دادههای فنوتیپی مربوط به صفات تولیدمثلی شامل مجموع وزن همزادان متولد شده، میانگین وزن همزادان در تولد، مجموع وزن همزادان شیرگیری شده، میانگین وزن همزادان شیرگیری شده و تعداد برههای زنده در شش ماهگی در چهار نوبت زایش بدست آورده شد. پس از استخراج DNA، نمونهها با استفاده از تراشههایSNP گوسفندی (50K) تعیین ژنوتیپ شدند. تجزیه مطالعه ارتباط ژنومی با استفاده از نرمافزار PLINK در مدلهای رگرسیون خطی و لجستیک شامل اثرات SNPها و عوامل ثابت جنس و نوبت زایش انجام شد. در مجموع، هشت نشانگر معنیدار در سطح کروموزومی روی کروموزومهای 1، 4، 10، 15 و 17 مرتبط با صفات تولیدمثلی مورد مطالعه شناسایی شد (05/0>P). بررسی ژنها و QTLها در این مناطق نیز نشاندهنده وجود ژنها و QTLهای مؤثر بر صفات رشد و تولیدمثلی بود. از نتایج این تحقیق میتوان برای کشف واریانتهای مسبب صفات تولیدمثلی در برنامههای اصلاح نژادی گوسفند استفاده نمود.
چکیده انگلیسی:
Genetic improvement in reproductive and growth traits is major goal in sheep breeding. In this study, we performed a genome wide association study for detection of quantitative trait loci affecting reproductive traits in Baluchi sheep. For this purpose, blood samples were collected from a total of 96 ewes and data on their reproductive traits including total litter weight at birth (TLWB), litter mean weight per lamb born (LMWLB), total litter weight at weaning (TLWW), litter mean weight of lambs at weaned (LMWLW) and number of lambs alive at six months (NLA6m) in four parity. After DNA extraction, samples were genotyped using the Illumina Ovine SNP 50K BeadChip assay. Using PLINK software, a GWA study was performed in linear (GLM) and logistic regression analyses with a model included SNPs effect and sex and number of parities as fixed effects. A total of eight SNPs were found on chromosomes 1, 4, 10, 15 and 17 at the 5% chromosome-wise significance level (P<0.05) for studied reproductive traits. Also, study of genes and QTLs in these regions showed genes and QTLs affecting growth and reproductive traits. The results of this study could be used for discovery of causative variants for reproductive traits in sheep breeding programs.
خبرنامه
برای ثبت نام در خبرنامه و دریافت خبرنامه ایمیل خود را وارد نمایید.
